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公开(公告)号：CN112575094B
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202011506211.4
申请日：2020-12-18
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于鉴定大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种的InDel标记及其应用，其中，该InDel分子标记为在大口黑鲈北方亚种20号染色体第8035398～8035480位，具有长度为82bp的插入/缺失核苷酸序列。本发明中的InDel分子标记可以同时对大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种进行鉴定，与常规只能鉴定大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种的SNP标记相比，适用范围更广，实用性更好，而且不受大口黑鲈发育时期和环境因素的影响，鉴定结果准确率高。
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公开(公告)号：CN111073983A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN202010065650.X
申请日：2020-01-20
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/12
摘要： 本发明公开了一种与大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种鉴定相关的SNP标记及其应用，本发明SNP标记由位于大口黑鲈NCCRP-1基因的基因组序列SEQ ID NO:1的第202位的SNP位点，以及第76位和第132-133位碱基处的插入缺失突变位点组成，这三个位点完全连锁。利用本发明的SNP位点，具有目的性强、准确度高的优点，且操作简单、检测快速，便于广泛推广使用，快速对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行鉴定，为原种保留、种质提高提供可靠依据。
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公开(公告)号：CN112575094A
公开(公告)日：2021-03-30
申请号：CN202011506211.4
申请日：2020-12-18
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于鉴定大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种的InDel标记及其应用，其中，该InDel分子标记为在大口黑鲈北方亚种20号染色体第8035398～8035480位，具有长度为82bp的插入/缺失核苷酸序列。本发明中的InDel分子标记可以同时对大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种进行鉴定，与常规只能鉴定大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种的SNP标记相比，适用范围更广，实用性更好，而且不受大口黑鲈发育时期和环境因素的影响，鉴定结果准确率高。
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公开(公告)号：CN111073983B
公开(公告)日：2020-11-24
申请号：CN202010065650.X
申请日：2020-01-20
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/12
摘要： 本发明公开了一种与大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种鉴定相关的SNP标记及其应用，本发明SNP标记由位于大口黑鲈NCCRP‑1基因的基因组序列SEQ ID NO:1的第202位的SNP位点，以及第76位和第132‑133位碱基处的插入缺失突变位点组成，这三个位点完全连锁。利用本发明的SNP位点，具有目的性强、准确度高的优点，且操作简单、检测快速，便于广泛推广使用，快速对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行鉴定，为原种保留、种质提高提供可靠依据。
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公开(公告)号：CN111057772B
公开(公告)日：2020-12-29
申请号：CN202010067414.1
申请日：2020-01-20
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12N15/12
摘要： 本发明公开了一种与草鱼快速生长相关的SNP标记及其应用，本发明与草鱼快速生长有关的SNP标记位于草鱼SLα基因组序列的第2903位和8014位碱基。若是，则为缓慢生长的草鱼；否则为快速生长的草鱼。本发明SNP标记，在生产中去除第2903和8014位的单倍型AGTT草鱼个体，能够有效用于草鱼的分子标记辅助育种，挑选合适的基因型草鱼亲本进行繁殖，可获得生长快的草鱼，加快草鱼育种。
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公开(公告)号：CN111057772A
公开(公告)日：2020-04-24
申请号：CN202010067414.1
申请日：2020-01-20
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12N15/12
摘要： 本发明公开了一种与草鱼快速生长相关的SNP标记及其应用，本发明与草鱼快速生长有关的SNP标记位于草鱼SLα基因组序列的第2903位和8014位碱基。若是，则为缓慢生长的草鱼；否则为快速生长的草鱼。本发明SNP标记，在生产中去除第2903和8014位的单倍型AGTT草鱼个体，能够有效用于草鱼的分子标记辅助育种，挑选合适的基因型草鱼亲本进行繁殖，可获得生长快的草鱼，加快草鱼育种。
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公开(公告)号：CN110041422B
公开(公告)日：2022-07-19
申请号：CN201810037972.6
申请日：2018-01-16
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号： C07K14/46
摘要： 本发明公开了大口黑鲈生长相关的SNP位点及其应用，所述生长相关的SNP位点位于HSC70‑1基因序列第821、2804位碱基。本发明发现在HSC70‑1的C+821G位置存在等位基因C和等位基因G，组成三种基因型CC、GC和GG，在A+2804T位置存在等位基因A和等位基因T，组成三种基因型AA、AT和TT。当第821和2804碱基位置基因型为CC和TT的个体的生长性状明显优于其他基因型的个体。利用该现象将生产中保留CC和TT基因型的大口黑鲈亲本，去除其他基因型的个体，便可快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈品种，即本发明SNP位点可应用于快速生长大口黑鲈亲本的筛选。
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公开(公告)号：CN107034307A
公开(公告)日：2017-08-11
申请号：CN201710478727.4
申请日：2017-06-22
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所
摘要： 本发明涉及一种SNP标记，尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用，所述SNP标记是位于SEQ ID NO.1序列2533bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记，不同的SNP标记对应的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实，在此基础上，利用该SNP标记，可以进行大口黑鲈的筛选或检测，或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测，在大口黑鲈的养殖或选育领域，都具有积极的效果，及在此基础上，开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒，具有很大的科学价值和商业价值。
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公开(公告)号：CN105505927A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201610063828.0
申请日：2016-01-29
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所
CPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q2600/156 , C12Q2521/301
摘要： 本发明提供一种草鱼耐糖性能相关的SNP标记及其应用，包括两个SNP位点H3和H4，所述H3位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列中自5′端起第1817位，且该位置处碱基为T或C；所述H4位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列中自5′端起第1818位，且该位置处碱基为G或T。本发明的SNP标记与草鱼耐糖性能密切相关，能够有效用于鉴定或选育耐高糖的草鱼品种。
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公开(公告)号：CN101906477A
公开(公告)日：2010-12-08
申请号：CN201010243529.8
申请日：2010-08-03
申请人： 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 转红色荧光蛋白基因唐鱼聚合酶链式反应（PCR）检测方法，涉及对转红色荧光蛋白基因唐鱼特异的检测方法。根据外源的红色荧光蛋白基因序列设计了一对特异性扩增红色荧光蛋白基因的引物，经过优化反应体系和反应条件，认为退火温度64℃为最适的退火温度，以转红色荧光蛋白基因唐鱼基因组DNA为模板扩增出一条487bp的片段，以野生型唐鱼基因组DNA为模板进行扩增，没有扩增产物。本检测方法可早期鉴定转红色荧光蛋白基因唐鱼，甚至小鱼在出苗前就可以进行检测；检测速度快；在检测时可以设阳性对照（以含有红色荧光蛋白基因的质粒pDsRed-mylz2为PCR模板）和阴性对照（以水为模板），所以检测结果十分准确，成本低。
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