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公开(公告)号：CN118360422A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410640347.6
申请日：2024-05-22
申请人： 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
摘要： 本发明公开了一种快速鉴定蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型SNP分子靶标及其应用。本发明收集蜡样芽孢杆菌族群菌株基因组，对已有菌株分类信息进行真实性确证分析，对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出在非编码区高度保守且存在SNP差异的可区分靶标序列NC‑2和ANN，并利用本组实验菌株进行验证和筛选区分蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型分子靶标。包括NC‑2和ANN的引物设计，引物对的筛选，分别以蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a实验，实现对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的准确鉴别。
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公开(公告)号：CN118621042A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410640326.4
申请日：2024-05-22
申请人： 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
摘要： 本发明公开了一种快速鉴定5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的分子靶标及其应用。所述分子靶标如SEQ ID NO.1‑5所示。本发明通过对已有的菌株分类信息进行真实性确证分析，对炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出了高度保守且特异的靶标序列SEQ ID NO.1‑5，并利用本组实验菌株进行验证和筛选，包括引物设计和筛选，分别以炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a荧光法实验，实现对5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的准确鉴别。
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公开(公告)号：CN118366543A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410640312.2
申请日：2024-05-22
申请人： 暨南大学 , 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
摘要： 本发明公开了一种基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法。包括原始cgcMLST特征基因组集的构建、获取有效cgcMLST特征基因、获取有效cgcMLST特征基因组合、获取细菌样本全基因组信息、评价基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法的分辨率。本发明相比现有技术实现具有以下特点：实现对蜡样芽孢杆菌类群cgcMLST分辨率的评估，验证cgcMLST能对蜡样芽孢杆菌类群有效分型，解决现有MLST对亲缘关系近的蜡样芽孢杆菌类群菌株分型较差的问题。在分析198个实际样品时，较rMLST效率提升约99.17％，能够更有效的鉴定蜡样芽孢杆菌类群菌株，对食品安全和公共卫生工作至关重要。
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公开(公告)号：CN118374614A
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202410462119.4
申请日：2024-04-17
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明公开了用于检测空肠弯曲菌的种特异性分子靶标yclQ、crRNA、CRISPR/Cas12a体系、检测方法及试剂盒。所述靶标yclQ的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，本发明基于该靶标yclQ开发了3种空肠弯曲菌的检测试剂盒，分别为基于RAA/PCR‑CRISPR/Cas12a系统的试剂盒、嵌合荧光法qPCR检测试剂盒和探针法qPCR检测试剂盒，利用上述3种试剂盒对空肠弯曲菌进行检测均能获得高的检测灵敏度，其中第1种试剂盒的检测灵敏度为5.3×100CFU/g，后2种试剂盒的检测DNA的灵敏度达到aM级别。本发明检测方法具有特异性强，灵敏度高，检出速度快等特点，可以应用于食品安全领域。
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