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公开(公告)号:CN119626575A
公开(公告)日:2025-03-14
申请号:CN202510162109.3
申请日:2025-02-14
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本申请公开了一种脑卒中空间知识图谱数据库的构建方法、装置、设备及介质,涉及大数据分析技术领域。本申请利用通义千问2.1模型深入挖掘和分析公开可获取的论文,识别和标注与缺血性脑卒的基因、生理区域、病理区域的空间分布情况,并以脑卒中空间知识图谱数据库的形式进行展示,本申请利用通义千问2.1模型的自然语言处理能力,从文献中自动提取基因及其空间分布信息,并构建了动态更新的知识图谱,解决了现有技术中脑卒中空间异质性研究的数据整合效率低、标注准确性不足及动态关联不足等问题。
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公开(公告)号:CN119875809A
公开(公告)日:2025-04-25
申请号:CN202510028510.8
申请日:2025-01-08
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
IPC: C12M1/34 , C12M1/42 , C12M1/00 , C12Q1/6874 , C12Q1/6806 , B01L3/00
Abstract: 本发明公开了一种高分辨率高通量位置信息的空间转录组微流控芯片及制备方法。所述空间转录组微流控芯片包括微坑阵列层、空间条形码X编码层、空间条形码Y编码层、空间条形码Z编码层,利用所述空间转录组微流控芯片采用简单的操作步骤即可将X、Y、Z三个维度上各100种编码序列依次连接构成100万种空间条形码信息,用于记录100万个微坑对应的位置信息,其分辨率达到10μm及以下,点阵数量达到百万级水平,在基于空间条形码的空间转录组测序中具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN119709951A
公开(公告)日:2025-03-28
申请号:CN202510221432.3
申请日:2025-02-27
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6888 , C12Q1/6883 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种基于激光显微切割系统和DNA条形码标记的空间转录组高通量测序方法及其应用,具体属于基因测序技术领域。本发明所述空间转录组高通量测序方法,包括以下步骤:两步法合成DNA空间条形码;将DNA空间条形码和细胞裂解液与单细胞混合,裂解,捕获mRNA,逆转录,PCR扩增,得到cDNA;进行cDNA文库构建,测序,对测序结果进行处理,并进行空间转录组数据分析。本发明所述空间转录组高通量测序方法具有较高的细胞通量,能获得单细胞空间分辨率。
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公开(公告)号:CN118658535A
公开(公告)日:2024-09-17
申请号:CN202411133882.9
申请日:2024-08-19
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法,涉及空间转录组信息展示领域,其技术方案要点是获取脑组织,确定脑组织的脑区分布并切片;通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序,并构建数据库,所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息;构建与数据库链接的检索页面,通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索,便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱,数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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公开(公告)号:CN118658535B
公开(公告)日:2024-11-01
申请号:CN202411133882.9
申请日:2024-08-19
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法,涉及空间转录组信息展示领域,其技术方案要点是获取脑组织,确定脑组织的脑区分布并切片;通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序,并构建数据库,所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息;构建与数据库链接的检索页面,通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索,便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱,数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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