公开(公告)号：CN117625755A

公开(公告)日：2024-03-01

申请号：CN202210975288.9

申请日：2022-08-15

Applicant: 北京大学第一医院

Inventor： 李学松 ,  周利群 ,  何世明 ,  熊耕砚 ,  夏漫城

IPC: C12Q1/6858 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了GDF15基因甲基化检测方法，包括以下步骤：步骤一，引物设计；步骤二，样本收集；步骤三，核酸提取；步骤四，亚硫酸氢盐转化；步骤五，甲基化检测；本发明采用耐U特异性Taq酶进行PCR扩增，避免了普通Taq酶和高保真Taq酶与亚硫酸氢盐转化过程中大量未甲基化的C转变为U，造成无法PCR扩增的情况出现；利用以亚硫酸氢盐转化产物为模板，分别测试不同退火温度下的PCR扩增情况，温度梯度为55℃，56℃，57℃，58℃，59℃，60℃，61℃，62℃，保证适宜的反应温度；对于GDF15基因甲基化修饰的实验流程合理高效，对不同浓度的引物进行测试，得出0.4μM浓度的时候的GDF15‑F4/R4引物对的扩增效果最好，有利于保证引物对的合理选择。

公开(公告)号：CN117587123A

公开(公告)日：2024-02-23

申请号：CN202210974727.4

申请日：2022-08-15

Applicant: 北京大学第一医院

Inventor： 周利群 ,  李学松 ,  熊耕砚 ,  何世明 ,  夏漫城

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了TMEFF2基因启动子甲基化检测方法，包括以下步骤：步骤一，引物设计；步骤二，样本收集；步骤三，样本核酸提取；步骤四，亚硫酸氢盐转化；步骤五，TMEFF2基因启动子区甲基化序列检测；本发明相较于现有的TMEFF2生物标志物蛋白水平的检测，通过对TMEFF2基因甲基化状态进行检测，可以更早的发现基因表达水平的变化，能够在早期发现相应标志物的表达趋势，进而对疾病状态做出相应的预测，有利于判断受检者的患病风险，实现早筛早诊；本发明采用了最优的Taq酶、退火温度、引物对、引物浓度和模板input量设计，以及精确的参数控制，保证了检测结果的准确性，所提供的详细操作过程对基因甲基化检测具有重要的指导意义。

公开(公告)号：CN118604355A

公开(公告)日：2024-09-06

申请号：CN202410698702.5

申请日：2024-05-31

Applicant: 北京大学第一医院(北京大学第一临床医学院)

Inventor： 李学松 ,  韩冠鹏 ,  许洋洋 ,  李志华 ,  何世明 ,  周利群

IPC: G01N33/68 ,  G01N21/78 ,  G01N21/31

Abstract: 本发明属于生物医药技术领域，具体涉及一种梗阻性肾病的诊断标志物或标志物组合物及其应用。该诊断标志物或标志物组合物包括C5、A2M、CFH、HP、FGB中的任一种或多种。本发明研究发现，尿液C5、A2M、CFH、HP和FGB作为梗阻性肾病早期无创诊断标志物具有极大的潜力；且尿蛋白肌酐比相较于蛋白质浓度具有更好的预测梗阻性肾损伤的能力。利用本发明所提供的标志物和检测方法，可以在血肌酐尚未升高前实现梗阻性肾病的有效诊断，且安全无创，成本低廉。本发明对梗阻性肾病的早期无创诊断具有重要意义。

公开(公告)号：CN113355422B

公开(公告)日：2022-11-22

申请号：CN202110762353.5

申请日：2021-07-06

Applicant: 北京大学第一医院

Inventor： 熊耕砚 ,  何世明 ,  何志嵩 ,  周利群

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途，所述的用于人肿瘤分级的基因组合由基因集A和基因片段集B组成，所述用于人肿瘤分级的基因组合是从北京大学第一医院的实际肾癌病例的高通量测序数据中，通过特定的配对聚类分析得来，来源于真实的数据具有更高的可靠性和可信度，可以准确针对肾癌、泛癌进行恶性程度分级和预后预测。

公开(公告)号：CN113025716A

公开(公告)日：2021-06-25

申请号：CN202110332750.9

申请日：2021-03-26

Applicant: 北京大学第一医院

Inventor： 熊耕砚 ,  何世明 ,  何志嵩 ,  周利群

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途，所述的用于人肿瘤分级的基因组合由基因集A和基因片段集B组成，所述用于人肿瘤分级的基因组合是从北京大学第一医院的实际肾癌病例的高通量测序数据中，通过特定的配对聚类分析得来，来源于真实的数据具有更高的可靠性和可信度，可以准确针对肾癌进行恶性程度分级和预后预测。

公开(公告)号：CN113355422A

公开(公告)日：2021-09-07

申请号：CN202110762353.5

申请日：2021-07-06

Applicant: 北京大学第一医院

Inventor： 熊耕砚 ,  何世明 ,  何志嵩 ,  周利群

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途，所述的用于人肿瘤分级的基因组合由基因集A和基因片段集B组成，所述用于人肿瘤分级的基因组合是从北京大学第一医院的实际肾癌病例的高通量测序数据中，通过特定的配对聚类分析得来，来源于真实的数据具有更高的可靠性和可信度，可以准确针对肾癌、泛癌进行恶性程度分级和预后预测。