公开(公告)号：CN109698029A

公开(公告)日：2019-04-30

申请号：CN201811580662.5

申请日：2018-12-24

Applicant: 桂林电子科技大学

Inventor： 樊永显 ,  朱庆祺 ,  张向文 ,  张龙

IPC: G16H50/80 ,  G16B20/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开一种基于网络模型的circRNA-疾病关联预测方法，其特征在于，包括如下步骤：1）获取circRNA-疾病关联数据集，构建关于circRNA-疾病关联的邻接矩阵A；2）构建circRNA高斯相互作用属性核相似性矩阵KC；3）构建疾病高斯相互作用属性核相似性矩阵KD；4）依据网络一致性投影模型对circRNA-疾病关联预测。这种方法成本低、能提高circRNA-疾病关联预测精度。

公开(公告)号：CN110415765A

公开(公告)日：2019-11-05

申请号：CN201910688416.X

申请日：2019-07-29

Applicant: 桂林电子科技大学

Inventor： 樊永显 ,  陈梅君 ,  朱庆祺 ,  徐海波 ,  崔娟

IPC: G16B20/00 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明公开了一种长链非编码RNA亚细胞定位的预测方法，包括如下步骤：1）特征提取；2）选取特征子集及特征参数；3）提取最优特征集；4）用逻辑回归作为预测模型对最优特征集进行预测，从而实现对长链非编码RNA亚细胞的定位预测。这种方法预测速度快、预测准确率高。

公开(公告)号：CN111489787A

公开(公告)日：2020-08-04

申请号：CN202010317611.4

申请日：2020-04-21

Applicant: 桂林电子科技大学

Inventor： 樊永显 ,  徐海波 ,  朱庆祺 ,  崔娟

IPC: G16B15/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种CRISPR/Cas9靶向敲除定点DNA效率的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：1）构建数据集；2）对序列进行编码；3）采用卷积神经网络进行特征提取；4）构建XGBoost预测器得到结果。这种方法预测速度快、精度高。

公开(公告)号：CN111489787B

公开(公告)日：2023-05-12

申请号：CN202010317611.4

申请日：2020-04-21

Applicant: 桂林电子科技大学

Inventor： 樊永显 ,  徐海波 ,  朱庆祺 ,  崔娟

IPC: G16B15/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种CRISPR/Cas9靶向敲除定点DNA效率的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：1）构建数据集；2）对序列进行编码；3）采用卷积神经网络进行特征提取；4）构建XGBoost预测器得到结果。这种方法预测速度快、精度高。

公开(公告)号：CN109935332A

公开(公告)日：2019-06-25

申请号：CN201910158307.7

申请日：2019-03-01

Applicant: 桂林电子科技大学

Inventor： 樊永显 ,  朱庆祺 ,  张向文 ,  张龙

IPC: G16H50/50 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明公开一种基于双随机游走模型的miRNA-疾病关联预测方法，其特征在于，包括如下步骤：1）获取已知miRNA-疾病关联数据集，构建关于miRNA-疾病关联的邻接矩阵；2）分别构建miRNA和疾病的高斯相互作用属性核相似性矩阵；3）构建miRNA功能相似性矩阵以及疾病语义相似性矩阵；4）使用相似网络融合算法整合疾病和miRNA的相似性；5）依据双随机游走模型来预测miRNA-疾病关联关系。这种方法成本低、耗时短，比现有的方法预测精度高。