基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法

    公开(公告)号:CN118658535A

    公开(公告)日:2024-09-17

    申请号:CN202411133882.9

    申请日:2024-08-19

    Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法,涉及空间转录组信息展示领域,其技术方案要点是获取脑组织,确定脑组织的脑区分布并切片;通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序,并构建数据库,所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息;构建与数据库链接的检索页面,通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索,便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱,数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。

    基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法

    公开(公告)号:CN118658535B

    公开(公告)日:2024-11-01

    申请号:CN202411133882.9

    申请日:2024-08-19

    Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法,涉及空间转录组信息展示领域,其技术方案要点是获取脑组织,确定脑组织的脑区分布并切片;通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序,并构建数据库,所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息;构建与数据库链接的检索页面,通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索,便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱,数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。

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