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公开(公告)号:CN118408794A
公开(公告)日:2024-07-30
申请号:CN202410235012.6
申请日:2024-03-01
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供了一种生物组织切片图像获取方法、系统、设备和存储介质,其中方法包括:获取生物组织样品的切片序列,将切片序列中的多个生物组织切片作为各初始生物组织切片,执行真空环境下的图像获取流程;在图像获取流程中,采集各初始生物组织切片的表面图像,对各初始生物组织切片进行减薄处理,并测量减薄处理后的各生物组织切片的切片厚度;将减薄处理后的各生物组织切片作为各初始生物组织切片执行图像获取流程,直至减薄处理后的生物组织切片的切片厚度小于等于第一厚度阈值,得到各次减薄处理后的各生物组织切片的表面图像;克服了目前图像采集效率低下,样品易被污染的缺陷,提高了图像获取效率,降低了样品被污染的风险。
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公开(公告)号:CN112381718B
公开(公告)日:2021-07-30
申请号:CN202011328722.1
申请日:2020-11-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于计算机视觉和图像处理技术领域,具体涉及了一种基于仿射变换的显微序列图像自动拼接方法、系统及装置,旨在解决现有技术无法有效解决显微图像拍摄过程中的图像变形对拼接的影响,拼接误差会出现累积和传播,因而拼接效果达不到预期的问题。本发明包括:提取显微序列图像重叠区域的特征并进行特征匹配;根据特征在图像上的位置信息,赋予每对特征点不同的权重;通过仿射变换模型拟合相邻图像间的变化,并设定全局优化的能量函数;最小化能量函数,获得各相邻图像的仿射变换关系;根据仿射变换关系进行拼接获得显微拼接图像。本发明通过全局拼接的方法,避免拼接过程中误差累积和图像边缘畸变对结果的影响,能够获得较高拼接精度的图像。
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公开(公告)号:CN109584368B
公开(公告)日:2021-05-28
申请号:CN201811213305.5
申请日:2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种生物样品三维结构的构建方法及装置,所述方法包括,获取至少两个生物样品薄片的三维图像;修正所述薄片的三维图像表面生成三维图像块;将所述三维图像块拆分为二维序列图像,并根据所述至少两个生物样品薄片的位置排列所述二维序列图像;计算所述二维序列图像的图像变形位置坐标,确定所述生物样品的三维结构。本发明能够有效处理序列薄片的不规则形变和表面不平整,并将序列薄片的三维图像在三维空间中联接起来,实现对大体量生物样品的高分辨率整体三维结构构建。
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公开(公告)号:CN112213343B
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011393781.7
申请日:2020-12-03
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: G01N23/2251 , G01N23/2202
Abstract: 本发明属于生物材料表面结构表征技术领域,具体涉及一种塑料条带承载生物超薄切片快速成像方法、系统、装置,旨在解决现有技术中塑料条带表面生物超薄切片在成像过程中速度慢、成像衬度差及易受电子辐照损伤的问题。本申请通过对塑料条带承载生物超薄切片电镜成像前准备照料;避免电镜高束流密度下成像生物切片材料表面电子辐照损伤,实现电镜图像快速获取。该方法通过调节电镜的物镜光阑孔径大小,获得相对较高的成像束流密度,控制特定计量的电子在样品表面的注入速度及作用时间,在生物超薄切片与承载塑料条带间形成电子永久保护层,进而避免正式成像时高束流密度下生物切片表面的电子辐照损伤,提高电镜成像速度。
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公开(公告)号:CN112381718A
公开(公告)日:2021-02-19
申请号:CN202011328722.1
申请日:2020-11-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于计算机视觉和图像处理技术领域,具体涉及了一种基于仿射变换的显微序列图像自动拼接方法、系统及装置,旨在解决现有技术无法有效解决显微图像拍摄过程中的图像变形对拼接的影响,拼接误差会出现累积和传播,因而拼接效果达不到预期的问题。本发明包括:提取显微序列图像重叠区域的特征并进行特征匹配;根据特征在图像上的位置信息,赋予每对特征点不同的权重;通过仿射变换模型拟合相邻图像间的变化,并设定全局优化的能量函数;最小化能量函数,获得各相邻图像的仿射变换关系;根据仿射变换关系进行拼接获得显微拼接图像。本发明通过全局拼接的方法,避免拼接过程中误差累积和图像边缘畸变对结果的影响,能够获得较高拼接精度的图像。
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公开(公告)号:CN110541156B
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN201910956375.8
申请日:2019-10-10
Applicant: 中国科学院自动化研究所 , 聚束科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明涉及薄膜制备技术,具体涉及一种用于镀膜仪制备连续导电薄膜的装置。为了解决现有方式得到的镀膜条带连续性、导电性差的问题,本发明提出的用于镀膜仪制备连续导电薄膜的装置包括基体和控制部,基体上设置有:转接口,其用于使基体连接到镀膜仪上;条带运载头,其末端固定在基体上,在基体连接于镀膜仪之后,条带运载头的前端伸入到镀膜仪的真空腔内;主腔室,在基体连接于镀膜仪之后,主腔室与镀膜仪的真空腔连通;送带卷轴和收带卷轴,其位于主腔室内;控制部能够控制送带卷轴和收带卷轴转动以使条带沿条带运载头绕转,并因此使条带从送带卷轴运转到收带卷轴上。利用本发明的装置能够有效改善制备的连续导电薄膜材料表面导电性差的问题。
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公开(公告)号:CN110533772A
公开(公告)日:2019-12-03
申请号:CN201910785748.X
申请日:2019-08-23
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于生物医学领域,具体涉及一种基于生物组织序列切片刻蚀减薄的三维图像库获取方法、系统、装置,旨在解决由于ATUM-SEM由于连续超薄切片收集难度大导致获取的三维图像库在三维重建时轴向精度低的问题。本系统方法包括获取生物组织的序列切片集合;通过刻蚀方法逐次减薄切片厚度并获取对应厚度值和对应生物组织切片图像,构建每一个序列切片对应的生物组织切片图像集;分别对每一个生物组织切片图像集中的生物组织切片图像进行配准;将配准后的生物组织切片图像集进行整体配准,得到三维图像库。本发明降低了连续超薄切片收集的难度,提高了获取的三维图像库在三维重建时的轴向精度。
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公开(公告)号:CN109584156A
公开(公告)日:2019-04-05
申请号:CN201811213303.6
申请日:2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种显微序列图像拼接方法及装置,所述方法包括:采用模板匹配算法匹配相邻图像的重叠区域,计算所述相邻图像的位置差异;根据图像间的邻接关系建立数学模型,结合BP算法计算图像的全局位置坐标,生成全局图像。本发明能够有效处理局部拼接过程中由于图像存在空白或重复区域等原因带来的误匹配,降低了局部拼接的错误匹配,具有较高的鲁棒性;而且计算速度快,自动化程度高,拼接效果好。
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公开(公告)号:CN106570484A
公开(公告)日:2017-04-19
申请号:CN201610978135.4
申请日:2016-11-07
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于序列切片的显微镜图像采集方法。该方法包括获取序列切片样本及其导航图;采用图像处理与机器学习的方法对导航图中的序列切片样本进行识别标记;将序列切片样本置于显微镜中,将导航图中任一像素点导航定位至显微镜视场中心;在低分辨率视场下定位序列切片样本,进行样本采集参数的装订;基于样本采集参数的装订,记录高分辨率采集区域的中心点与样本模板匹配后的中心点之间的相对位置关系;结合样本采集参数及相对位置关系,进行样本点的图像连续采集。通过该技术方案解决了如何高效地完成感兴趣样本区域图像的自动采集的技术问题,实现了大规模序列样本在带有自动控制接口的显微镜(电子或光学)下连续区域的自动化成像。
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公开(公告)号:CN106373116A
公开(公告)日:2017-02-01
申请号:CN201610716189.3
申请日:2016-08-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
CPC classification number: G06T7/0012 , G06T5/20 , G06T2207/10061 , G06T2207/20172 , G06T2207/30024
Abstract: 本发明公开了一种基于双光子图像的突触检测方法,其涉及模式识别和神经学技术领域。其中,该方法包括获取所述双光子图像;将所述双光子图像分为轴突图像和树突图像;在所述轴突图像中进行轴突小结的2D检测;在所述树突图像中进行树突棘的2D检测;用检测到的轴突小结和树突棘进行2D突触检测;基于2D突触检测结果,进行3D突触检测。通过本发明,提高了检测突触的效率和精度,还具有普适性,且对图像类型不敏感。
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