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公开(公告)号：CN118658535B
公开(公告)日：2024-11-01
申请号：CN202411133882.9
申请日：2024-08-19
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法，涉及空间转录组信息展示领域，其技术方案要点是获取脑组织，确定脑组织的脑区分布并切片；通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序，并构建数据库，所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息；构建与数据库链接的检索页面，通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索，便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱，数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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公开(公告)号：CN117079726A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202311332719.0
申请日：2023-10-16
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明涉及单细胞数据整合的领域，尤其是涉及一种基于单细胞的数据库可视化方法及相关设备，其包括建立数据库，存储收集的用于疾病治疗的潜在药物信息、蛋白和RNA层面的基因相互作用信息，以及包含单细胞层面的疾病研究的数据集；基于药物信息、基因相互作用信息以及数据集，整理成关系型数据表并存储在数据库内；获取输入的基因和药物列表，在数据库中检索，返回与基因和药物列表匹配的结果集；基于结果集，绘制包括聚类图、表达图谱或小提琴图的关系图形，并输出。本发明具有将单细胞研究数据与其他研究数据进行更好的整合，使得单细胞研究数据的访问更加直接的效果。
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公开(公告)号：CN118658535A
公开(公告)日：2024-09-17
申请号：CN202411133882.9
申请日：2024-08-19
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法，涉及空间转录组信息展示领域，其技术方案要点是获取脑组织，确定脑组织的脑区分布并切片；通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序，并构建数据库，所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息；构建与数据库链接的检索页面，通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索，便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱，数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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公开(公告)号：CN117079726B
公开(公告)日：2024-01-30
申请号：CN202311332719.0
申请日：2023-10-16
Applicant: 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
Abstract: 本发明涉及单细胞数据整合的领域，尤其是涉及一种基于单细胞的数据库可视化方法及相关设备，其包括建立数据库，存储收集的用于疾病治疗的潜在药物信息、蛋白和RNA层面的基因相互作用信息，以及包含单细胞层面的疾病研究的数据集；基于药物信息、基因相互作用信息以及数据集，整理成关系型数据表并存储在数据库内；获取输入的基因和药物列表，在数据库中检索，返回与基因和药物列表匹配的结果集；基于结果集，绘制包括聚类图、表达图谱或小提琴图的关系图形，并输出。本发明具有将单细胞研究数据与其他研究数据进行更好的整合，使得单细胞研究数据的访问更加直接的效果。(56)对比文件郑淮予.单细胞相关技术趋势分析算法研究《.中国优秀硕士学位论文全文数据库 基础科学辑》.2022,第2022年卷(第1期),A006-395.Xue-juan Li 等.CancerSCEM: a databaseof single-cell expression map acrossvarious human cancers《.2013 IEEEInternational Conference onBioinformatics and Biomedicine》.2022,第50卷(第D1期),D1147–D1155.郑光敏 等.单细胞测序数据的智能解析与数据库《.发育医学电子杂志》.2020,第8卷(第1期),8-14.
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