公开(公告)号：CN105441548A

公开(公告)日：2016-03-30

申请号：CN201510970471.X

申请日：2015-12-21

Applicant: 同济大学

Inventor： 刘桂芬 ,  张勇 ,  王湘秀 ,  陈玉洁 ,  王晨飞 ,  修文超

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2521/537 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明涉及斑马鱼胚胎单细胞染色质超敏位点高通量测序实验方法，首先进行斑马鱼胚胎样本前处理，然后将胚胎转至含有裂解缓冲液的管中，用广口枪头在冰浴中裂解胚胎；再进行脱氧核糖核酸酶I酶切反应，抽提纯化DNA，利用建库试剂盒构建文库后通过琼脂糖胶电泳分离选择所需文库大小进行高通量测序及生物信息分析。与现有技术相比，本发明主要通过在沉淀过程中加入环状载体DNA来富集DNA量，从而能在单个细胞水平进行的DNase I超敏位点高通量测序技术，此方法能观察到细胞与细胞之间的转录调控区域的差异，剖析细胞的异质性，能更好的观察胚胎发育过程中基因转录调控的变化及机制研究。