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公开(公告)号：CN113106065A
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN202110287770.9
申请日：2021-03-17
Applicant: 上海市第十人民医院
Abstract: 本发明涉及一种结直肠癌类器官与肝脏类器官共培养模型的构建方法，步骤包括：分别收集结直肠癌类器官与肝脏类器官，离心后弃去上清，并尽量吸去基质胶；分别加入消化液，于室温消化完成后，离心并弃去上清，进行细胞计数；按1:1的细胞数目比例将所述结直肠癌类器官与所述肝脏类器官混合，采用基质胶重悬后，滴加至已预热的24孔板上，凝胶在遇热后迅速转变为果冻状；将所述24孔板置于培养箱内孵育，完成后每孔加入结直肠癌类器官培养基以及肝脏类器官培养基，再置于培养箱内培养。本发明的结直肠癌类器官与肝脏类器官共培养模型可在体外模拟体内3D生长环境，能够更加真实反映机体功能，从而研究肠癌肝转移的病理过程及发生机制。
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公开(公告)号：CN111304152A
公开(公告)日：2020-06-19
申请号：CN202010153395.4
申请日：2020-03-06
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12N5/071
Abstract: 本发明涉及一种运用飞秒激光改善类器官体外3D培养微环境的方法，包括如下步骤，S1：将动物源性类器官于载有基质胶的培养皿内培养3-5天；S2：将S1培养皿固定于三维精密工作台上，并使飞秒激光的光束经过衰减片、偏振片及透镜，将焦点聚焦于基质胶内；通过控制三维精密工作台运动使飞秒激光束焦点在基质胶内部扫描构建三维多孔道结构；其中，透镜为20X或40X空气显微镜头；飞秒激光的光束不接触动物源性类器官。本发明运用飞秒激光改善类器官体外3D培养微环境的方法，在基质胶内部、类器官周围建立三维多孔道结构，改善类器官生长的微环境，通过三维多孔道网络模拟毛细血管，促进营养物质交换过程，有助于类器官的体外生长。
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公开(公告)号：CN118986953A
公开(公告)日：2024-11-22
申请号：CN202410953472.2
申请日：2024-07-16
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: A61K31/203 , A61K31/07 , A61K35/745 , A61P1/00 , A61P29/00 , A61P1/10 , A61P1/16 , A61P25/00
Abstract: 本发明提供了类视黄酸物质(Retinoids)作为CLCA1蛋白表达促进剂或诱导剂在促进双歧杆菌在肠道定植中的应用；其中，类视黄酸物质包括视黄酸和维生素A。类视黄酸物质通过视黄酸信号通路促进肠上皮组织中CLCA1蛋白的表达，CLCA1蛋白与双歧杆菌表面的atpH蛋白发生互作，从而促进双歧杆菌在肠道定植；相对于维生素A，视黄酸的作用效果更好。本发明首次发现通过调控宿主肠道基因的表达可用于增强双歧杆菌定植，也是首次发现CLCA1蛋白可与双歧杆菌互作，从而调控双歧杆菌定植；采用类视黄酸物质调控肠道CLCA1表达促进双歧杆菌定植具有很好的可行性和安全性；且通过类视黄酸物质的使用促进双歧杆菌的定植可用于促进和改善双歧杆菌的治疗疗效，并可以促进临床FMT的功效。
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公开(公告)号：CN112980975B
公开(公告)日：2024-09-24
申请号：CN202110250360.7
申请日：2021-03-08
Applicant: 上海市第十人民医院
Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域，具体涉及一种具核梭杆菌的亚种检测和鉴定方法。具核梭杆菌与多种疾病密切关联，近期研究表明其可促进结直肠肿瘤发生发展。但目前还缺乏一种精确、直观的检测方法用来区别具核梭杆菌的不同亚种。具核梭杆菌不同亚种在生物学特性、定植及致病能力上均存在差异，因此精确的亚种鉴定对于了解其致病机制具有深远意义。本发明提供了一组用于鉴定具核梭杆菌亚种的特异性DNA序列，并设计了相应的检测引物，阐述了其在亚种水平检测和鉴定具核梭杆菌的应用。该发明可促进揭示病灶中具核梭杆菌的亚种构成及来源，将有助于探究不同亚种与疾病间的关系，及相关流行病学特征。
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公开(公告)号：CN111254186B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202010246901.4
申请日：2020-03-31
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/689 , C12Q1/06
Abstract: 本发明提供了一种对梭杆菌进行分子检测或对其菌种水平分类鉴定的方法，以rpoB基因作为梭杆菌的检测和分类鉴定靶标，其包括如下步骤：对样本的基因进行扩增；对扩增子进行高通量测序和比对分析序列，所得数据按100％一致性建立OTU；将上述OTU序列与梭杆菌全基因组中的特征序列片段所对应的序列比对，剔除无相似性的非特异OTU序列后，共同建立进化树，按进化关系注释各OTU对应的菌种，实现样本中梭杆菌群体的分类鉴定，以及不同菌种的丰度定量。本发明结合高通量测序技术，对特异性引物扩增后所得的扩增子序列进行测定，通过构建进化树的方法对样本中的梭杆菌菌种甚至亚种进行鉴别，有助于揭示微生态样本中梭杆菌属的菌种水平结构组成。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111205994B
公开(公告)日：2021-09-21
申请号：CN201911014130.X
申请日：2019-10-23
Applicant: 上海市第十人民医院
Abstract: 本发明提供了一株分离自人类直肠癌肿瘤组织的具核梭杆菌动物亚种菌株THCT5A4，分类命名为Fusobacterium nucleatum subsp.animalis THCT5A4，其保藏编号为CCTCC NO：M 2019366，保藏日期为2019年05月17日，保藏单位为中国典型培养物保藏中心，其16SrRNA基因序列如SEQ ID NO:1所示。本发明提供了该具核梭杆菌动物亚种菌株的分离方法。结直肠癌细胞系与THCT5A4共培养的结果说明THCT5A4可显著促进结直肠癌细胞增殖，因此THCT5A4可为结直肠癌的研究提供多样性的体外或体内模拟肠道环境的实验条件，还可以构建结直肠癌疾病模型来筛选治疗结直肠癌的药物。
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公开(公告)号：CN111534564A
公开(公告)日：2020-08-14
申请号：CN202010307831.9
申请日：2020-04-17
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/02
Abstract: 本发明公开了一种基于肠道类器官筛选药物的方法，包括如下步骤：用手术切除的新鲜结直肠癌组织或肠镜活检标本构建肠道类器官；将培养好的肠道类器官消化为单细胞，然后将单细胞按照一定数量铺于96孔酶标板中；将待筛选的药物加入孔中，放入培养箱中培养5天；培养完成后，每孔加入CellTiter-Glo 3D细胞活力检测试剂10min后，置于OrionⅡ仪器读值，评估细胞活力。本发明提供的一种基于肠道类器官筛选药物的方法采用肠道类器官模型作为疗效评估的手段，通过术中或肠镜活检标本构建肠道类器官，体外应用抗肿瘤药物及靶向药物等处理肠道类器官，效果数据接近真实效果，可为个体化治疗提供依据。
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公开(公告)号：CN111004738A
公开(公告)日：2020-04-14
申请号：CN201911013469.8
申请日：2019-10-23
Applicant: 上海市第十人民医院
Abstract: 本发明提供了一株具核梭杆菌多形亚种分离株THCT15E1，分类命名为Fusobacterium nucleatum subsp.nucleatum THCT15E1，其保藏编号为CCTCC NO：M 2019362，保藏日期为2019年05月17日，保藏单位为中国典型培养物保藏中心，其16SrRNA基因序列如SEQ ID NO:1所示。结直肠癌细胞系与THCT15E1共培养的结果说明THCT15E1可显著促进结直肠癌细胞增殖，因此THCT15E1可为结直肠癌的研究提供多样性的体外或体内模拟肠道环境的实验条件，还可以构建结直肠癌疾病模型来筛选治疗结直肠癌的药物。
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公开(公告)号：CN110819712A
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201911054695.0
申请日：2019-10-31
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明一方面提供piRNA-26131在制备甲状腺癌诊断和预后标记物中的应用。本发明的第二方面提供piRNA-26131在制备诊断甲状腺癌或判断甲状腺癌是否复发的试剂盒中的应用。此外，本发明还提供一种检测用于非诊断和治疗目的的检测甲状腺癌组织或血液中piRNA-26131的方法。过表达或敲减piRNA-26131后，甲状腺癌细胞的增殖及侵袭转移能力明显增强或减弱，piRNA-26131高表达患者复发概率高，所以piRNA-26131可以作为血液筛选分子标志物用于甲状腺癌患者的早期筛查和肿瘤复发指标，具有重要意义和应用前景。
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公开(公告)号：CN109797221A
公开(公告)日：2019-05-24
申请号：CN201910190625.1
申请日：2019-03-13
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/10
Abstract: 本发明涉及一种用于对肌层浸润性膀胱癌进行分子分型和/或预后预测的生物标记物组合及其筛选方法和应用，所述生物标记物组合包括以下基因：FGF10、TP53INP1、DDR2、MYC、CDC73、IGF1、PLA2G1B、SKI、FN1、EGFR、PPARG、PDGFRA、PDGFD、GAS6、PDGFC、FNTB和CCNB1。基于该生物标记物组合的转录数据的非负矩阵分解方法聚类分析，可将肌层浸润性膀胱癌分成类，分别对应不同的表达特征谱。该分类分别对应显著不同的总体生存状况，因此可用于生存预后评估。本发明所采用的转录数据分析方法选用生物标记物集合个数少，分析步骤简单，同时满足大样本分析需求，对计算能力要求低，适用于标准化后的转录数据，该转录数据可为转录组学数据亚集、亦可为单独检测的基因转录数据的集合。
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