一种基于细胞相互作用网络的肺癌淋巴结转移鉴定系统

    公开(公告)号:CN116884479A

    公开(公告)日:2023-10-13

    申请号:CN202310852272.3

    申请日:2023-07-12

    Abstract: 本发明提出一种基于细胞相互作用网络的肺癌淋巴结转移鉴定系统,该系统用于:获取若干患者标准化后的基因表达矩阵并进行聚类分析,利用聚类结果推断细胞相互作用网络,将细胞相互作用网络进行整图嵌入,得到细胞相互作用网络的向量表示,利用逻辑回归算法对向量表示进行分类分析,得到分类模型,再提取患者细胞相互作用网络的网络特征,将网络特征输入分类模型训练,得到淋巴结转移鉴定模型,将所需预测患者数据输入淋巴结转移鉴定模型获取分类结果,根据分类结果鉴定患者的病症类别,根据病症类别提前预测淋巴结转移的发生。本发明能够有助于确定肺癌患者的特征,鉴定病症类别。

    基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法

    公开(公告)号:CN116504314A

    公开(公告)日:2023-07-28

    申请号:CN202310765180.1

    申请日:2023-06-27

    Abstract: 本发明提出一种基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法,该方法包括,获取单细胞转录组测序数据并进行预处理,再利用Slingshot进行推断,得到包含细胞注释信息和拟时间信息的表达矩阵;根据表达矩阵中拟时间信息的密度计算两种细胞状态之间的交点,以交点为基准,将所有细胞划分成多个窗口;在每个窗口中构建细胞类型特异性基因调控网络;构建参考网络,将参考网络作为参考信息来校准细胞类型特异性基因调控网络。本发明将拟时间信息和细胞类型结合,并且考虑了细胞密度沿拟时间的分布状况,有助于从细胞动态分化的角度构建细胞类型特异性的基因调控网络,使得所构建的基因调控网络更准确。

    一种服务于高校计算机与软件教学的实验云平台系统

    公开(公告)号:CN102063818A

    公开(公告)日:2011-05-18

    申请号:CN201010252027.1

    申请日:2010-08-12

    Abstract: 一种服务于高校计算机与软件教学的实验云平台系统,该实验云平台系统在基于计算虚拟化技术上,将多台物理主机通过互联网络构建虚拟机集群实验平台,同时又将多个分散在学校各处的虚拟机集群系统实验平台整合为一个实验云平台系统;在该实验云平台中有各种计算机与软件相关实验所需要的操作系统与实验相关软件与工具,并设有实验云平台数据中心来保存实验数据与实验结果,为用户提供了远程登录实验云平台的终端。本发明通过实验云平台的构建,使得多人可同时共享一台计算机的实验系统资源,充分提高了计算机系统资源利用率,方便了学校对实验系统资源的管理,同时降低了学校的计算机设备投资成本。本发明适用高校计算机计算与软件资源的共享管理。

    基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法

    公开(公告)号:CN116504314B

    公开(公告)日:2023-08-29

    申请号:CN202310765180.1

    申请日:2023-06-27

    Abstract: 本发明提出一种基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法,该方法包括,获取单细胞转录组测序数据并进行预处理,再利用Slingshot进行推断,得到包含细胞注释信息和拟时间信息的表达矩阵;根据表达矩阵中拟时间信息的密度计算两种细胞状态之间的交点,以交点为基准,将所有细胞划分成多个窗口;在每个窗口中构建细胞类型特异性基因调控网络;构建参考网络,将参考网络作为参考信息来校准细胞类型特异性基因调控网络。本发明将拟时间信息和细胞类型结合,并且考虑了细胞密度沿拟时间的分布状况,有助于从细胞动态分化的角度构建细胞类型特异性的基因调控网络,使得所构建的基因调控网络更准确。

    一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法

    公开(公告)号:CN114974435A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202210509532.2

    申请日:2022-05-10

    Abstract: 本申请涉及一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法,它包括如下步骤:S1:选择特征基因;S2:计算细胞类型差异;S3:计算细胞状态差异;S4:计算细胞间的距离;S5:根据步骤S4中得到的细胞间的距离构建距离矩阵Wα和邻接矩阵Wfinal;S6:在邻接矩阵Wfinal上实施谱聚类。本发明能够有效处理表达矩阵中存在大量零表达的情形,有效减少单细胞数据固有噪声的影响,可应用于单细胞数据集的细胞鉴定和衡量肿瘤内异质性分析。

    一种服务于高校计算机与软件教学的实验云平台系统

    公开(公告)号:CN102063818B

    公开(公告)日:2012-11-21

    申请号:CN201010252027.1

    申请日:2010-08-12

    Abstract: 一种服务于高校计算机与软件教学的实验云平台系统,该实验云平台系统在基于计算虚拟化技术上,将多台物理主机通过互联网络构建虚拟机集群实验平台,同时又将多个分散在学校各处的虚拟机集群系统实验平台整合为一个实验云平台系统;在该实验云平台中有各种计算机与软件相关实验所需要的操作系统与实验相关软件与工具,并设有实验云平台数据中心来保存实验数据与实验结果,为用户提供了远程登录实验云平台的终端。本发明通过实验云平台的构建,使得多人可同时共享一台计算机的实验系统资源,充分提高了计算机系统资源利用率,方便了学校对实验系统资源的管理,同时降低了学校的计算机设备投资成本。本发明适用高校计算机计算与软件资源的共享管理。

    一种有效安全验证的彩票销售兑奖方法

    公开(公告)号:CN101894343A

    公开(公告)日:2010-11-24

    申请号:CN201010188769.2

    申请日:2010-06-01

    Abstract: 一个有效安全验证的彩票销售兑奖方法,该方法将指纹验证技术与密码验证技术引入到彩票销售与兑奖系统,该方法包括以下功能:(1)彩票销售安全方法;(2)彩票兑奖安全方法;(3)彩票系统管理方法。顾客或者彩民在购买彩票时,需要进行指纹采集与验证,并根据用户的个人选择是否需要设置兑奖验证密码。在顾客或者彩民兑奖时,除了对彩票信息验证以外,将对与该彩票在购买时所关联的指纹由兑奖者进行指纹验证,如果指纹验证不能通过,则视为无法兑奖。如果顾客或彩民在购买该彩票时设置了兑奖密码,还需要进行兑奖密码验证,如果兑奖密码验证不通过,则无法兑奖。通过指纹验证与兑奖密码验证,有效地保护了彩票持有人的合法权益与兑奖安全。

    一种基于虚拟化技术的多国语言信息查询平台

    公开(公告)号:CN101894169A

    公开(公告)日:2010-11-24

    申请号:CN201010252023.3

    申请日:2010-08-12

    Abstract: 一种基于虚拟化技术的多国语言信息查询平台,所述平台在一台没有安装任何操作系统的物理计算机上构建,然后利用所述平台在这台物理计算机上创建多台虚拟化计算机,并实现多台虚拟计算机与互联网的连通,在这多台虚拟计算机上安装单位提供的多国语言信操作系统以及相对应的多国语言信息查询软件、相关数据库或者网络设置,在多个虚拟机系统之上通过虚拟机管理软件实现对多个虚拟机系统的快速切换,并设置一个信息平台使用监控系统与多国语言信息查询系统选择界面。本发明所公开的多国语言信息查询平台基于虚拟化技术构建在一台计算机系统之上,能同时提供多国语言版本的操作系统与信息查询平台,既节约了硬件成本,又提高了信息平台的利用率。

    一种融合多组学数据的网络标志物识别方法

    公开(公告)号:CN115019884B

    公开(公告)日:2023-11-03

    申请号:CN202210524968.9

    申请日:2022-05-13

    Abstract: 本发明公开了一种融合多组学数据的网络标志物识别方法,该方法同时融合全基因组数据(单核苷酸多态性)、转录组(基因表达谱数据)以及蛋白组(蛋白质相互作用网络数据),能够比较正常组与患者组之间基因相互作用网络的差异以识别网络标志物,这些网络标志物可能包含了潜在的致病基因。为验证该方法的有效性,将其应用识别阿尔茨海默症不同疾病进展期的网络标志物,结果表明该方法所提取的网络标志物具有较好的样本区分能力。

    一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法

    公开(公告)号:CN114974435B

    公开(公告)日:2024-04-09

    申请号:CN202210509532.2

    申请日:2022-05-10

    Abstract: 本申请涉及一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法,它包括如下步骤:S1:选择特征基因;S2:计算细胞类型差异;S3:计算细胞状态差异;S4:计算细胞间的距离;S5:根据步骤S4中得到的细胞间的距离构建距离矩阵Wα和邻接矩阵Wfinal;S6:在邻接矩阵Wfinal上实施谱聚类。本发明能够有效处理表达矩阵中存在大量零表达的情形,有效减少单细胞数据固有噪声的影响,可应用于单细胞数据集的细胞鉴定和衡量肿瘤内异质性分析。

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