公开(公告)号：CN119832985A

公开(公告)日：2025-04-15

申请号：CN202411945874.4

申请日：2024-12-27

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  董睿涵 ,  曹秋实

IPC: G16B20/50 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06N3/042

Abstract: 本发明公开了一种改造任意多肽序列为抗菌肽的方法，属于生物信息技术领域。本发明开发了用于预测多肽的抗菌活性分数的超图神经网络预测器，对预训练蛋白质语言模型进行偏向于捕捉抗菌肽序列特征的微调训练，并训练用于选择多肽序列中的待突变氨基酸位点的策略网络；对于任意起始多肽序列，首先通过策略网络选择待突变氨基酸位点，然后由微调后的蛋白质语言模型给出该位点突变后氨基酸类型，再由超图神经网络预测器预测突变后序列的抗菌活性分数，迭代执行该过程，直到获得理想的抗菌肽序列输出。该方法有能力将任意多肽序列改造为抗菌肽，改造后多肽的抗菌活性得分获得大幅度提升，可应用于抗菌药物的实际开发，为解决耐药细菌感染奠定基础。

公开(公告)号：CN119751594A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202411945869.3

申请日：2024-12-27

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  董睿涵 ,  曹秋实

IPC: C07K14/00 ,  A23K20/147 ,  A61K38/16 ,  A61P31/04 ,  A01N47/44 ,  A01P1/00 ,  C11D3/48 ,  C11D3/37 ,  C11D3/60

Abstract: 本发明公开了人工智能设计抗菌肽及其应用，属于生物医药领域。本发明通过通过自主研发的人工智能模型，基于随机起始序列DGWTMVKARYIERFMRGLRGFHIKAA逐步进行7次突变，得到一系列共7条抗菌肽。经测试，这7条全新抗菌肽可有效抑制细菌生长，特别是革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌，其中一条抗菌肽对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的抑制效果均出色，平均最小抑菌浓度小于3μM。这些抗菌肽可为开发新一代抗菌药物和抗菌产品提供依据和基础。

公开(公告)号：CN119751622A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202411945872.5

申请日：2024-12-27

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  董睿涵 ,  曹秋实

IPC: C07K14/46 ,  A23K20/147 ,  A61K38/16 ,  A61P31/04 ,  A01N43/38 ,  A01P1/00 ,  C11D3/48 ,  C11D3/37 ,  C11D3/60

Abstract: 本发明公开了抗菌肽Ascaphin‑5改造体及其应用，属于生物医药领域。本发明自主开发的人工智能模型对天然抗菌肽Ascaphin‑5进行了改造，对其氨基酸序列在8个位置引入突变，获得了改造体抗菌肽Perceptide05(GIKKWIKGWAKKLIKKVAKKIAKQ)和Perceptide07(GIKKWIKGAIKKLIKKVAKWIWKQ)。改造体抗菌肽Perceptide05和Perceptide07可有效提升Ascaphin‑5的抗菌活性，其最小抑菌浓度值最高可降低64倍(即活性提升64倍)，且可同时有效抑制革兰氏阴性细菌和革兰氏阳性细菌，最小抑菌浓度分别可达0.25μM和0.5μM，可用于新一代抗菌药物和抗菌产品的开发。

公开(公告)号：CN119751603A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202411945871.0

申请日：2024-12-27

Applicant: 北京大学

Inventor： 董睿涵 ,  宋晨 ,  曹秋实

IPC: C07K14/195 ,  A23K20/147 ,  A61K38/16 ,  A61P31/04 ,  A01N47/44 ,  A01P1/00 ,  C11D3/48 ,  C11D3/37 ,  C11D3/60

Abstract: 本发明公开了一种从信号肽改造的抗菌肽及其应用，属于生物医药领域。本发明利用人工智能模型对信号肽进行突变改造，提供了一种从信号肽改造而来的抗菌肽Perceptide17，其序列为VKKRLLFRKPLLKLFLLFGRRLKA。经测试，该抗菌肽对革兰氏阳性菌株和革兰氏阴性菌株均具有良好的抑菌活性，最小抑菌浓度可达1μM；且溶血活性低，半数溶血浓度HC50大于128μM，与细菌内膜和人类细胞膜的相互作用表现出选择性，可用于抗菌药物和抗菌产品的开发。