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公开(公告)号：CN104560951A
公开(公告)日：2015-04-29
申请号：CN201410724663.8
申请日：2014-12-03
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院 , 复旦大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种宏基因组DNA的提取方法。该方法包括：取待测样品与裂解液混合后，经溶菌酶溶液处理、震荡破壁、蛋白酶K处理后，经NaCl处理、异丙醇处理、乙醇洗涤，即得；本发明通过在提取前加入裂解液和溶菌酶，并调节提取条件，使微生物细胞壁更易破碎，DNA分子更多的溶出，从而保证了提取所得DNA的丰度、片段完整性和纯度，且操作简单，成本较低。实验表明，采用本发明提供的方法提取唾液宏基因组DNA或对细菌、真菌的总DNA进行提取，与现有试剂盒相比，所得产物经PCR后电泳条带更加清晰，特别是对唾液样本的提取，所得产物经PCR后电泳条带较用现有试剂盒提取的结果更加清晰，明亮，完整。
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公开(公告)号：CN118412128A
公开(公告)日：2024-07-30
申请号：CN202410586331.1
申请日：2024-05-11
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院 , 复旦大学 , 江苏鹍远生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请公开了多肿瘤早期筛查预测模型构建方法、装置、设备及介质，涉及生物模型技术领域，包括：获取预设时间段内同一目标人群队列的在不同时刻下对应的队列信息；目标人群队列为人群成员在队列开始时无肿瘤发病的健康人群成员构建的队列；队列信息包括人群成员表征与各肿瘤关联的生理生化指标信息；检测队列信息中用于输入初始多肿瘤早期筛查预测模型的随访时间变量是否为空值；若检测结果不是空值，则启动纵向初始多肿瘤早期筛查预测模型的模型训练过程，以利用执行插补操作后队列信息及对应的时刻对纵向初始多肿瘤早期筛查预测模型进行模型训练，以得到训练后的目标纵向多肿瘤早期筛查预测模型。
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公开(公告)号：CN109971843B
公开(公告)日：2022-11-11
申请号：CN201711447883.0
申请日：2017-12-27
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种单细胞转录组的测序方法。本发明使用了PAP/PGP在RNA链的尾部加入多聚A/G，使RNA稳定性增加，同时产一条可以用于逆转录和cDNA合成的延伸链。本发明在下游进行有效RNA富集时，采用标记核糖体DNA探针的磁珠纯化小片段PCR非特异性产物，使用半退火夹板杂交，去除5s，5.8s，18s和28s大小的cDNA形式存在的rRNA，并在测序时减少大量无效的Reads数。本发明可以对单个真核细胞进行一站式non‑coding RNA、microRNA和mRNA的总转录组测序并产生该转录组的表达矩阵，摆脱了一个细胞只能进行一种测序的应用局限。
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公开(公告)号：CN109738630A
公开(公告)日：2019-05-10
申请号：CN201910032544.9
申请日：2019-01-14
Applicant: 复旦大学附属华山医院
IPC: G01N33/532 , G01N33/543 , G01N33/558
Abstract: 本发明涉及一种高灵敏的磁珠分选联合胶体金标记的外泌体免疫电镜方法，具体包括以下步骤：(1)制备生物素化的抗体；(2)纯化目标亚型外泌体；(3)免疫标记。与现有技术相比，本发明克服了目前免疫电镜技术检测外泌体时纯度低、效率低的弊端，保留了其分辨率高的优势，适合检测位于生物医学标本来源外泌体的微量抗原的检测，阳性信号得率高，便于判断。
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公开(公告)号：CN110111841A
公开(公告)日：2019-08-09
申请号：CN201810010227.2
申请日：2018-01-05
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院
IPC: G16B25/00 , G16B5/00 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6883
Abstract: 本发明提供了一套基于宏基因组测序的动脉粥样硬化早期识别模型构建技术。本发明采用国际先进的Illumina NovaSeq平台，对人的粪便和口腔菌群宏基因组DNA采用Nextera转座子鸟枪宏基因组测序技术，配合传统的高通量测序，并产生宏基因组数据。进而运用数据库和系统等进行宏基因组测序数据分析。通过对数据进行训练集和验证机矫正，并配合机器学习和神经网络算法，产生可靠的早期动脉粥样硬化识别模型，并通过扩大宏基因组生物标志物进行验证。本发明基于较大规模的系统性队列研究，通过队列将病程变化和菌谱进行关联性分析，从而对早期标记物进行判断，在预防医学领域提供了更具价值的系统性研究方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109913417A
公开(公告)日：2019-06-21
申请号：CN201811635494.5
申请日：2018-12-29
Applicant: 复旦大学附属华山医院
IPC: C12N5/079
Abstract: 本发明涉及一种采用快速免疫磁珠法分离脑脊液中不同细胞来源外泌体亚型的方法，具体步骤包括：(1)对脑脊液进行预处理；(2)加入PE标记的一抗进行分选；(3)加入免疫磁珠；(4)增加磁场，进行分离。与现有技术相比，本发明精准分离中枢神经系统不同细胞来源的外泌体亚群，可供针对性的对中枢疾病以及不同靶细胞外泌体深入研究。
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公开(公告)号：CN109738630B
公开(公告)日：2023-08-22
申请号：CN201910032544.9
申请日：2019-01-14
Applicant: 复旦大学附属华山医院
IPC: G01N33/532 , G01N33/543 , G01N33/558
Abstract: 本发明涉及一种高灵敏的磁珠分选联合胶体金标记的外泌体免疫电镜方法，具体包括以下步骤：(1)制备生物素化的抗体；(2)纯化目标亚型外泌体；(3)免疫标记。与现有技术相比，本发明克服了目前免疫电镜技术检测外泌体时纯度低、效率低的弊端，保留了其分辨率高的优势，适合检测位于生物医学标本来源外泌体的微量抗原的检测，阳性信号得率高，便于判断。
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公开(公告)号：CN109897822B
公开(公告)日：2023-04-04
申请号：CN201711309755.X
申请日：2017-12-11
Applicant: 复旦大学
IPC: C12N5/0781 , C12N15/11 , C12R1/91
Abstract: 本发明提供了一组人永生化B淋巴细胞系的建立和应用，具体地，本发明将4株具有亲缘关系的永生化淋巴细胞系组合用作对检测平台进行准确性评判的标准物产品，并且将4株具有亲缘关系的永生化淋巴细胞系用作表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢物组的标准物产品时，可形成内在的量值差异梯度，用于评价组学检测的灵敏度。
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公开(公告)号：CN110111841B
公开(公告)日：2023-03-10
申请号：CN201810010227.2
申请日：2018-01-05
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院
IPC: G16B25/00 , G16B5/00 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6883
Abstract: 本发明提供了一套基于宏基因组测序的动脉粥样硬化早期识别模型构建技术。本发明采用国际先进的Illumina NovaSeq平台，对人的粪便和口腔菌群宏基因组DNA采用Nextera转座子鸟枪宏基因组测序技术，配合传统的高通量测序，并产生宏基因组数据。进而运用数据库和系统等进行宏基因组测序数据分析。通过对数据进行训练集和验证机矫正，并配合机器学习和神经网络算法，产生可靠的早期动脉粥样硬化识别模型，并通过扩大宏基因组生物标志物进行验证。本发明基于较大规模的系统性队列研究，通过队列将病程变化和菌谱进行关联性分析，从而对早期标记物进行判断，在预防医学领域提供了更具价值的系统性研究方法。
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公开(公告)号：CN109971843A
公开(公告)日：2019-07-05
申请号：CN201711447883.0
申请日：2017-12-27
Applicant: 复旦大学泰州健康科学研究院
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种单细胞转录组的测序方法。本发明使用了PAP/PGP在RNA链的尾部加入多聚A/G，使RNA稳定性增加，同时产一条可以用于逆转录和cDNA合成的延伸链。本发明在下游进行有效RNA富集时，采用标记核糖体DNA探针的磁珠纯化小片段PCR非特异性产物，使用半退火夹板杂交，去除5s，5.8s，18s和28s大小的cDNA形式存在的rRNA，并在测序时减少大量无效的Reads数。本发明可以对单个真核细胞进行一站式non‑coding RNA、microRNA和mRNA的总转录组测序并产生该转录组的表达矩阵，摆脱了一个细胞只能进行一种测序的应用局限。
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