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公开(公告)号:CN103993081B
公开(公告)日:2015-11-04
申请号:CN201410209290.0
申请日:2014-05-16
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 佛山市南海百容水产良种有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
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公开(公告)号:CN102242222A
公开(公告)日:2011-11-16
申请号:CN201110205243.5
申请日:2011-07-21
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了基于EST-SSR标记的草鱼分类方法。方法包括提取草鱼的DNA,使用EST-SSR标记扩增,根据扩增结果分析出草鱼的遗传结构。本发明方法与传统的方法相比,具有目的性强,作用效果直接的优点。且操作简单、检测快速、检测成本低,便于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN101921850A
公开(公告)日:2010-12-22
申请号:CN201010243530.0
申请日:2010-08-03
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
Abstract: 高孵化率大口黑鲈亲本的分子标记筛选方法,涉及大口黑鲈的生产育种方法。利用大口黑鲈促生长激素释放激素(growth hormone releasing hormone,GHRH)基因启动子序列上一个66bp长度的隐性致死缺失突变位点侧冀序列,设计了一对引物,对待选择作亲本的大口黑鲈DNA样品进行PCR检测,扩增片段只有308bp一条带的是AA基因型个体,扩增片段有308bp和242bp两条带的是AB基因型个体。在生产中要去除AB基因型的亲本个体,保留AA基因型的亲本个体,以提高大口黑鲈的孵化率。本方法大约在5个小时内完成,为接下来的大口黑鲈苗种生产提供快速准确的检测结果,去除含有B缺失基因型的亲本个体,从根本上提高鱼的种质质量,提高大口黑鲈的孵化率。
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公开(公告)号:CN107034307A
公开(公告)日:2017-08-11
申请号:CN201710478727.4
申请日:2017-06-22
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
Abstract: 本发明涉及一种SNP标记,尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记是位于SEQ ID NO.1序列2533bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记,不同的SNP标记对应的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实,在此基础上,利用该SNP标记,可以进行大口黑鲈的筛选或检测,或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测,在大口黑鲈的养殖或选育领域,都具有积极的效果,及在此基础上,开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒,具有很大的科学价值和商业价值。
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公开(公告)号:CN105505927A
公开(公告)日:2016-04-20
申请号:CN201610063828.0
申请日:2016-01-29
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q2600/156 , C12Q2521/301
Abstract: 本发明提供一种草鱼耐糖性能相关的SNP标记及其应用,包括两个SNP位点H3和H4,所述H3位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列中自5′端起第1817位,且该位置处碱基为T或C;所述H4位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列中自5′端起第1818位,且该位置处碱基为G或T。本发明的SNP标记与草鱼耐糖性能密切相关,能够有效用于鉴定或选育耐高糖的草鱼品种。
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公开(公告)号:CN101906477A
公开(公告)日:2010-12-08
申请号:CN201010243529.8
申请日:2010-08-03
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 转红色荧光蛋白基因唐鱼聚合酶链式反应(PCR)检测方法,涉及对转红色荧光蛋白基因唐鱼特异的检测方法。根据外源的红色荧光蛋白基因序列设计了一对特异性扩增红色荧光蛋白基因的引物,经过优化反应体系和反应条件,认为退火温度64℃为最适的退火温度,以转红色荧光蛋白基因唐鱼基因组DNA为模板扩增出一条487bp的片段,以野生型唐鱼基因组DNA为模板进行扩增,没有扩增产物。本检测方法可早期鉴定转红色荧光蛋白基因唐鱼,甚至小鱼在出苗前就可以进行检测;检测速度快;在检测时可以设阳性对照(以含有红色荧光蛋白基因的质粒pDsRed-mylz2为PCR模板)和阴性对照(以水为模板),所以检测结果十分准确,成本低。
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公开(公告)号:CN106957921B
公开(公告)日:2020-12-29
申请号:CN201710352498.1
申请日:2017-05-18
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开一种适合食人工配合饲料大口黑鲈相关SNP基因位点,所述SNP基因位点为三个紧密连锁的SNP位点,所述三个SNP位点分别为位于大口黑鲈klotho基因2089bp处的C‑T型SNP、位于大口黑鲈klotho基因2128bp处的G‑A型SNP和位于大口黑鲈klotho基因3212bp处的A‑G型SNP。由于其紧密连锁,我们将其视为一个SNP位点(用位于大口黑鲈klotho基因3212bp处的A‑G型SNP表示)来研究,所述大口黑鲈klotho基因序列如SEQ ID NO.1所示。本发明所述SNP基因位点,可用于选育易驯食人工配合饲料的大口黑鲈。
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公开(公告)号:CN107022647A
公开(公告)日:2017-08-08
申请号:CN201710479605.7
申请日:2017-06-22
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
Abstract: 本发明涉及一种SNP标记,尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记为SEQ ID NO.2序列284bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记,SNP标记不同的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实,在此基础上,利用该SNP标记,可以进行大口黑鲈的筛选或检测,或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测,在大口黑鲈的养殖或选育领域,都具有积极的效果,及在此基础上,开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒,具有很大的科学价值和商业价值。
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公开(公告)号:CN103993081A
公开(公告)日:2014-08-20
申请号:CN201410209290.0
申请日:2014-05-16
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 佛山市南海百容水产良种有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
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公开(公告)号:CN107034307B
公开(公告)日:2020-11-24
申请号:CN201710478727.4
申请日:2017-06-22
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种SNP标记,尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记是位于SEQ ID NO.1序列2533bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记,不同的SNP标记对应的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实,在此基础上,利用该SNP标记,可以进行大口黑鲈的筛选或检测,或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测,在大口黑鲈的养殖或选育领域,都具有积极的效果,及在此基础上,开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒,具有很大的科学价值和商业价值。
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