基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统及其制备与使用方法

    公开(公告)号:CN111879941B

    公开(公告)日:2021-11-02

    申请号:CN202010623610.2

    申请日:2020-06-29

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 张成 杨静 赵楠

    Abstract: 本发明属于纳米孔检测技术领域,具体公开一种基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统及其制备与使用方法。本发明的基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统,结合固态纳米孔单分子传感器使用,其由一条线性DNA长双链及固定在其上的一个DNA四面体构成;DNA四面体内部与目标蛋白适配,目标蛋白在DNA四面体的结构内的结合位置可人工调整。本发明还提供上述系统的制备方法和使用方法。使用本发明的系统可以通过电信号分析出蛋白分子过孔时的空间位置以及过孔方向,进一步可控制蛋白的空间方向。

    一种呼出气冷凝液收集器

    公开(公告)号:CN110368039A

    公开(公告)日:2019-10-25

    申请号:CN201910739326.9

    申请日:2019-08-12

    Abstract: 本发明公开的呼出气冷凝液收集器,包括制冷系统和冷凝液收集系统,制冷系统包括一温控箱和一冷凝管套筒,冷凝管套筒的外壁上设置有蒸发器;冷凝液收集系统包括进气嘴、呼气吸气四通控制阀、冷凝管和收集杯,呼气吸气四通控制阀包括进气嘴对接口、吸气进口、呼气出口和冷凝管对接口,收集杯套设于冷凝管的外管底部及收集杯的外壁上;使用时,冷凝管套筒套接于冷凝管的外壁上。本发明公开的呼出气冷凝液采集器,安装和拆卸方便,制冷系统和冷凝液收集系统在结构上独立,病人无需坐起来接受呼出气冷凝液检测,具有人性化。

    一种单导联脑电的睡眠自动分期方法

    公开(公告)号:CN107495962B

    公开(公告)日:2020-05-05

    申请号:CN201710840703.9

    申请日:2017-09-18

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种单导联脑电的睡眠自动分期方法,包括特征提取模块和分期优化模块。其中,特征提取模块是由CNNs卷积神经网络(1)、Softmax层(2)组成;分期优化模块由双向LSTM循环神经网络(3)和CRF条件随机场模型(4)构成;(1)、(2)、(3)和(4)顺序连接。该方法仅需要单导联的睡眠脑电信号,满足便携、舒适的睡眠监测需求;结合卷积神经网络和循环神经网络充分挖掘了脑电信号的时空特征,且具有动态学习能力,能够适应变化的疾病大环境;分期优化模块充分考虑N段30s脑电数据前后之间的联系,提高分期的准确性和模型的泛化能力。

    基于DNA计算实现的图顶点着色方法

    公开(公告)号:CN101256640B

    公开(公告)日:2010-06-02

    申请号:CN200810085571.4

    申请日:2008-03-19

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及计算机技术和生物技术,特别涉及一种基于DNA计算实现图顶点着色的技术,提供一种基于DNA计算实现图顶点着色的方法。基于DNA计算获得包含任意个顶点的图顶点着色方案。包括:将待着色图划分为至少两个子图;根据给定颜色种类,基于DNA计算获得每一个子图对应的顶点着色方案集合,每一种顶点着色方案中任意两个相邻顶点着不同颜色;基于DNA计算逐步合并各子图对应的顶点着色方案,获得所述待着色图的顶点着色方案集合。

    基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统及其制备与使用方法

    公开(公告)号:CN111879941A

    公开(公告)日:2020-11-03

    申请号:CN202010623610.2

    申请日:2020-06-29

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 张成 杨静 赵楠

    Abstract: 本发明属于纳米孔检测技术领域,具体公开一种基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统及其制备与使用方法。本发明的基于自组装纳米孔的蛋白行为检测系统,结合固态纳米孔单分子传感器使用,其由一条线性DNA长双链及固定在其上的一个DNA四面体构成;DNA四面体内部与目标蛋白适配,目标蛋白在DNA四面体的结构内的结合位置可人工调整。本发明还提供上述系统的制备方法和使用方法。使用本发明的系统可以通过电信号分析出蛋白分子过孔时的空间位置以及过孔方向,进一步可控制蛋白的空间方向。

    一种单导联脑电的睡眠自动分期方法

    公开(公告)号:CN107495962A

    公开(公告)日:2017-12-22

    申请号:CN201710840703.9

    申请日:2017-09-18

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种单导联脑电的睡眠自动分期方法,包括特征提取模块和分期优化模块。其中,特征提取模块是由CNNs卷积神经网络(1)、Softmax层(2)组成;分期优化模块由双向LSTM循环神经网络(3)和CRF条件随机场模型(4)构成;(1)、(2)、(3)和(4)顺序连接。该方法仅需要单导联的睡眠脑电信号,满足便携、舒适的睡眠监测需求;结合卷积神经网络和循环神经网络充分挖掘了脑电信号的时空特征,且具有动态学习能力,能够适应变化的疾病大环境;分期优化模块充分考虑N段30s脑电数据前后之间的联系,提高分期的准确性和模型的泛化能力。

    基于环形DNA的图着色计算方法及其DNA计算系统

    公开(公告)号:CN101488197B

    公开(公告)日:2012-07-04

    申请号:CN200910078155.6

    申请日:2009-02-19

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及一种基于环形DNA的图着色计算方法,该方法包括以下步骤:根据给定颜色种类,获得图对应的顶点着色方案集合;根据所述顶点着色方案集合,在顶点数字序列不相邻但相连的边中,找出两顶点颜色未定的边;利用环形DNA分子计算,使用回溯法对所述找出的两顶点颜色未定的边进行删除非解,获得顶点着色方案真解集。本发明的技术方案将待求解图,利用DNA计算中生物操作中的并行性,并基于环形DNA计算的特点,避免了分子间重组,逐步获得所述待着色图的顶点着色方案集合,从而有机地将优化计算方法、DNA序列的编码、各种生化操作、解的检测问题与解空间规模等有机地结合起来,提高了图着色问题的求解效率。

    基于环形DNA的图着色计算方法及其DNA计算系统

    公开(公告)号:CN101488197A

    公开(公告)日:2009-07-22

    申请号:CN200910078155.6

    申请日:2009-02-19

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及一种基于环形DNA的图着色计算方法,该方法包括以下步骤:根据给定颜色种类,获得图对应的顶点着色方案集合;根据所述顶点着色方案集合,在顶点数字序列不相邻但相连的边中,找出两顶点颜色未定的边;利用环形DNA分子计算,使用回溯法对所述找出的两顶点颜色未定的边进行删除非解,获得顶点着色方案真解集。本发明的技术方案将待求解图,利用DNA计算中生物操作中的并行性,并基于环形DNA计算的特点,避免了分子间重组,逐步获得所述待着色图的顶点着色方案集合,从而有机地将优化计算方法、DNA序列的编码、各种生化操作、解的检测问题与解空间规模等有机地结合起来,提高了图着色问题的求解效率。

    一种基于化学分子基团转移的DNA存储方法及系统

    公开(公告)号:CN119068990A

    公开(公告)日:2024-12-03

    申请号:CN202310632028.6

    申请日:2023-05-30

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明提供一种基于化学分子基团转移的DNA存储方法及系统,方法包括:获取待存储数据,并将待存储数据转换成二进制数据;基于二进制数据,得到DNA长链上的修饰位点的分布信息;基于DNA长链上的修饰位点的分布信息,引入与DNA长链上的修饰位点所在的DNA区间序列所互补的功能化DNA短链,该功能化DNA短链内含有一个结合有化学修饰基团的特定化学分子;功能化DNA短链与DNA长链杂交生成杂交复合体;在杂交复合体中,DNA短链内特定化学分子上的化学基团向长链DNA的对侧分子上转移,发生化学基团转移反应。本发明利用化学基团信息取代核酸编码信息,丰富了核酸存储的内容和形式,实现并行信息处理,提高DNA存储效率,为建立新型DNA存储构架奠定基础。

    一种基于核酸特异修饰的DNA存储方法及装置

    公开(公告)号:CN117789834A

    公开(公告)日:2024-03-29

    申请号:CN202211153603.6

    申请日:2022-09-21

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 张成 钱珑 欧阳颀

    Abstract: 本发明提供一种基于核酸特异修饰的DNA存储方法及装置,方法包括:获取待存储数据,并将待存储数据转换成二进制数据;基于二进制数据,得到DNA长链上的修饰分布信息,其中,DNA长链为具有特定碱基序列的单链DNA;基于DNA长链上的修饰分布信息,引入与DNA长链上的潜在修饰位点所在的DNA区间序列互补的DNA短链,DNA短链与DNA长链杂交后生成DNA杂交复合体;基于DNA短链的类型,选用对应的生物酶,对DNA杂交复合体进行核酸特异修饰反应。本发明利用核酸特异修饰来代替核酸编码,降低了核酸存储的成本、简化了数据写入流程、支持后续对核酸存储信息读取精度的提升。

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