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公开(公告)号：CN112941151B
公开(公告)日：2022-07-01
申请号：CN202110347759.7
申请日：2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学 , 陕西省农产品质量安全中心
IPC: C12Q1/6809 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及一种利用RNA‑seq技术构建EST‑SSR标记的方法与应用，包括如下步骤：利用RNA‑seq技术，构建RNA‑seq序列文库；将RNA‑seq序列文库中获得的片段进行组装，得到转录本；利用Misa软件对原生地样本转录本进行SSR预测和鉴定，得到SSR位点；设计SSR位点的引物，得到SSR引物对；利用blast软件将SSR引物对分别与入侵地样本转录本和原生地样本转录本进行序列相似比对，得到电子模拟PCR扩增片段，筛选片段大小不一致的标记，为EST‑SSR标记，最后进行PCR实验验证，分析这些标记在紫茎泽兰群体中的遗传多态性。
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公开(公告)号：CN113151535A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110181512.2
申请日：2021-02-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6809 , C12N15/11 , G16B20/30
Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域，涉及一组菊科植物分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法。该叶绿体SSR标记引物为SSR1、SSR2或SSR3中的一种或几种，其获取方法包括：1.检索并获取菊科叶绿体基因组；2.预测并获得鉴定的菊科叶绿体基因组SSR位点，开发SSR标记；3.电子PCR扩增菊科叶绿体SSR标记，并筛选多态性SSR标记；4.验证和获得用于菊科物种分子鉴定的叶绿体SSR标记。该叶绿体SSR标记引物及其获取方法，建立了菊科叶绿体SSR位点的鉴定和多态性分析的方法，提高了多态性SSR标记的筛选效率，减轻了试验工作量、提高了试验效率、节约了成本。
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公开(公告)号：CN119876174A
公开(公告)日：2025-04-25
申请号：CN202510025527.8
申请日：2025-01-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , C12N15/113 , A01H5/00 , A01H5/10 , A01H6/46
Abstract: 本发明提供了一种小麦TabZIP19‑5B基因及其在调控小麦耐盐、抗病毒和千粒重中的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明利用现有的植物基因工程技术，首次克隆得到了调控小麦耐盐、抗病毒和千粒重基因TabZIP19‑5B，并通过农杆菌介导的方法将该基因转入小麦，经比较试验分析证明，本发明过表达TabZIP19‑5B的转基因植株耐盐能力和抗BYDV能力显著提高，并且粒宽大于野生型。本发明提供的TabZIP19‑5B基因在调控耐盐、抗BYDV以及千粒重过程中发挥了重要的作用，能够作为培育耐盐、抗病毒和千粒重作物新品种的重要基因资源。
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公开(公告)号：CN118086326B
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410212687.9
申请日：2024-02-27
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明提供了一种小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因在调控植物开花和抵御干旱、盐胁迫中的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明将小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因连接到pRI101‑35S‑GFP载体中得到重组载体pRI101‑35S‑TaC3H112‑6B‑GFP；将所述重组载体经过农杆菌转化后导入受体植物中，获得TaC3H112‑6B转基因植株，实现小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因的过表达。本发明首次克隆得到了调控植物开花和抵御干旱、盐胁迫的基因TaC3H112‑6B，通过根瘤农杆菌介导的方法将其转入拟南芥，构建的转基因植株相比于野生型提早开花，且抗旱性和耐盐性显著提高。
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公开(公告)号：CN113151535B
公开(公告)日：2022-06-28
申请号：CN202110181512.2
申请日：2021-02-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6809 , C12N15/11 , G16B20/30
Abstract: 本发明属于分子生物学技术领域，涉及一组菊科植物分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法。该叶绿体SSR标记引物为SSR1、SSR2或SSR3中的一种或几种，其获取方法包括：1.检索并获取菊科叶绿体基因组；2.预测并获得鉴定的菊科叶绿体基因组SSR位点，开发SSR标记；3.电子PCR扩增菊科叶绿体SSR标记，并筛选多态性SSR标记；4.验证和获得用于菊科物种分子鉴定的叶绿体SSR标记。该叶绿体SSR标记引物及其获取方法，建立了菊科叶绿体SSR位点的鉴定和多态性分析的方法，提高了多态性SSR标记的筛选效率，减轻了试验工作量、提高了试验效率、节约了成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112941151A
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN202110347759.7
申请日：2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学 , 陕西省农产品质量安全中心
IPC: C12Q1/6809 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及一种利用RNA‑seq技术构建EST‑SSR标记的方法与应用，包括如下步骤：利用RNA‑seq技术，构建RNA‑seq序列文库；将RNA‑seq序列文库中获得的片段进行组装，得到转录本；利用Misa软件对原生地样本转录本进行SSR预测和鉴定，得到SSR位点；设计SSR位点的引物，得到SSR引物对；利用blast软件将SSR引物对分别与入侵地样本转录本和原生地样本转录本进行序列相似比对，得到电子模拟PCR扩增片段，筛选片段大小不一致的标记，为EST‑SSR标记，最后进行PCR实验验证，分析这些标记在紫茎泽兰群体中的遗传多态性。
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公开(公告)号：CN118086326A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410212687.9
申请日：2024-02-27
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明提供了一种小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因在调控植物开花和抵御干旱、盐胁迫中的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明将小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因连接到pRI101‑35S‑GFP载体中得到重组载体pRI101‑35S‑TaC3H112‑6B‑GFP；将所述重组载体经过农杆菌转化后导入受体植物中，获得TaC3H112‑6B转基因植株，实现小麦锌指蛋白TaC3H112‑6B基因的过表达。本发明首次克隆得到了调控植物开花和抵御干旱、盐胁迫的基因TaC3H112‑6B，通过根瘤农杆菌介导的方法将其转入拟南芥，构建的转基因植株相比于野生型提早开花，且抗旱性和耐盐性显著提高。
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公开(公告)号：CN114807410A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202210273846.7
申请日：2022-03-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C40B40/06 , C40B50/06 , G16B20/30 , G16B30/10
Abstract: 本发明属于植物分子标记技术领域，涉及一种大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片通过下述方法获得：1.选取大麦及青稞为种质材料进行重测序，再对测序结果进行质控、与参考基因组映射，鉴定与筛选出SNP位点；2.根据SNP位点的指标，结合位点在染色体上的位置，分析其上下游序列并设计测序引物，挑选能够用于芯片开发的SNP位点；3.运用靶向测序基因分型技术开发该大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片，属于DNA检测用SNP芯片，是基于靶向捕获高通量测序技术开发的包含有40519个SNP标记位点的大麦全基因组液相芯片，为大麦高密度遗传图谱构建、大麦种质鉴定、高通量基因分型、QTL定位、全基因组关联分析等提供重要的工具。
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公开(公告)号：CN106834465A
公开(公告)日：2017-06-13
申请号：CN201710062510.5
申请日：2017-01-22
Applicant: 西北农林科技大学
CPC classification number: C12Q1/6869 , G06F19/22 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种简便、高效且通用的植物叶绿体基因组测序方法，直接采用基因组DNA高通量测序后，利用生物学信息学方法抓取其中的叶绿体reads，然后组装、拼接获得其叶绿体基因组全序列；相比于传统的方法，该方法直接以叶片基因组DNA为模板构建高通量测序文库，大大提高了方法的效率和通用性；不用复杂的PCR产物测序及克隆片段的拼接组装，直接利用高覆盖度测序后得到的reads从头拼装，大大减少了试验步骤，简化了试验流程，简便、快捷且高效。
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