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公开(公告)号:CN114049252A
公开(公告)日:2022-02-15
申请号:CN202111138563.3
申请日:2021-09-27
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供一种面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统及方法,涉及显微成像技术领域,该系统包括:人机交互模块,用于确定感兴趣区域,并生成感兴趣区域的三维成像指令和配准指令;控制模块,用于根据三维成像指令,生成控制指令;接口模块,用于向扫描电镜发送控制指令,并接收扫描电镜的图像数据;存储模块,用于存储图像数据;数据处理模块,用于获取存储模块的图像数据,并根据配准指令,对图像数据进行三维配准并组合,得到三维影像,以及,将配准后的三维影像发送给人机交互模块。本发明实现从扫描电镜成像到序列切片电镜图像三维配准的一体化高通量三维成像,生物结构三维电镜影像的所见即所得。
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公开(公告)号:CN112381817A
公开(公告)日:2021-02-19
申请号:CN202011374986.0
申请日:2020-11-30
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于电镜显微成像和图像处理领域,具体涉及一种扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统、方法、装置,旨在解决现有基于透射电镜的病毒检测操作复杂、成像效率以及检测准确率低的问题。本系统包括样品获取模块,配置为获取待检测的病毒标本,并将其滴在带有支持膜的铜网上;扫描电镜成像模块,配置为得到扫描电镜透射图像;像素位置获取模块,配置为获取各病毒颗粒以及其对应的铜网方格的顶点在图像中的像素位置;变换矩阵计算模块,配置为计算从图像像素位置映射到透射电镜物理坐标的透射变换矩阵;形态结构检测模块,配置为得到每个病毒颗粒的形态结构。本发明简化了检测操作,并提高了成像效率以及检测的准确率。
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公开(公告)号:CN106407988B
公开(公告)日:2019-11-26
申请号:CN201610802612.1
申请日:2016-09-05
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于电镜序列切片图像的突触检测方法。其涉及模式识别和神经学领域,具体地,该方法包括对电镜序列切片图像进行拼接对准;接着针对拼接对准后的单层电镜序列切片图像,利用Adaboost算法进行突触检测;然后基于突触特征进行突触识别,最后利用上下文线索进行突触过滤,并基于突触过滤的结果,进行突触的三维重构。通过本发明实现了高效、精准的突触检测。
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公开(公告)号:CN107958442A
公开(公告)日:2018-04-24
申请号:CN201711287182.5
申请日:2017-12-07
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及图像拼接领域,具体涉及一种多幅显微图像拼接中的灰度校正方法及装置,目的在于解决图像拼接中的灰度不连续情况。本发明提出的灰度校正方法及装置,先从配准后的图像中选取种子图像,再根据种子图像的位置信息和灰度信息,采用增益补偿方法对图像进行粗调,采用直方图规范化的方法对图像进行细调,尽可能地达到图像与图像之间的灰度一致。然后,采用泊松图像编辑法进行图像融合,消除拼接痕迹。该灰度校正方法流程以种子图像为灰度校正的起点,减少了传统方法的误差累计和传递。由整体到局部,一步步完善校正的效果,灰度校正结果较为鲁棒,保证了切片显微图像灰度校正结果的质量。
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公开(公告)号:CN107545567A
公开(公告)日:2018-01-05
申请号:CN201710638426.3
申请日:2017-07-31
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及图像处理和神经科学领域,具体涉及一种生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置。旨在解决无法在生物组织相邻切片显微图像间寻找到真实可靠的对应点信息的问题。为此目的,本发明中提出了一种生物组织序列切片显微图像的配准方法,包括:获取生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点;调整所获取的各对应点的位置;依据调整后的各对应点的位置,对生物组织序列切片显微图像进行图像形变。通过本发明可以找到相邻切片显微图像之间真实可靠的对应点信息,从而保证了生物组织序列切片显微图像配准的精度。
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公开(公告)号:CN112381817B
公开(公告)日:2021-06-25
申请号:CN202011374986.0
申请日:2020-11-30
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于电镜显微成像和图像处理领域,具体涉及一种扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统、方法、装置,旨在解决现有基于透射电镜的病毒检测操作复杂、成像效率以及检测准确率低的问题。本系统包括样品获取模块,配置为获取待检测的病毒标本,并将其滴在带有支持膜的铜网上;扫描电镜成像模块,配置为得到扫描电镜透射图像;像素位置获取模块,配置为获取各病毒颗粒以及其对应的铜网方格的顶点在图像中的像素位置;变换矩阵计算模块,配置为计算从图像像素位置映射到透射电镜物理坐标的透射变换矩阵;形态结构检测模块,配置为得到每个病毒颗粒的形态结构。本发明简化了检测操作,并提高了成像效率以及检测的准确率。
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公开(公告)号:CN109283679B
公开(公告)日:2020-05-19
申请号:CN201811213274.3
申请日:2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种大视场光学显微图像成像装置及方法,两个光学显微成像通路分别用于获取成像物体和参照标板的光学显微图像,利用第二成像通路获取的参照标板的光学显微图像计算对应位置的第一成像通路获取成像物体的光学显微图像的像素坐标,合成所述成像物体的大视场显微图像;能够形成鲁棒的大视场光学显微图像的快速成像能力,其成像结果的正确性和实时性不受成像物体表面形貌特征和所选择的成像模态影响,满足生命科学等领域对不同模态下物体的大视场快速光学显微成像需求。
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公开(公告)号:CN106373116B
公开(公告)日:2019-04-12
申请号:CN201610716189.3
申请日:2016-08-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于双光子图像的突触检测方法,其涉及模式识别和神经学技术领域。其中,该方法包括获取所述双光子图像;将所述双光子图像分为轴突图像和树突图像;在所述轴突图像中进行轴突小结的2D检测;在所述树突图像中进行树突棘的2D检测;用检测到的轴突小结和树突棘进行2D突触检测;基于2D突触检测结果,进行3D突触检测。通过本发明,提高了检测突触的效率和精度,还具有普适性,且对图像类型不敏感。
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公开(公告)号:CN109283679A
公开(公告)日:2019-01-29
申请号:CN201811213274.3
申请日:2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种大视场光学显微图像成像装置及方法,两个光学显微成像通路分别用于获取成像物体和参照标板的光学显微图像,利用第二成像通路获取的参照标板的光学显微图像计算对应位置的第一成像通路获取成像物体的光学显微图像的像素坐标,合成所述成像物体的大视场显微图像;能够形成鲁棒的大视场光学显微图像的快速成像能力,其成像结果的正确性和实时性不受成像物体表面形貌特征和所选择的成像模态影响,满足生命科学等领域对不同模态下物体的大视场快速光学显微成像需求。
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公开(公告)号:CN111582214A
公开(公告)日:2020-08-25
申请号:CN202010414134.3
申请日:2020-05-15
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于计算机视觉、深度学习和生物学、动物行为学领域,具体涉及一种基于孪生网络的笼养动物行为分析方法、系统、装置,旨在解决现有跨物种笼养动物实时行为分析方法需要大量的跨物种标注数据以及检测分析精细度、准确率较低的问题。本系统方法包括:获取待分析目标在第t帧图像中的搜索区域;通过孪生子网络分别提取搜索区域、预设的目标区域、预设的背景区域的特征;基于提取的特征,分别通过区域生成网络、蒙版子网络获取待分析目标的检测区域、mask;迭代获取设定帧数内的检测区域、mask,并通过预设的聚类方法,得到待分析目标在设定帧数内的运动状态。本发明减少了对标注数据的需求,提高了效率以及检测分析的精细度、准确率。
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