公开(公告)号：CN115690326A

公开(公告)日：2023-02-03

申请号：CN202211432809.2

申请日：2022-11-16

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘昌余 ,  高湛凯 ,  黄浩 ,  程紫薇 ,  杨煜林 ,  裴嘉薇 ,  郑晶晶 ,  王瀚升 ,  陆志颖 ,  李文熹

IPC: G06T17/00 ,  G06T1/20

Abstract: 本发明公开了一种植物细胞三维重构方法，包括：根据得到的目标植物组织细胞连续切片图像的分辨率和目标植物细胞的大小建立三维笛卡尔坐标系；根据目标植物细胞所需采集的数据信息和所需计算的参数，设计用于存储对应数据的数据结构；基于三维笛卡尔坐标系对目标植物细胞的连续切片图像进行采样，在每张切片图像中使用平行于X轴或Y轴的等间距线对目标植物细胞细胞壁的内外两侧分别进行点采样，并按照点采样顺序将采样点的XYZ轴坐标值以及采样点的序号对应存入设计好的数据结构内部；利用采集和存入完成的数据结构分别计算目标植物细胞的表面积、重心、体积和细胞壁厚度参数。

公开(公告)号：CN117593744A

公开(公告)日：2024-02-23

申请号：CN202311414743.9

申请日：2023-10-30

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘昌余 ,  程紫薇 ,  郑晶晶 ,  裴嘉薇 ,  王瀚升 ,  周雪 ,  廖颖娱 ,  吴春胤 ,  李文熹

IPC: G06V20/69 ,  G06V10/25 ,  G06V10/26 ,  G06V10/44 ,  G06V10/52 ,  G06V10/774 ,  G06V10/80 ,  G06V10/82 ,  G06T7/00

Abstract: 本发明公开一种基于深度学习的植物细胞检测方法，能快速、精准的检测图像中的植物细胞，有助于植物细胞多样性的研究。方法包括：借助电子计算机断层扫描技术获得植物组织的连续切片CT图像；进行格式转换，使用图像处理软件进行预处理；将预处理后的CT图像输入Cellpose卷积神经网络中进行分割输出植物细胞的轮廓txt文件；计算植物细胞的最小外接矩形作为检测框，获得检测框的位置和尺寸生成检测框txt文件并转换为XML标注文件；将预处理后的CT图像与对应的XML标注文件进行数据增强获得图像数据集并划分为训练集、验证集及测试集；使用训练集和验证集对YOLOv5网络模型进行训练，并使用测试集进行性能检测；对待检测的植物组织CT图像进行植物细胞检测。