耳聋相关基因SNP检测用的引物系统、检测方法和应用

    公开(公告)号:CN107345254A

    公开(公告)日:2017-11-14

    申请号:CN201710686794.5

    申请日:2017-08-11

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    CPC分类号: C12Q1/6883 C12Q2600/156

    摘要: 本发明公开了一种耳聋相关基因SNP检测用的引物系统、检测方法和应用。该耳引物系统包括17组引物组合中的至少一组,且每组引物组合包括PCR扩增引物对及与该PCR扩增引物对对应的测序引物。利用本发明的耳聋相关基因SNP检测用的引物系统可广泛用于遗传性耳聋的基因突变情况的检测分析过程中,尤其是中国遗传性非综合征型耳聋人群,有助于及早发现携带耳聋基因突变的患儿,为后期的诊断及治疗提供科学依据。该引物系统可以各组引物分开使用以检测单一SNP位点的突变情况,也可以组合使用以同时检测多个SNP位点的突变情况,并且上述引物系统在组合使用时,各组之间不存在相互干扰,可以一次性同时检测多个SNP位点,检测通量高、速度快。

    RNA水平融合基因突变导致肿瘤的负荷分析系统和方法

    公开(公告)号:CN111583992B

    公开(公告)日:2023-08-29

    申请号:CN202010393123.1

    申请日:2020-05-11

    IPC分类号: G16B5/00 G16B40/00 G16H50/50

    摘要: 本发明涉及一种RNA水平融合基因突变导致肿瘤的负荷分析系统和方法,属于基因检测技术领域。该肿瘤负荷分析系统,包括:数据获取模块:用于获取样本基因检测得到的下机数据;生信分析模块:用于分别计算目标融合基因拷贝数和内参基因拷贝数;负荷分析模块:用于将上述目标融合基因拷贝数A和内参基因拷贝数B,代入肿瘤负荷方程计算得到该样本的肿瘤负荷Z。该肿瘤负荷分析系统可以量化肿瘤基因的基因表达量,提示某样本中携带该肿瘤基因变异的肿瘤细胞含量,从而提供疗效监测、肿瘤负荷和预后评估等,实现肿瘤精准医疗。