一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法

    公开(公告)号:CN113870950B

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202111047153.8

    申请日:2021-09-07

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法,所述识别系统包括:输入单元,其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据;微处理器,其连接所述输入单元;存储单元,其连接所述微处理器;处理单元,其连接所述微处理器,用于处理数据并得出识别结果;其中,所述处理单元包括:预处理单元,其从所述存储单元中获取所述多组学数据,并进行预处理;网络构建单元,其获取预处理后的多组学数据,处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络;致病因子挖掘单元,其输入所述多组学分层异质互作网络,输出致病sRNA调控网络;以及关键sRNA识别单元,其接收致病sRNA调控网络,并进行稻瘟菌关键sRNA识别,得到识别结果。

    基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法

    公开(公告)号:CN118506886A

    公开(公告)日:2024-08-16

    申请号:CN202410940243.7

    申请日:2024-07-15

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明属于生物特征识别技术领域,涉及一种基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法,该方法首先通过深度随机游走模型遍历单一组学互作网络,随机获取顶点固定步长内的节点,通过节点在其同质网络内的权重以及边的权重,构建出顶点的局部特征。随后,将不同网络中的节点进行连接,得到两异质节点间的关系链路特征,接着,通过基于卷积特征提取的DBSCAN聚类算法将具有相似性特征的链路整合到一个簇中,挖掘异构网络集成的潜在关系,之后结合链路预测结果和单一组学互作用网络权重指标,筛选出稻瘟病菌侵染水稻过程中的关键致病因子和抗病因子,具有鉴定结果准确、鉴定速度快等优势。

    一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法

    公开(公告)号:CN113870950A

    公开(公告)日:2021-12-31

    申请号:CN202111047153.8

    申请日:2021-09-07

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法,所述识别系统包括:输入单元,其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据;微处理器,其连接所述输入单元;存储单元,其连接所述微处理器;处理单元,其连接所述微处理器,用于处理数据并得出识别结果;其中,所述处理单元包括:预处理单元,其从所述存储单元中获取所述多组学数据,并进行预处理;网络构建单元,其获取预处理后的多组学数据,处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络;致病因子挖掘单元,其输入所述多组学分层异质互作网络,输出致病sRNA调控网络;以及关键sRNA识别单元,其接收致病sRNA调控网络,并进行稻瘟菌关键sRNA识别,得到识别结果。

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