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公开(公告)号：CN112837415B
公开(公告)日：2024-12-24
申请号：CN202110177072.3
申请日：2021-02-07
Applicant: 浙江工业大学 , 北京计算科学研究中心
Abstract: 一种蛋白质冷冻电镜投影图像的三维结构重建方法，包括以下步骤：步骤1：对自编码器神经网络模型进行初始化，生成初始种群N个隐向量；步骤2：将隐向量通过解码器转换为为实空间的三维模型；步骤3：计算三维模型在对应方位角度的投影；步骤4：将计算得到的投影与用户输入投影计算差值；步骤5：使用遗传算法，更新隐向量，通过迭代搜索具有更小差值的三维模型及其方位角。本发明提供了一种根据少量投影重构蛋白质三维模型的方法，所需投影数量少，计算速度快，对噪声的容忍度高，输出的结果可以为进一步了解蛋白质三维结构提供参考。
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公开(公告)号：CN108875298A
公开(公告)日：2018-11-23
申请号：CN201810579614.8
申请日：2018-06-07
Applicant: 北京计算科学研究中心
Abstract: 本发明提供了一种基于分子形状匹配的药物筛选方法，其包括：根据目标形状，利用三维Zernike函数计算目标形状的展开系数Cnlm标和形状描述因子Fnl标；利用三维Zernike函数，计算化合物库中每个化合物的展开系数Cnlm分子和形状描述因子Fnl分子；通过比对每个化合物的Fnl分子与Fnl标之间的差异性，对化合物库进行初步筛选；以及再将初次筛选后得到的备选化合物的Cnlm分子与Cnlm标进行对比，对备选化合物进行二次筛选。该筛选方法，通过分步衡量化合物库中每个化合物与目标形状的相似性，极大的降低了筛选过程中的计算量，大幅缩减了备选分子的数目，筛选效率高、且增加药物筛选的成功率。
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公开(公告)号：CN112837415A
公开(公告)日：2021-05-25
申请号：CN202110177072.3
申请日：2021-02-07
Applicant: 浙江工业大学 , 北京计算科学研究中心
Abstract: 一种蛋白质冷冻电镜投影图像的三维结构重建方法，包括以下步骤：步骤1：对自编码器神经网络模型进行初始化，生成初始种群N个隐向量；步骤2：将隐向量通过解码器转换为为实空间的三维模型；步骤3：计算三维模型在对应方位角度的投影；步骤4：将计算得到的投影与用户输入投影计算差值；步骤5：使用遗传算法，更新隐向量，通过迭代搜索具有更小差值的三维模型及其方位角。本发明提供了一种根据少量投影重构蛋白质三维模型的方法，所需投影数量少，计算速度快，对噪声的容忍度高，输出的结果可以为进一步了解蛋白质三维结构提供参考。
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公开(公告)号：CN108875298B
公开(公告)日：2019-06-07
申请号：CN201810579614.8
申请日：2018-06-07
Applicant: 北京计算科学研究中心
IPC: G16C10/00
Abstract: 本发明提供了一种基于分子形状匹配的药物筛选方法，其包括：根据目标形状，利用三维Zernike函数计算目标形状的展开系数Cnlm标和形状描述因子Fnl标；利用三维Zernike函数，计算化合物库中每个化合物的展开系数Cnlm分子和形状描述因子Fnl分子；通过比对每个化合物的Fnl分子与Fnl标之间的差异性，对化合物库进行初步筛选；以及再将初次筛选后得到的备选化合物的Cnlm分子与Cnlm标进行对比，对备选化合物进行二次筛选。该筛选方法，通过分步衡量化合物库中每个化合物与目标形状的相似性，极大的降低了筛选过程中的计算量，大幅缩减了备选分子的数目，筛选效率高、且增加药物筛选的成功率。
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