公开(公告)号：CN105463090A

公开(公告)日：2016-04-06

申请号：CN201510967007.5

申请日：2015-12-21

Applicant: 同济大学

Inventor： 刘桂芬 ,  张勇 ,  陈韵如 ,  胡圣恩 ,  曾诗扬 ,  陈晓兰

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/10

CPC classification number: C12Q1/6888 ,  C12N15/1003 ,  C12N2330/31 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明涉及应用于斑马鱼胚胎的先加标签的染色质免疫共沉淀高通量测序(iChIP-seq)实验方法，首先斑马鱼胚胎样本进行甲醛交联，然后通过MNase酶切获取单核小体，H3抗体将染色质固定在磁珠上，从而在磁珠上对各种不同的样品加上不同的标签接头，再将染色质从磁珠上释放出来浓缩后将样品混合在一起进行各种抗体的染色质免疫共沉淀反应，获得DNA样品纯化后建库测序。本发明iChIP是在传统的ChiP上进行的改良，这种方法是通过在染色质免疫共沉淀前先将每个样本进行标记后再将所有样品混合在一起进行实验，能观察到在发育过程中染色质修饰的一个动态变化，减少早期细胞量少可能造成的实验偏差，且可以通过细胞数数量对整个发育过程中的染色质修饰动态变化进行定量观察。