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公开(公告)号:CN113564262A
公开(公告)日:2021-10-29
申请号:CN202110572002.8
申请日:2021-05-25
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种新的鉴定或辅助鉴定淡水鱼类物种的PCR引物(16s 200),所述引物的核苷酸序列为序列表中的SEQ ID NO.1。该PCR引物用于鱼类线粒体DNA序列的eDNA代谢编码。采用该PCR引物对水体中的eDNA进行PCR扩增,基于高通量测序方法,能够有效的解决水体中存在多种近缘物种条件下难以得到有效的物种特异性引物的问题,基于环境DNA监测技术,为鱼类分类学研究及其多样性保护提供有效的技术支撑。利用该PCR引物鉴定淡水鱼类物种的方法具有耗时短、操作简便、特异性强等优点。
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公开(公告)号:CN105154564B
公开(公告)日:2018-06-19
申请号:CN201510640527.5
申请日:2015-09-30
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种基于环境DNA技术对鱼类DNA丰度估算的联合分析法,所述的联合分析法包括:定时定量PCR获取鱼类的总DNA丰度;454 GS‑FLX Titanium测序分析鱼类物种组成比例;测序数据和实时定量PCR数据联合分析目标物种;使用sufer 8.0软件完成对环境中鱼类线粒体DNA相对分布图绘制。本发明基于环境DNA鉴定技术,不依赖于鱼类物种的捕获,只需要采集水体样品即可对物种的有无和多少进行分析,采样方法简单,且可以最大限度的保护鱼类资源;同时,对于一些分布较少难以捕获的物种,该方法也较传统捕捞调查更为有效,本方法能够有效的解决样品中存在多种近缘物种条件下难以得到有效的物种特异性引物的问题,且只需要上述两种技术各进行一次实验,即了解所有物种的DNA丰度信息。
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公开(公告)号:CN103039389A
公开(公告)日:2013-04-17
申请号:CN201310003900.7
申请日:2013-01-06
Applicant: 上海海洋大学
IPC: A01K61/00
CPC classification number: Y02A40/81
Abstract: 本发明涉及一种底栖动物营养排泄原位培养方法,包括以下步骤:(1)采集采样点的表层湖水,并过滤以去除1微米以下的颗粒;(2)采集采样点的底泥,挑拣出底栖动物;(3)将底栖动物放入步骤(1)获得的过滤过的表层湖水,并置于采样点的水底进行原位培养,若水底的温度≥15℃时,培养2h,若水底的温度≤15℃时,培养4h。较佳地,步骤(1)中,采用1微米A/E玻璃纤维滤膜抽滤表层湖水,步骤(3)中,表层湖水置于预先酸处理的培养瓶中。本发明设计巧妙,对底栖动物进行原位培养,尽可能减少转移,在野外直接模拟底栖动物的生境,能够真实反映它在水体中的排泄率,为研究底栖动物营养排泄机制提供了合理的系统方案,适于大规模推广应用。
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公开(公告)号:CN108094277A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201810076257.3
申请日:2018-01-26
Applicant: 上海海洋大学 , 江苏省洪泽湖渔业管理委员会办公室
Abstract: 本发明涉及一种新型河蚬吊养竹筏,所述的吊养竹筏包括第一边竹竿、第二边竹竿、第三边竹竿、第四边竹竿、第五中间加固竹竿和第六中间加固竹竿;所述的第一边竹竿、第二边竹竿、第三边竹竿和第四边竹竿依次两两首尾相接捆绑在一起并形成一个四边形竹筏所述的第五中间加固竹竿与第六中间加固竹竿交叉捆绑在一起;所述的固定杆之间均安装有一根钢丝绳,每两根所述钢丝绳之间设有若干个网箱,四边形竹筏在所有固定桩围成的浮动空间内随着水位的变化而垂直升降。其优点表现在:养殖竹筏稳固,可抗较大风浪、且随水位变化可垂直升降,可使河蚬始终保持在最佳栖息水层,利于河蚬的生长;适用于江河、湖泊等大型水体河蚬增养殖,适用范围广泛。
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公开(公告)号:CN104531879B
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201510005835.0
申请日:2015-01-06
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤(1):根据鱼类群落所在水域的大小,采集水样;步骤(2):将水样进行处理后,提取其中的总环境DNA;步骤(3):将总环境DNA采用核苷酸序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的16s rDNA序列作为通用引物进行PCR扩增,得到PCR产物;步骤胶;步骤(5):将带有DNA的凝胶进行切胶克隆测序后通过GENBANK进行blast比对,以确定DNA是否为鱼类序列;步骤(6):确定DNA为鱼类序列后,采用二代测序技术对PCR产物的组成情况进行大规模分析,以确定环境中DNA的鱼群的组成和鱼类的群落结构。采用该方法十分简便高效,具有实用价值。(4):将PCR产物进行凝胶电泳,得到带有DNA的凝
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公开(公告)号:CN104472419B
公开(公告)日:2016-11-16
申请号:CN201510011946.2
申请日:2015-01-09
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明涉及一种一体化水生生物循环养殖系统,其中包括养殖箱体;进水管,所述的进水管的一端与所述的养殖箱体相连接;水泵,所述的水泵的进水口与所述的进水管的另一端相连接;出水管,所述的出水管的一端与所述的水泵的出水口相连接;过滤槽,所述的过滤槽设置于所述的出水管出口下方且所述的过滤槽的出水口与所述的养殖箱体相连接,所述的出水管的出口高于所述的过滤槽中液体液面系统预设高度。采用该种结构的一体化水生生物循环养殖系统,养殖系统整体结构一体化,使得养殖系统的控制和使用变得简单,线路简单明了,避免了线路复杂混乱所带来的隐患,该养殖系统利用循环设备的悬空出水来增加水体溶氧,提高了安全性,具有更广泛的应用范围。
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公开(公告)号:CN103039389B
公开(公告)日:2014-08-20
申请号:CN201310003900.7
申请日:2013-01-06
Applicant: 上海海洋大学
IPC: A01K61/00
CPC classification number: Y02A40/81
Abstract: 本发明涉及一种底栖动物营养排泄原位培养方法,包括以下步骤:(1)采集采样点的表层湖水,并过滤以去除1微米以下的颗粒;(2)采集采样点的底泥,挑拣出底栖动物;(3)将底栖动物放入步骤(1)获得的过滤过的表层湖水,并置于采样点的水底进行原位培养,若水底的温度≥15℃时,培养2h,若水底的温度≤15℃时,培养4h。较佳地,步骤(1)中,采用1微米A/E玻璃纤维滤膜抽滤表层湖水,步骤(3)中,表层湖水置于预先酸处理的培养瓶中。本发明设计巧妙,对底栖动物进行原位培养,尽可能减少转移,在野外直接模拟底栖动物的生境,能够真实反映它在水体中的排泄率,为研究底栖动物营养排泄机制提供了合理的系统方案,适于大规模推广应用。
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公开(公告)号:CN115795783A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202211203517.1
申请日:2022-09-29
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于刺网的内陆水域经济鱼类定向捕捞方法,包括如下步骤:鱼类的采集与处理,采用定制的多网目刺网开展网具的选择性实验;确定体长频率的分组数量与间隔;画出基于网目的体长频率图,确定待分析的网目范围;通过选择性模型模拟鱼类的样本观测数据,估算多网目刺网对鱼类尺寸的选择性,得到网目大小m与鱼类体长L之间的关系;建立网目与年龄关系,得到m=f(t)的函数,从而实现对不同生长阶段经济鱼类的定向捕捞。本发明直接建立网目与年龄关系,得到m=f(t)的函数,通过m与t的关系,可以推算出刺网捕捞特定生长阶段的经济鱼类的最佳网目尺寸,比如某种经济鱼类在性成熟年龄、开捕年龄或是拐点年龄下的最佳捕捞网目尺寸。
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公开(公告)号:CN104472419A
公开(公告)日:2015-04-01
申请号:CN201510011946.2
申请日:2015-01-09
Applicant: 上海海洋大学
CPC classification number: A01K63/003 , A01K63/042 , A01K63/045 , A01K63/065
Abstract: 本发明涉及一种一体化水生生物循环养殖系统,其中包括养殖箱体;进水管,所述的进水管的一端与所述的养殖箱体相连接;水泵,所述的水泵的进水口与所述的进水管的另一端相连接;出水管,所述的出水管的一端与所述的水泵的出水口相连接;过滤槽,所述的过滤槽设置于所述的出水管出口下方且所述的过滤槽的出水口与所述的养殖箱体相连接,所述的出水管的出口高于所述的过滤槽中液体液面系统预设高度。采用该种结构的一体化水生生物循环养殖系统,养殖系统整体结构一体化,使得养殖系统的控制和使用变得简单,线路简单明了,避免了线路复杂混乱所带来的隐患,该养殖系统利用循环设备的悬空出水来增加水体溶氧,提高了安全性,具有更广泛的应用范围。
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公开(公告)号:CN104450950A
公开(公告)日:2015-03-25
申请号:CN201510003909.7
申请日:2015-01-06
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C12Q2563/185
Abstract: 本发明涉及一种用于浮游动物、浮游植物和浮游动植物物种组成和群落结构的DNA分析方法,包括以下步骤:步骤(1):采集环境样品,从中提取出浮游动物和植物的DNA;步骤(2):对所述的浮游动物和植物DNA进行PCR扩增,得到浮游动物和植物DNA的PCR产物;步骤(3):对所述的浮游动物和植物DNA的PCR产物进行凝胶电泳,得到带有浮游动物和植物DNA的凝胶;步骤(4):对所述的带有浮游动物和植物的DNA的凝胶进行二代测序,得到环境样品中浮游动物和植物物种的rDNA序列;步骤(5):将所述的浮游动物和植物物种的rDNA序列在数据库中进行物种比对,进行浮游动物和植物结构的统计和分析。此方法简便高效准确,设计巧妙,十分具有实用价值。
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