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公开(公告)号:CN119661649A
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202411836816.8
申请日:2024-12-13
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种广谱抗菌肽及其应用。本发明基于人工智能筛选方法,从蟾蜍的蛋白质组中识别出一条广谱抗菌肽IYKILQLFHKRFKKGFFG。该抗菌肽带6个正电荷,序列中的GRAVY疏水性为‑0.06,疏水矩0.522,表现出两亲性的特点;且序列长度较短,易于合成,成本较低。经实验测试,这条抗菌肽可抑制包括4种革兰氏阴性菌株和7种革兰氏阳性菌株——共11种不同菌株的生长,是一条广谱抗菌肽。同时,这条抗菌肽的半最大溶血浓度和半最大细胞毒性浓度均大于128μg/mL,具有良好的生物安全性,可应用于抗菌药物和其他抗菌产品(如消毒剂、洗涤剂、饲料添加剂)中。
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公开(公告)号:CN114948038B
公开(公告)日:2022-09-30
申请号:CN202210900488.8
申请日:2022-07-28
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
Abstract: 本发明提供一种经导管微创血管自动吻合装置,包括:血管缝合器、装载鞘管组件、保护鞘管组件和推送杆组件。在血管手术时设置通道鞘管,以构造为穿过宿主血管壁的进出通道。保护鞘管组件可拔插地设置在通道鞘管上,保护鞘管组件被构造为手术器械及移植血管进出的保护通道。装载鞘管组件可拔插地设置在保护鞘管组件上,并通过保护鞘管组件形成的保护通道将设置在装载鞘管组件上的手术器械输送至血管手术位置。血管缝合器可开合地设置在装载鞘管组件的端部,并与推送杆组件传动连接,推送杆组件可拔插地设置在装载鞘管组件上,并驱动血管缝合器可操作地对宿主血管壁进行缝合操作。本发明能降低血管吻合手术的难度,提供更为安全的外科手术条件。
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公开(公告)号:CN114948038A
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN202210900488.8
申请日:2022-07-28
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
Abstract: 本发明提供一种经导管微创血管自动吻合装置,包括:血管缝合器、装载鞘管组件、保护鞘管组件和推送杆组件。在血管手术时设置通道鞘管,以构造为穿过宿主血管壁的进出通道。保护鞘管组件可拔插地设置在通道鞘管上,保护鞘管组件被构造为手术器械及移植血管进出的保护通道。装载鞘管组件可拔插地设置在保护鞘管组件上,并通过保护鞘管组件形成的保护通道将设置在装载鞘管组件上的手术器械输送至血管手术位置。血管缝合器可开合地设置在装载鞘管组件的端部,并与推送杆组件传动连接,推送杆组件可拔插地设置在装载鞘管组件上,并驱动血管缝合器可操作地对宿主血管壁进行缝合操作。本发明能降低血管吻合手术的难度,提供更为安全的外科手术条件。
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公开(公告)号:CN119832985A
公开(公告)日:2025-04-15
申请号:CN202411945874.4
申请日:2024-12-27
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种改造任意多肽序列为抗菌肽的方法,属于生物信息技术领域。本发明开发了用于预测多肽的抗菌活性分数的超图神经网络预测器,对预训练蛋白质语言模型进行偏向于捕捉抗菌肽序列特征的微调训练,并训练用于选择多肽序列中的待突变氨基酸位点的策略网络;对于任意起始多肽序列,首先通过策略网络选择待突变氨基酸位点,然后由微调后的蛋白质语言模型给出该位点突变后氨基酸类型,再由超图神经网络预测器预测突变后序列的抗菌活性分数,迭代执行该过程,直到获得理想的抗菌肽序列输出。该方法有能力将任意多肽序列改造为抗菌肽,改造后多肽的抗菌活性得分获得大幅度提升,可应用于抗菌药物的实际开发,为解决耐药细菌感染奠定基础。
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公开(公告)号:CN119591677A
公开(公告)日:2025-03-11
申请号:CN202411836819.1
申请日:2024-12-13
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种成孔抗菌肽及其应用。本发明利用自主开发的机器学习筛选流程从蟾蜍的蛋白质组中进行筛选,预测短肽序列的膜接触概率、抗菌能力、理化性质等,获得了一条成孔抗菌肽KKIASIIYAHVKALRARKILDNLKRLAANRP。经测试,该抗菌肽可以在膜上成孔,破坏细胞膜,发挥广谱抗菌作用,并具有较低的溶血活性和细胞毒性,是理想的抗菌药物开发对象。
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公开(公告)号:CN119785893A
公开(公告)日:2025-04-08
申请号:CN202411836822.3
申请日:2024-12-13
Applicant: 北京大学
IPC: G16B40/20 , G16B30/00 , G06F18/2411 , G06N20/10
Abstract: 本发明公开了一种破膜抗菌肽的预测筛选方法,属于生物信息技术领域。本发明开发一个基于机器学习的序列分类器,在蛋白质组上进行高通量筛选,将可与膜接触的且二级结构主要为螺旋的多肽序列输入序列分类器预测是否为抗菌肽序列;对于序列分类器筛选出的序列,进一步筛选净电荷为正、较为疏水的序列,通过序列比对验证其新颖性,然后统计膜接触概率平均值,结合形成反平行二聚体的寡聚可能性,筛选出具有破膜特征的抗菌肽序列。本发明开发的基于机器学习的序列分类器预测抗菌肽的准确率优于现有方法,通过上述筛选方法成功获得了一系列破膜抗菌肽,具有较好的抑菌活性和较低的毒性,是理想的抗菌药物开发对象。
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公开(公告)号:CN119751622A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202411945872.5
申请日:2024-12-27
Applicant: 北京大学
IPC: C07K14/46 , A23K20/147 , A61K38/16 , A61P31/04 , A01N43/38 , A01P1/00 , C11D3/48 , C11D3/37 , C11D3/60
Abstract: 本发明公开了抗菌肽Ascaphin‑5改造体及其应用,属于生物医药领域。本发明自主开发的人工智能模型对天然抗菌肽Ascaphin‑5进行了改造,对其氨基酸序列在8个位置引入突变,获得了改造体抗菌肽Perceptide05(GIKKWIKGWAKKLIKKVAKKIAKQ)和Perceptide07(GIKKWIKGAIKKLIKKVAKWIWKQ)。改造体抗菌肽Perceptide05和Perceptide07可有效提升Ascaphin‑5的抗菌活性,其最小抑菌浓度值最高可降低64倍(即活性提升64倍),且可同时有效抑制革兰氏阴性细菌和革兰氏阳性细菌,最小抑菌浓度分别可达0.25μM和0.5μM,可用于新一代抗菌药物和抗菌产品的开发。
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公开(公告)号:CN119751603A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202411945871.0
申请日:2024-12-27
Applicant: 北京大学
IPC: C07K14/195 , A23K20/147 , A61K38/16 , A61P31/04 , A01N47/44 , A01P1/00 , C11D3/48 , C11D3/37 , C11D3/60
Abstract: 本发明公开了一种从信号肽改造的抗菌肽及其应用,属于生物医药领域。本发明利用人工智能模型对信号肽进行突变改造,提供了一种从信号肽改造而来的抗菌肽Perceptide17,其序列为VKKRLLFRKPLLKLFLLFGRRLKA。经测试,该抗菌肽对革兰氏阳性菌株和革兰氏阴性菌株均具有良好的抑菌活性,最小抑菌浓度可达1μM;且溶血活性低,半数溶血浓度HC50大于128μM,与细菌内膜和人类细胞膜的相互作用表现出选择性,可用于抗菌药物和抗菌产品的开发。
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公开(公告)号:CN119751594A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202411945869.3
申请日:2024-12-27
Applicant: 北京大学
IPC: C07K14/00 , A23K20/147 , A61K38/16 , A61P31/04 , A01N47/44 , A01P1/00 , C11D3/48 , C11D3/37 , C11D3/60
Abstract: 本发明公开了人工智能设计抗菌肽及其应用,属于生物医药领域。本发明通过通过自主研发的人工智能模型,基于随机起始序列DGWTMVKARYIERFMRGLRGFHIKAA逐步进行7次突变,得到一系列共7条抗菌肽。经测试,这7条全新抗菌肽可有效抑制细菌生长,特别是革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌,其中一条抗菌肽对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的抑制效果均出色,平均最小抑菌浓度小于3μM。这些抗菌肽可为开发新一代抗菌药物和抗菌产品提供依据和基础。
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公开(公告)号:CN119661650A
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202411836818.7
申请日:2024-12-13
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种破膜抗菌肽及其应用。本发明基于人工智能筛选方法,从蟾蜍的蛋白质组中识别出一种破膜抗菌肽KLAKLLKLLLWAQNELDQKK,带3个正电荷,50%的氨基酸为疏水氨基酸。经实验测试,该抗菌肽可抑制包括革兰氏阴性菌株和革兰氏阳性菌株在内共10种不同菌株的生长;同时,该抗菌肽的半最大溶血浓度和半最大细胞毒性浓度均大于128μg/mL,具有良好的生物安全性。抗菌肽通过破坏细胞膜发挥抗菌作用,具有不易导致细菌出现耐药性的特点,是理想的抗菌药物和消毒剂、洗涤剂、饲料添加剂等抗菌产品的开发对象。
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