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公开(公告)号:CN113870950A
公开(公告)日:2021-12-31
申请号:CN202111047153.8
申请日:2021-09-07
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开了一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法,所述识别系统包括:输入单元,其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据;微处理器,其连接所述输入单元;存储单元,其连接所述微处理器;处理单元,其连接所述微处理器,用于处理数据并得出识别结果;其中,所述处理单元包括:预处理单元,其从所述存储单元中获取所述多组学数据,并进行预处理;网络构建单元,其获取预处理后的多组学数据,处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络;致病因子挖掘单元,其输入所述多组学分层异质互作网络,输出致病sRNA调控网络;以及关键sRNA识别单元,其接收致病sRNA调控网络,并进行稻瘟菌关键sRNA识别,得到识别结果。
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公开(公告)号:CN113870950B
公开(公告)日:2024-05-17
申请号:CN202111047153.8
申请日:2021-09-07
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开了一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法,所述识别系统包括:输入单元,其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据;微处理器,其连接所述输入单元;存储单元,其连接所述微处理器;处理单元,其连接所述微处理器,用于处理数据并得出识别结果;其中,所述处理单元包括:预处理单元,其从所述存储单元中获取所述多组学数据,并进行预处理;网络构建单元,其获取预处理后的多组学数据,处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络;致病因子挖掘单元,其输入所述多组学分层异质互作网络,输出致病sRNA调控网络;以及关键sRNA识别单元,其接收致病sRNA调控网络,并进行稻瘟菌关键sRNA识别,得到识别结果。
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公开(公告)号:CN118506886A
公开(公告)日:2024-08-16
申请号:CN202410940243.7
申请日:2024-07-15
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明属于生物特征识别技术领域,涉及一种基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法,该方法首先通过深度随机游走模型遍历单一组学互作网络,随机获取顶点固定步长内的节点,通过节点在其同质网络内的权重以及边的权重,构建出顶点的局部特征。随后,将不同网络中的节点进行连接,得到两异质节点间的关系链路特征,接着,通过基于卷积特征提取的DBSCAN聚类算法将具有相似性特征的链路整合到一个簇中,挖掘异构网络集成的潜在关系,之后结合链路预测结果和单一组学互作用网络权重指标,筛选出稻瘟病菌侵染水稻过程中的关键致病因子和抗病因子,具有鉴定结果准确、鉴定速度快等优势。
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公开(公告)号:CN111860361B
公开(公告)日:2023-07-25
申请号:CN202010720216.0
申请日:2020-07-24
Applicant: 吉林大学
IPC: G06V20/00 , G06V10/26 , G06V10/82 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开一种绿色通道货物扫描图像夹带自动识别器,包括上位机和自动识别器两个部分。其中,上位机包括:输入单元;第一接口单元;显示单元;自动识别器包括:第二接口单元;存储单元(包括内存储单元、缓存单元和外存储单元);微处理器;处理单元。本发明构建自主研发的GCIDNet、GCIENet和GCIRNet三种深度学习算法,分别封装在图像去噪单元、图像增强单元和图像识别单元中,用于识别未知绿色通道图片数据,并预测未知图片数据对应的货物种类以及夹带情况。
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公开(公告)号:CN119626339A
公开(公告)日:2025-03-14
申请号:CN202411648509.7
申请日:2024-11-19
Applicant: 吉林大学
IPC: G16B40/00 , G16B30/00 , G16B15/00 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G06N3/042 , G06N3/096 , G06N3/0985 , G06N3/084
Abstract: 本发明公开了一种融合知识驱动和数据驱动的稻瘟菌AVR基因RNA二级结构生成器,采用ARM芯片的片上存储器和外部DRAM芯片,分别存储RNA原始数据及中间结果;采用FPGA芯片实现RNA序列到知识图谱的映射,并通过LUT融合碱基配对等特征;采用多核AI芯片,并行执行编码器‑解码器网络,融合知识和数据生成二级结构;再通过AI芯片流水化执行VAE‑GAN网络,评估生成结构质量并迭代优化,生成精确的RNA二级结构。本发明还公开了一种融合知识驱动和数据驱动的稻瘟菌AVR基因RNA二级结构的预测方法,利用RNA物理化学特性,结合深度学习、迁移学习和知识蒸馏技术,提高预测的准确率和运算效率。
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公开(公告)号:CN116504311A
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202310438736.6
申请日:2023-04-23
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习的水稻抗稻瘟菌关键SRNA识别方法,包括:步骤一、在水稻侵染数据集中,获取水稻SRNA和MRNA序列信息;步骤二、设定筛选条件,筛选水稻差异表达SRNA和MRNA;步骤三、构建差异表达水稻基因的异质互作网络;步骤四、在异质互作网络中,联合优化建模显示关系和建模隐式关系,通过联合优化结果,筛选出稻瘟菌侵染水稻过程中的水稻抗侵染关键SRNA。通过构建差异表达水稻基因的异质互作网络,并进行联合优化,能够找出水稻抵抗稻瘟菌侵染过程中的关键水稻SRNA,弥补传统方法无法考虑同类型生物分子间相互影响的不足,提升方法预测的准确性。
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公开(公告)号:CN111860361A
公开(公告)日:2020-10-30
申请号:CN202010720216.0
申请日:2020-07-24
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开一种绿色通道货物扫描图像夹带自动识别器,包括上位机和自动识别器两个部分。其中,上位机包括:输入单元;第一接口单元;显示单元;自动识别器包括:第二接口单元;存储单元(包括内存储单元、缓存单元和外存储单元);微处理器;处理单元。本发明构建自主研发的GCIDNet、GCIENet和GCIRNet三种深度学习算法,分别封装在图像去噪单元、图像增强单元和图像识别单元中,用于识别未知绿色通道图片数据,并预测未知图片数据对应的货物种类以及夹带情况。
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