一种基于机器学习的水稻抗稻瘟菌关键SRNA识别方法

    公开(公告)号:CN116504311A

    公开(公告)日:2023-07-28

    申请号:CN202310438736.6

    申请日:2023-04-23

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习的水稻抗稻瘟菌关键SRNA识别方法,包括:步骤一、在水稻侵染数据集中,获取水稻SRNA和MRNA序列信息;步骤二、设定筛选条件,筛选水稻差异表达SRNA和MRNA;步骤三、构建差异表达水稻基因的异质互作网络;步骤四、在异质互作网络中,联合优化建模显示关系和建模隐式关系,通过联合优化结果,筛选出稻瘟菌侵染水稻过程中的水稻抗侵染关键SRNA。通过构建差异表达水稻基因的异质互作网络,并进行联合优化,能够找出水稻抵抗稻瘟菌侵染过程中的关键水稻SRNA,弥补传统方法无法考虑同类型生物分子间相互影响的不足,提升方法预测的准确性。

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