-
公开(公告)号:CN118737272A
公开(公告)日:2024-10-01
申请号:CN202410831641.5
申请日:2024-06-25
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
Abstract: 本申请公开的一种基于连续区间组合的标志物筛选方法,包括采集步骤,分别获取第一人群和第二人群的甲基化区间和对应CpG位点的甲基化值;差异定量步骤,针对所述甲基化区间中的每个CpG位点计算差异水平,获取差异水平满足临界条件的差异CpG位点;连续位点提取步骤,利用所述差异CpG位点获取多个连续位点区间;特征区间筛选步骤,用于从所述多个连续位点区间中筛选候选特征区间的组合作为特征区间。本申请的方法通过筛选得到包含连续的甲基化差异的CpG位点的连续位点区间,并对区间进行组合,得到具有高特异性的cfDNA标志物,用于精准的疾病早期筛查。
-
公开(公告)号:CN118230935A
公开(公告)日:2024-06-21
申请号:CN202211639253.4
申请日:2022-12-20
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
IPC: G16H50/20 , C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16H10/60 , G16B20/00
Abstract: 本申请提供一种体外检测食管癌的系统,所述系统包括:数据采集模块,其用于获取受试者的甲基化标志物水平、传统标志物水平、和流调信息的数据;以及患食管癌概率的计算模块,其用于对数据采集模块中的获取的上述数据进行计算,从而计算出受试者患食管癌的概率。本申请的系统利用受试者外周血血浆的甲基化标志物检测信息、传统标志物检测信息和高危因素流调信息构建一种体外诊断食管癌的模型和方法,进而提高食管癌早期筛查和早期诊断的准确性。
-
公开(公告)号:CN118064583A
公开(公告)日:2024-05-24
申请号:CN202410217381.2
申请日:2024-02-27
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G06F17/18 , G06F18/243 , G06F18/214 , G06N5/01 , G06N20/00 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一基于cfDNA甲基化的泛癌标志物筛选的方法和系统及标志物的组合和应用。以经济有效地方式实现泛癌种的早期筛查,达到在早期阶段准确区分癌症患者和非癌症个体,本申请提供的标志物在癌症检测中同时具有很高的敏感性和特异性,适用于肿瘤的无创筛查。
-
公开(公告)号:CN117512091A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202311440783.0
申请日:2023-11-01
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本申请提供了一种用于预测脑卒中预后的标志物及其用途。本申请基于大量的脑卒中样本,筛选得到本申请的标志物。本申请的甲基化标志物能够准确预测脑卒中患者预后的情况,可作为辅助治疗强有力的辅助工具,具有重要的临床应用价值。
-
公开(公告)号:CN117327796A
公开(公告)日:2024-01-02
申请号:CN202311559047.7
申请日:2023-11-21
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/12 , C12N15/11
Abstract: 本申请提供了一种用于检测尿路上皮癌的组合物及其用途,所述组合物包括:用于检测目标基因甲基化状态的核酸,其中,所述目标基因为VIM基因、KCNA3基因、TMEM220基因和PPM1N基因中的一种或两种以上。本申请还提供了包括所述组合物的试剂盒,以及所述组合物在制备用于体外检测尿路上皮癌的试剂盒中的用途。
-
公开(公告)号:CN114974430A
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN202210182941.6
申请日:2022-02-25
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
Abstract: 本申请提供了一种用于癌症筛查的系统,其包括:数据采集模块,其用于获取受试者目标区域的甲基化水平、肿瘤分数、肿瘤倍性、cfDNA片段长度特征值和reads分布的数据;以及癌症计算模块,其基于数据采集模块中获取的甲基化水平、肿瘤分数、肿瘤倍性、cfDNA片段长度特征值和reads分布的数据以预测受试者罹患癌症的概率。本申请使用非常简单的模型,所用5个标志物能够大幅度地降低癌症筛查的成本并提高筛查准确率的癌症无创筛查方法,并具有非常高的灵敏度和特异性。
-
公开(公告)号:CN119811476A
公开(公告)日:2025-04-11
申请号:CN202411793420.X
申请日:2024-12-06
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
Abstract: 公开了一种基于cfDNA的癌症甲基化标志物筛选方法,包括:分别提取第一人群和第二人群的cfDNA样本及其在目标区间的所有CpG位点的甲基化值,以分别得到第一人群样本集和第二人群样本集;选择第一人群样本集和第二人群样本集的训练样本集,合并训练样本集并平均划分为l个训练样本子集,多次选取训练样本子集中的l‑1个训练样本子集并筛选其中的第一人群样本和第二人群样本的差异CpG位点,得到多个候选甲基化标志物集,利用多个候选甲基化标志物集构建多个筛选模型并提取甲基化标志物集。通过本申请所述方法交叉筛选得到的高异质性cfDNA测序样本间的标志物,提高了对癌症亚型检测的准确性。
-
公开(公告)号:CN119785892A
公开(公告)日:2025-04-08
申请号:CN202411803571.9
申请日:2024-12-09
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
Abstract: 公开了一种多模态泛癌早期预测方法,包括:分别采集i种癌症人群和健康人群的cfDNA样本并提取甲基化数据;基于甲基化数据合并CpG位点,以得到多个甲基化区间,从多个甲基化区间中筛选得到多个候选标志物区间,对多个候选标志物区间进一步筛选;利用多个候选标志物区间训练第一预测模型,基于参考基因组提取染色体的片段化特征训练第二预测模型,提取染色体的甲基化熵特征训练第三预测模型;通过第一预测模型、第二预测模型和第三预测模型的癌症人群预测值训练多模态泛癌早期预测模型,可以提供对肺癌、肠癌、胃癌、肝癌、食管癌、甲状腺癌、卵巢癌精准的联合早筛。
-
公开(公告)号:CN119673481A
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202311220244.6
申请日:2023-09-20
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
Abstract: 本申请提供了一种筛选基于甲基化检测的标志物的方法,其中,包括:获取第一目标数据的步骤,所述第一目标数据是针对第一人群的测序数据;获取第二目标数据的步骤,所述第二目标数据是针对第二人群的测序数据;确定候选区域的步骤,基于所述第一目标数据和所述第二目标数据确定M个CpG富集的候选区域;获取第三目标数据的步骤,所述第三目标数据包括:所述第一目标数据和所述第二目标数据中M个候选区域中每个候选区域的甲基化单体型,以及各单体型出现的次数;从候选区域中确定基于甲基化检测的标志物的步骤,基于所述第三目标数据在第一人群和第二人群中的差异从候选区域中确定能够用于区分第一人群和第二人群的标志物;第一人群或第二人群是具有不同特征且所述特征不重合的两类人群。
-
公开(公告)号:CN119040457A
公开(公告)日:2024-11-29
申请号:CN202410954341.6
申请日:2024-07-16
Applicant: 博尔诚(北京)科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/12 , C12N15/11
Abstract: 本申请提供了一种用于检测尿路上皮癌的组合物及其用途,所述组合物包括:用于检测目标基因甲基化状态的核酸,其中,所述目标基因为VIM基因、TMEM220基因和PPM1N基因中的一种或两种以上。本申请还提供了包括所述组合物的试剂盒,以及所述组合物在制备用于体外检测尿路上皮癌的试剂盒中的用途。
-
-
-
-
-
-
-
-
-