公开(公告)号：CN113736856A

公开(公告)日：2021-12-03

申请号：CN202111135010.2

申请日：2021-09-27

Applicant: 南开大学

Inventor： 孔德明 ,  汪晶 ,  马嘉懿 ,  王东霞 ,  刘博 ,  井潇 ,  陈郸烨

IPC: C12Q1/6825 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了快速检测次氯酸及髓过氧化物酶的等温核酸扩增传感器，所述的核酸纳米传感器包含三个部分：a，探针1(P1)，分别由若干种DNA单链(S1，S2…Sn和H1)构成三维刚性纳米结构；b，探针2(P2)，分别由若干种DNA单链(S1，S2…Sn和H2)构成三维刚性纳米结构，其中H1和H2构成扩增反应如杂交链式反应(HCR)的两个单元；c，探针3(Lock‑In)，硫代磷酸修饰的核酸构成锁链(Lock)，能够引发杂交链式反应的引发链(In)，其中In最初被Lock锁上，无法引发HCR，当有目标物髓过氧化物酶(MPO)时，催化H2O2和氯离子(Cl‑)产生次氯酸(HOCl)，硫代磷酸链断裂，随后释放In，引发H1和H2发生扩增反应。本发明的核酸纳米探针既可以检测次氯酸也可以检测髓过氧化物酶。

公开(公告)号：CN117143845A

公开(公告)日：2023-12-01

申请号：CN202311063801.8

申请日：2023-08-23

Applicant: 南开大学

Inventor： 孔德明 ,  李庆楠 ,  戴智琦 ,  王星文 ,  王东霞

IPC: C12N9/22 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/6816

Abstract: 本发明涉及一种低背景CRISPR/Cas12a生物传感器及应用，利用"RESET"效应，通过精心设计CRISPR/Cas12a系统的激活链AS，引入"13+3RESET"效应，激活链的长度由原来的20个碱基完全与crRNA互补配对缩短为两部分配对，即13和3个碱基分别与crRNA配对；制备得到的激活链长度虽然缩短了但是其激活Cas酶活性的能力和20个碱基长的激活链能力基本一致，但是加了与AS部分互补配对的BS封闭链后其背景信号大大降低，有效解决了高背景的问题。背景信号显著降低，检测灵敏度提高，能够用于不同目标物的灵敏和特异性检测，包括核酸、酶和生物小分子。得益于低背景，这些生物传感器被证明可以很好地用于活细胞中不同生物分子的精确成像分析。并且可以和试纸条相结合，以实现对靶标分子的即时检测。

公开(公告)号：CN115637271A

公开(公告)日：2023-01-24

申请号：CN202211218898.0

申请日：2022-10-07

Applicant: 南开大学

Inventor： 孔德明 ,  王东霞 ,  刘博

IPC: C12N15/115 ,  C12N15/11 ,  C12N5/00 ,  C12N5/09

Abstract: 本发明提供了多价DNA纳米毛刷、制备方法以及在研究细胞间应答的应用，所述DNA纳米毛刷通过4条短DNA链自组装形成线性骨架，骨架上通过碱基互补的方式链接胆固醇、适配体等功能基团以达到细胞膜表面工程化的目的。基于胆固醇/适配体结构的DNA纳米毛刷可以通过疏水插入和分子识别的方式，有效地操纵细胞行为，包括细胞‑细胞结合和物质的传输。通过改变DNA纳米毛刷的骨架碱基数量可以调控功能链的识别方向。通过改变功能链的互补碱基数量和功能链数量可以调控细胞识别距离和强度。该方法可以很容易地应用于构建细胞簇组装、铁死亡信号传导、免疫细胞与癌细胞之间的应答研究，为调节动态细胞行为提供了一个智能且多功能的平台。