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公开(公告)号：CN114182022A
公开(公告)日：2022-03-15
申请号：CN202210110195.X
申请日：2022-01-29
申请人： 福建医科大学孟超肝胆医院(福州市传染病医院) , 西安交通大学
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公布了一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法，是对血液中的基因突变筛选策略，不需要依赖肿瘤组织取样，完全无创性的肿瘤突变检测方案，用于精确性筛选肿瘤来源突变。通过收集肿瘤患者的手术前血液样本与手术后血液样本，分别提取cfDNA进行高通量UMI测序。经过高精度的序列处理与合并后，分别对每个血液样本进行突变检测。鉴定突变后，使用所有体细胞突变在手术前后两个时间点的频率变化对不同类型基因突变进行分群。然后对筛选到的肿瘤来源突变进行整合，筛选出的肿瘤来源特异突变可以进一步用于时间序列样本的肿瘤负荷动态评估。
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公开(公告)号：CN114182022B
公开(公告)日：2024-07-09
申请号：CN202210110195.X
申请日：2022-01-29
申请人： 福建医科大学孟超肝胆医院(福州市传染病医院) , 西安交通大学
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公布了一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法，是对血液中的基因突变筛选策略，不需要依赖肿瘤组织取样，完全无创性的肿瘤突变检测方案，用于精确性筛选肿瘤来源突变。通过收集肿瘤患者的手术前血液样本与手术后血液样本，分别提取cfDNA进行高通量UMI测序。经过高精度的序列处理与合并后，分别对每个血液样本进行突变检测。鉴定突变后，使用所有体细胞突变在手术前后两个时间点的频率变化对不同类型基因突变进行分群。然后对筛选到的肿瘤来源突变进行整合，筛选出的肿瘤来源特异突变可以进一步用于时间序列样本的肿瘤负荷动态评估。
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公开(公告)号：CN102062725B
公开(公告)日：2012-07-04
申请号：CN201010556961.2
申请日：2010-11-24
摘要： 本发明公开了一种馆藏壁画表面颜料特征的无损分析方法，利用无损检测分析技术，包括建立容差球模型对颜色的评估分析(定量分析)、对单位表面积壁画颜料质量统计分析(定量分析)、通过表面显微特征分析(定性分析)、颜料厚度分析(定量分析)，是一种可量化、可操作、可比较和无损伤测量的评估方法。在无损分析检测的基础上，本发明通过对馆藏壁画进行划分区域，综合考虑多种因素选定多个测量点，对壁画保存现状给出科学的结论，为壁画科技保护与修复提供科学依据。本发明进行大量测量数据的统计与分析，对壁画颜料数据库建设和壁画长期保存、保护、修复、展示与管理提供了雄厚的科学检测数据资源。
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公开(公告)号：CN100365013C
公开(公告)日：2008-01-30
申请号：CN200610041952.3
申请日：2006-03-21
申请人： 西安交通大学
IPC分类号： C07K1/14
摘要： 本发明公开了一种古代DNA的提取方法，该方法采用等离子体等处理骨骼样品，使骨骼样品的内表面的有机污染物质被分解，快速清除骨骼样品的表面和内表面污染，然后进行DNA的提取；包括打磨骨骼样品表面，次氯酸处理，紫外照射，70%乙醇洗涤两次，去除外源微生物DNA污染，进一步用Ar/O2(9∶1)离子体处理样品，最后在液氮中研磨成粉末作为提取样品。样品消化裂解后，通过分三步完成的酚氯仿抽提方法去除被消化掉的有机分子，通过采用二氧化硅吸附柱吸附及超滤离心管(3kDa)过滤，得到古代DNA模板。本发明的方法能极快对表面和内表面污染进行有效的清除。显著提高了古代DNA提取成功率及模板含量。
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公开(公告)号：CN116525001A
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202310471659.4
申请日：2023-04-27
申请人： 西安交通大学
IPC分类号： G16B20/30 , G16B15/00 , G16B40/00 , G06F18/214 , G06F18/241 , G06N3/0442 , G06N3/045 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要： 本发明公开了一种基于深度学习的RNA修饰位点预测模型的构建方法，首先在获取RNA的样本序列之后，将序列数据转为为模型能够理解的向量，此过程特殊的引入了RNA序列的二级结构信息。其次，选择将CNN与RNN组合，采用一维卷积层与LSTM层作为模型基本层，引入注意力机制为序列中重要的碱基分配一个较高权重；最后，采用双输入模型，将两种信息同时送入模型，经过后续调整如正则化、超参数的调整确定模型的最终结构。样本序列被划分为训练集、验证集、以及最终用来测试模型性能的测试集；本发明增加了注意力机制来改善LSTM的性能，同时引入序列二级结构信息来提升模型分类的准确性，将一维卷积作为一个motif检测器，提高了模型的可解释性。
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公开(公告)号：CN103740699B
公开(公告)日：2016-04-06
申请号：CN201310675886.5
申请日：2013-12-11
申请人： 西安交通大学
IPC分类号： C12N15/10
摘要： 一种担载SiO2磁珠快速提取古DNA的方法，将处理好的骨骼样品放置在等离子体处理反应器中，对骨骼样品处理，液氮处理骨骼样品，把骨骼样品研磨成粉末，并加入其10倍体积的提取缓冲液振荡；在离心机中吸出上清液浓缩；再加入结合缓冲液和磁珠悬浮液混匀；加入洗涤缓冲液洗涤，取下离心管，加入TE洗脱液离心使磁珠被吸附，将洗脱液移至干净离心管中，即得到古DNA提取溶液；本发明在整个纯化过程不需要离心、不需要加入多种试剂，简化了古DNA提取步骤，缩短了提取时间，操作简单，成本低廉，大大提高了古DNA提取效率，降低了提取成本和对设备的依赖性。
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公开(公告)号：CN102526745B
公开(公告)日：2013-02-27
申请号：CN201210023060.6
申请日：2012-02-02
申请人： 西安交通大学
摘要： 一种用微电场控制溶致液晶担载药物分子的缓释方法，该方法采用脉冲电场对溶致液晶的载药进行控释，利用溶致液晶独特的由双亲分子组成的有序结构对外界物理因素刺激的敏感性和GMO/F127的溶致液晶具有担载不同极性、不同种类药物的优点，根据理论推导出的引起液晶发生弹性形变的电场强度阈值计算阈值电流密度jc＝σE，从而设计并完成了小鼠体内的脉冲可控释放实验，验证了由电场控制溶致液晶包裹药物缓释方法的有效性，本发明的方法能用量化的条件控制药物的释放，显著提高药物的药效和利用率。
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公开(公告)号：CN114891887A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210521515.0
申请日：2022-05-13
申请人： 西安交通大学
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B50/00 , G16B35/20 , G16H50/30 , G06F17/18
摘要： 本发明公开了一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法，运用三阴性乳腺癌的基因表达数据，获取与细胞增殖标志物互作的基因，并借助单因素Cox回归来筛选预后相关基因，本发明利用最小最大凹惩罚的Cox回归方法构建预后风险评估模型，获得了能够预测和评估三阴性乳腺癌风险的预后基因标志物和预后评估方法。本发明中提出了针对高异质性疾病三阴性乳腺癌预后标志物基因识别技术，可在临床上运用推广。
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公开(公告)号：CN113724782A
公开(公告)日：2021-11-30
申请号：CN202110955838.6
申请日：2021-08-19
申请人： 西安交通大学
摘要： 本发明公开了一种基于可变聚腺苷酸化位点的疾病预后标志物筛选方法。本发明主要基于逐步回归模型和最小最大凹惩罚的Cox回归模型，从转录组测序数据中识别预后相关APA特征，筛选稳定的预后风险相关标志基因组，提供预后风险得分计算公式，基于数据辅助预测临床患者预后。本发明提供了构建应用于临床患者分层指标的新思路，在已有数据的实施和验证中表现出较高的准确性，并可以简便的推广到任意数据集。
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公开(公告)号：CN102175628A
公开(公告)日：2011-09-07
申请号：CN201110059094.6
申请日：2011-03-11
摘要： 本发明公开了秦汉陶俑彩绘表面颜料特征的无损分析方法，利用无损检测分析技术，包括建立容差球模型对颜色的评估分析(定量分析)、对单位表面积陶俑颜料质量统计分析(定量分析)、通过表面显微特征分析(定性分析)、颜料厚度分析(定量分析)，是一种可量化、可操作、可比较和无损伤测量的评估方法。在无损分析检测的基础上，本发明通过对秦汉陶俑进行划分区域，综合考虑多种因素选定多个测量点，对陶俑保存现状给出科学的结论，为陶俑科技保护与修复提供科学依据。本发明进行大量测量数据的统计与分析，对陶俑颜料数据库建设和陶俑长期保存、保护、修复、展示与管理提供了雄厚的科学检测数据资源。
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