公开(公告)号：CN119785871A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411973780.8

申请日：2024-12-30

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 姜涛 ,  于宏扬 ,  刘亚东

IPC: G16B5/00

Abstract: 本发明属于生物信息学领域，尤其涉及一种基于图压缩的个体基因组模拟数据生成方法。本发明目的是解决现有的个体基因组仿真数据用于预测药物对不同个体的疗效时精准性低的问题。提供了一种基于图压缩的个体基因组模拟数据生成方法，包括：S1：获取历史基因组数据集；S2：对历史基因组数据集中的图基因组数据进行预处理，得到预处理后的图基因组数据；S3：计算预处理后的图基因组数据中节点的联通度，根据节点的联通度对预处理后的图基因组数据进行前向压缩处理，得到前向压缩后的图基因组数据；S4：根据前向压缩后的图基因组数据生成个体基因组模拟数据。解决了现有的个体基因组仿真数据用于预测药物对不同个体的疗效时精准性低的问题。

公开(公告)号：CN119785884A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411982659.1

申请日：2024-12-31

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 姜涛 ,  于宏扬 ,  刘亚东 ,  王亚东

IPC: G16B30/00 ,  G16B20/00 ,  G16B40/00 ,  G06F7/58 ,  G06N5/01

Abstract: 一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法，涉及基因工程技术领域，针对现有单倍体建模效率低的问题，本申请通过核心序列机制以及滑动窗口机制，旨在尽可能地确保人类基因组中“必须基因”的存在，并且本申请将泛基因组划分为多个核心窗口使单个窗口成为相对独立个体后的并行，实现支持高度并行化的建模，在确保真实性建模的基础上提高了建模效率。