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公开(公告)号：CN113512601B
公开(公告)日：2023-10-20
申请号：CN202110742533.7
申请日：2021-06-30
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor： 吴清平 , 周宝青 , 叶青华 , 柏建玲 , 李凡 , 尚玉婷 , 相欣然 , 王楚芳 , 张菊梅 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 王涓 , 吴诗 , 曾海燕 , 蔡淑珍 , 万强
Abstract: 本发明提供了用于筛查变形杆菌属的分子靶标，所述分子靶标为4段核苷酸片段，所述核苷酸片段的序列如SEQ ID NO：1～4所示，还提供了用于检测所述分子靶标的引物组，以及对应的PCR检测方法。本发明的检测方法可检测到更多的变形杆菌，变形杆菌属覆盖率更大，增强了实用性；本发明的检测方法针对变形杆菌检测具有操作简单、结果判定易、检测时间短、特异性强、成本低、稳定性好的优点。
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公开(公告)号：CN113373249A
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202110742534.1
申请日：2021-06-30
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor： 吴清平 , 周宝青 , 叶青华 , 刘振杰 , 李凡 , 尚玉婷 , 相欣然 , 王楚芳 , 张菊梅 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 王涓 , 吴诗 , 曾海燕 , 蔡淑珍 , 万强
Abstract: 本发明提供了用于筛查黄杆菌属的分子靶标，所述分子靶标为核苷酸片段，所述核苷酸片段的序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了用于检测所述分子靶标的一对引物，以及对应的PCR检测方法。本发明的检测方法可检测到更多的黄杆菌属，覆盖率更大，增强了实用性；本发明的检测方法针对黄杆菌检测具有操作简单、结果判定易、检测时间短、特异性强、成本低、稳定性好的优点。
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公开(公告)号：CN113373249B
公开(公告)日：2022-05-20
申请号：CN202110742534.1
申请日：2021-06-30
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor： 吴清平 , 周宝青 , 叶青华 , 刘振杰 , 李凡 , 尚玉婷 , 相欣然 , 王楚芳 , 张菊梅 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 王涓 , 吴诗 , 曾海燕 , 蔡淑珍 , 万强
Abstract: 本发明提供了用于筛查黄杆菌属的分子靶标，所述分子靶标为核苷酸片段，所述核苷酸片段的序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了用于检测所述分子靶标的一对引物，以及对应的PCR检测方法。本发明的检测方法可检测到更多的黄杆菌属，覆盖率更大，增强了实用性；本发明的检测方法针对黄杆菌检测具有操作简单、结果判定易、检测时间短、特异性强、成本低、稳定性好的优点。
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公开(公告)号：CN113512601A
公开(公告)日：2021-10-19
申请号：CN202110742533.7
申请日：2021-06-30
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor： 吴清平 , 周宝青 , 叶青华 , 柏建玲 , 李凡 , 尚玉婷 , 相欣然 , 王楚芳 , 张菊梅 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 王涓 , 吴诗 , 曾海燕 , 蔡淑珍 , 万强
Abstract: 本发明提供了用于筛查变形杆菌属的分子靶标，所述分子靶标为4段核苷酸片段，所述核苷酸片段的序列如SEQ ID NO：1～4所示，还提供了用于检测所述分子靶标的引物组，以及对应的PCR检测方法。本发明的检测方法可检测到更多的变形杆菌，变形杆菌属覆盖率更大，增强了实用性；本发明的检测方法针对变形杆菌检测具有操作简单、结果判定易、检测时间短、特异性强、成本低、稳定性好的优点。
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公开(公告)号：CN118621042A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410640326.4
申请日：2024-05-22
Applicant: 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的分子靶标及其应用。所述分子靶标如SEQ ID NO.1‑5所示。本发明通过对已有的菌株分类信息进行真实性确证分析，对炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出了高度保守且特异的靶标序列SEQ ID NO.1‑5，并利用本组实验菌株进行验证和筛选，包括引物设计和筛选，分别以炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a荧光法实验，实现对5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的准确鉴别。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113637644B
公开(公告)日：2023-01-24
申请号：CN202110275673.8
申请日：2021-03-15
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
IPC: C12N7/00 , A23L3/3571
Abstract: 本发明提供了一种沙门氏菌噬菌体，所述噬菌体为沙门氏菌噬菌体vB_SalP_TR2，其保藏编号为：GDMCC No:61403‑B1，所述噬菌体属于短尾噬菌体，呈多面体的头部和短尾结构，头部长61.5～62.5nm，宽59～61nm，尾部长34～36nm。本发明中的噬菌体在pH2～11范围和温度4～80℃条件下具有良好的稳定性，不携带任何毒力或抗生素耐药基因，可以安全地运用于食品沙门氏菌的防控。
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公开(公告)号：CN118707014A
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202410620989.X
申请日：2024-05-20
Applicant: 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种机器学习辅助非靶向代谢组学筛选抑制呕吐毒素合成的特征代谢物的方法。本发明从机器学习辅助非靶向代谢组学筛选生物标记物的角度出发，利用随机森林和神经网络的组合模型，克服了深度学习“黑箱”问题，在五折交叉验证中，选取平均分类准确率最高的模型，识别在分类最重要特征排序前12并重复出现四次以上的代谢物。然后通过代谢通路富集分析，锁定能够通路中的关键代谢物，缩小生物标志物范围。最后外源添加验证，筛选能够抑制呕吐毒素合成的代谢物。本发明技术可应用于食品工业、养殖业、以及临床上致病微生物及其毒素的高效识别与防控。
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公开(公告)号：CN118360422A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410640347.6
申请日：2024-05-22
Applicant: 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型SNP分子靶标及其应用。本发明收集蜡样芽孢杆菌族群菌株基因组，对已有菌株分类信息进行真实性确证分析，对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出在非编码区高度保守且存在SNP差异的可区分靶标序列NC‑2和ANN，并利用本组实验菌株进行验证和筛选区分蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型分子靶标。包括NC‑2和ANN的引物设计，引物对的筛选，分别以蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a实验，实现对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的准确鉴别。
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公开(公告)号：CN113637644A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202110275673.8
申请日：2021-03-15
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
IPC: C12N7/00 , A23L3/3571
Abstract: 本发明提供了一种沙门氏菌噬菌体，所述噬菌体为沙门氏菌噬菌体vB_SalP_TR2，其保藏编号为：GDMCC No:61403‑B1，所述噬菌体属于短尾噬菌体，呈多面体的头部和短尾结构，头部长61.5～62.5nm，宽59～61nm，尾部长34～36nm。本发明中的噬菌体在pH2～11范围和温度4～80℃条件下具有良好的稳定性，不携带任何毒力或抗生素耐药基因，可以安全地运用于食品沙门氏菌的防控。
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公开(公告)号：CN118366543A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410640312.2
申请日：2024-05-22
Applicant: 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法。包括原始cgcMLST特征基因组集的构建、获取有效cgcMLST特征基因、获取有效cgcMLST特征基因组合、获取细菌样本全基因组信息、评价基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法的分辨率。本发明相比现有技术实现具有以下特点：实现对蜡样芽孢杆菌类群cgcMLST分辨率的评估，验证cgcMLST能对蜡样芽孢杆菌类群有效分型，解决现有MLST对亲缘关系近的蜡样芽孢杆菌类群菌株分型较差的问题。在分析198个实际样品时，较rMLST效率提升约99.17％，能够更有效的鉴定蜡样芽孢杆菌类群菌株，对食品安全和公共卫生工作至关重要。
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