一种大白菜根肿病根际细菌群落的鉴定方法

    公开(公告)号:CN116240299A

    公开(公告)日:2023-06-09

    申请号:CN202211725200.4

    申请日:2022-12-25

    Abstract: 本发明公开了一种大白菜根肿病根际细菌群落的鉴定方法,所述方法包括以下步骤:S1、样品采集;S2、土壤指标测定:对土壤样品进行pH值、水溶性盐、有机质、土壤全氮、土壤碱解氮、土壤全磷、土壤有效磷、土壤全钾、土壤速效钾、土壤微生物量碳氮磷等指标进行测定;S3、DNA的分离;S4、DNA测序:根据标准方法,在Illumina Miseq平台上执行Illumina Miseq双末端测序过程,原始数据使用Trimmomatic进行质量控制,同时使用FLASH进行序列合并,序列数据上传于NCBI中;S5、统计分析:所得数据用平均值±标准差表示,并用SPSS 20.0软件进行数据分析。本发明借助高通量测序技术,通过鉴定根肿病感染土壤的微生物组成,揭示了与根肿病发生相关的土壤微生物群落的组成和结构,可用于预测根肿病的发生,并为其生物防治开发潜在的工程菌提供数据支撑。

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