公开(公告)号：CN114807410A

公开(公告)日：2022-07-29

申请号：CN202210273846.7

申请日：2022-03-19

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 聂小军 ,  杨光 ,  魏新雨 ,  宋卫宁 ,  佘奎军 ,  潘文秋 ,  艾琪

IPC: C12Q1/6895 ,  C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明属于植物分子标记技术领域，涉及一种大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片通过下述方法获得：1.选取大麦及青稞为种质材料进行重测序，再对测序结果进行质控、与参考基因组映射，鉴定与筛选出SNP位点；2.根据SNP位点的指标，结合位点在染色体上的位置，分析其上下游序列并设计测序引物，挑选能够用于芯片开发的SNP位点；3.运用靶向测序基因分型技术开发该大麦40K SNP液相芯片。该大麦40K SNP液相芯片，属于DNA检测用SNP芯片，是基于靶向捕获高通量测序技术开发的包含有40519个SNP标记位点的大麦全基因组液相芯片，为大麦高密度遗传图谱构建、大麦种质鉴定、高通量基因分型、QTL定位、全基因组关联分析等提供重要的工具。