公开(公告)号：CN106916217A

公开(公告)日：2017-07-04

申请号：CN201710169790.X

申请日：2017-03-21

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 袁子国 ,  吕琳 ,  王亚培 ,  黄万意 ,  张秀香 ,  冯伟利 ,  吕淑媚 ,  郑玉香 ,  周雪 ,  陈雅俊

IPC: C07K14/47 ,  C12N15/12 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  G01N30/89 ,  G01N21/33

CPC classification number: C07K14/47 ,  C12Q1/6893 ,  G01N21/33 ,  G01N30/89

Abstract: 本发明提供了一种应用iTRAQ技术研究弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法，包含以下步骤：(1)小鼠脑蛋白的提取；(2)对步骤(1)所得的蛋白质样品进行FASP酶解、肽段标记；(3)对步骤(2)标记的蛋白质样品进行HPLC分离肽段混合物及LC‑MS质谱分析；(4)对上步所得的质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析，获取弓形虫慢性感染小鼠脑组织过程中的差异表达蛋白质。本发明提供的iTRAQ结合LCMS/MS技术能快速有效地进行蛋白质组学研究，为研究弓形虫慢性感染致宿主CNS损伤机制以及发现新的生物标志物提供参考。

公开(公告)号：CN117593744A

公开(公告)日：2024-02-23

申请号：CN202311414743.9

申请日：2023-10-30

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘昌余 ,  程紫薇 ,  郑晶晶 ,  裴嘉薇 ,  王瀚升 ,  周雪 ,  廖颖娱 ,  吴春胤 ,  李文熹

IPC: G06V20/69 ,  G06V10/25 ,  G06V10/26 ,  G06V10/44 ,  G06V10/52 ,  G06V10/774 ,  G06V10/80 ,  G06V10/82 ,  G06T7/00

Abstract: 本发明公开一种基于深度学习的植物细胞检测方法，能快速、精准的检测图像中的植物细胞，有助于植物细胞多样性的研究。方法包括：借助电子计算机断层扫描技术获得植物组织的连续切片CT图像；进行格式转换，使用图像处理软件进行预处理；将预处理后的CT图像输入Cellpose卷积神经网络中进行分割输出植物细胞的轮廓txt文件；计算植物细胞的最小外接矩形作为检测框，获得检测框的位置和尺寸生成检测框txt文件并转换为XML标注文件；将预处理后的CT图像与对应的XML标注文件进行数据增强获得图像数据集并划分为训练集、验证集及测试集；使用训练集和验证集对YOLOv5网络模型进行训练，并使用测试集进行性能检测；对待检测的植物组织CT图像进行植物细胞检测。

公开(公告)号：CN108060220B

公开(公告)日：2021-08-03

申请号：CN201711418352.9

申请日：2017-12-25

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 袁子国 ,  郑玉香 ,  周雪 ,  王亚培 ,  李贵峰

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883 ,  G16B25/00 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明提供了一种应用RNA‑seq技术研究弓形虫慢性感染小鼠附睾组织差异表达基因的方法，包含以下步骤：(1)小鼠附睾组织的RNA提取；(2)对步骤(1)所得的RNA进行文库构建和测序；(3)对步骤(2)测序结果进行生物信息学分析，获取弓形虫慢性感染小鼠附睾组织的差异表达基因，筛选并鉴定与生殖相关的基因。本发明提供的弓形虫慢性感染附睾组织差异表达基因的方法能快速有效地进行基因表达差异的研究，用qPCR方法检测筛选的靶标基因来鉴定附睾是否感染弓形虫，对于提高公畜的生殖潜力及动物繁殖率均有重要理论价值和应用前景，将它们作为衡量公畜生殖系统感染弓形虫的分子标记，有利于快速定位到具有研究价值或商业应用价值的检测靶标、防治药物靶点。

公开(公告)号：CN106810602A

公开(公告)日：2017-06-09

申请号：CN201710169788.2

申请日：2017-03-21

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 袁子国 ,  吕琳 ,  王亚培 ,  黄万意 ,  张秀香 ,  冯伟利 ,  吕淑媚 ,  郑玉香 ,  周雪 ,  陈雅俊

IPC: C07K14/47 ,  C12N15/12 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  G01N30/89 ,  G01N21/33

CPC classification number: C07K14/47 ,  C12Q1/6893 ,  G01N21/33 ,  G01N30/89

Abstract: 本发明提供了一种应用iTRAQ技术研究弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法，本发明还提供了一种与大脑发育调节蛋白相互作用的蛋白质或多肽、及其应用，本发明通过CoIP和Pulldown实验发现与大脑发育调节蛋白相互作用6个弓形虫蛋白，并进一步针对TgRPS14、TgH4基因进行基因敲除实验和神经行为学验证。本发明提供了的弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法能快速有效地进行蛋白质组学研究，有利于快速定位到具有研究价值或商业应用价值的检测靶标、防治药物靶点。

公开(公告)号：CN106916217B

公开(公告)日：2021-04-06

申请号：CN201710169790.X

申请日：2017-03-21

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 袁子国 ,  吕琳 ,  王亚培 ,  黄万意 ,  张秀香 ,  冯伟利 ,  吕淑媚 ,  郑玉香 ,  周雪 ,  陈雅俊

IPC: C07K14/47 ,  C12N15/12 ,  C12Q1/6893 ,  C12Q1/04 ,  G01N30/89 ,  G01N21/33

Abstract: 本发明提供了一种应用iTRAQ技术研究弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法，包含以下步骤：(1)小鼠脑蛋白的提取；(2)对步骤(1)所得的蛋白质样品进行FASP酶解、肽段标记；(3)对步骤(2)标记的蛋白质样品进行HPLC分离肽段混合物及LC‑MS质谱分析；(4)对上步所得的质谱鉴定结果进行生物信息学分析、定量分析，获取弓形虫慢性感染小鼠脑组织过程中的差异表达蛋白质。本发明提供的iTRAQ结合LCMS/MS技术能快速有效地进行蛋白质组学研究，为研究弓形虫慢性感染致宿主CNS损伤机制以及发现新的生物标志物提供参考。

公开(公告)号：CN108060220A

公开(公告)日：2018-05-22

申请号：CN201711418352.9

申请日：2017-12-25

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 袁子国 ,  郑玉香 ,  周雪 ,  王亚培 ,  李贵峰

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883 ,  G06F19/22 ,  G06F19/20

Abstract: 本发明提供了一种应用RNA‑seq技术研究弓形虫慢性感染小鼠附睾组织差异表达基因的方法，包含以下步骤：(1)小鼠附睾组织的RNA提取；(2)对步骤(1)所得的RNA进行文库构建和测序；(3)对步骤(2)测序结果进行生物信息学分析，获取弓形虫慢性感染小鼠附睾组织的差异表达基因，筛选并鉴定与生殖相关的基因。本发明提供的弓形虫慢性感染附睾组织差异表达基因的方法能快速有效地进行基因表达差异的研究，用qPCR方法检测筛选的靶标基因来鉴定附睾是否感染弓形虫，对于提高公畜的生殖潜力及动物繁殖率均有重要理论价值和应用前景，将它们作为衡量公畜生殖系统感染弓形虫的分子标记，有利于快速定位到具有研究价值或商业应用价值的检测靶标、防治药物靶点。