公开(公告)号：CN113736856A

公开(公告)日：2021-12-03

申请号：CN202111135010.2

申请日：2021-09-27

Applicant: 南开大学

Inventor： 孔德明 ,  汪晶 ,  马嘉懿 ,  王东霞 ,  刘博 ,  井潇 ,  陈郸烨

IPC: C12Q1/6825 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了快速检测次氯酸及髓过氧化物酶的等温核酸扩增传感器，所述的核酸纳米传感器包含三个部分：a，探针1(P1)，分别由若干种DNA单链(S1，S2…Sn和H1)构成三维刚性纳米结构；b，探针2(P2)，分别由若干种DNA单链(S1，S2…Sn和H2)构成三维刚性纳米结构，其中H1和H2构成扩增反应如杂交链式反应(HCR)的两个单元；c，探针3(Lock‑In)，硫代磷酸修饰的核酸构成锁链(Lock)，能够引发杂交链式反应的引发链(In)，其中In最初被Lock锁上，无法引发HCR，当有目标物髓过氧化物酶(MPO)时，催化H2O2和氯离子(Cl‑)产生次氯酸(HOCl)，硫代磷酸链断裂，随后释放In，引发H1和H2发生扩增反应。本发明的核酸纳米探针既可以检测次氯酸也可以检测髓过氧化物酶。

公开(公告)号：CN106936439A

公开(公告)日：2017-07-07

申请号：CN201610831693.8

申请日：2016-09-20

Applicant: 南开大学 ,  北京奇虎科技有限公司

Inventor： 王刚 ,  刘博 ,  黄曦 ,  徐明 ,  樊岩 ,  刘晓光 ,  郭东东 ,  肖康

IPC: H03M7/30

Abstract: 一种通用的基于分块排序思想的压缩预处理方法及应用。其步骤为：1.按照预设尺寸将信源分块，按信源顺序对块编号；2.将每一个信源块视作一个字符串，依照字典序对其排序，记录排序后的块编号；3.对块的编号，首先进行二进制化处理（以整数形式存储而不是字符串形式），之后使用Lz77系列算法压缩；对排序后的块集合，直接使用Lz77系列算法压缩；4.将压缩结果以二进制形式输出至文件。本发明能够通过合理的分块原则和排序手段，有效地将相同或相似数据聚类，进而更好地发挥Lz77系列通用压缩算法的去重效果，提高压缩率。同时减小了Lz77算法在滑动窗口中的寻址距离，有效地降低了压缩和解压缩的时间，提供更加快捷而高效的压缩服务。

公开(公告)号：CN115637271A

公开(公告)日：2023-01-24

申请号：CN202211218898.0

申请日：2022-10-07

Applicant: 南开大学

Inventor： 孔德明 ,  王东霞 ,  刘博

IPC: C12N15/115 ,  C12N15/11 ,  C12N5/00 ,  C12N5/09

Abstract: 本发明提供了多价DNA纳米毛刷、制备方法以及在研究细胞间应答的应用，所述DNA纳米毛刷通过4条短DNA链自组装形成线性骨架，骨架上通过碱基互补的方式链接胆固醇、适配体等功能基团以达到细胞膜表面工程化的目的。基于胆固醇/适配体结构的DNA纳米毛刷可以通过疏水插入和分子识别的方式，有效地操纵细胞行为，包括细胞‑细胞结合和物质的传输。通过改变DNA纳米毛刷的骨架碱基数量可以调控功能链的识别方向。通过改变功能链的互补碱基数量和功能链数量可以调控细胞识别距离和强度。该方法可以很容易地应用于构建细胞簇组装、铁死亡信号传导、免疫细胞与癌细胞之间的应答研究，为调节动态细胞行为提供了一个智能且多功能的平台。