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公开(公告)号:CN116794290B
公开(公告)日:2025-04-08
申请号:CN202310804196.9
申请日:2023-07-03
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: G01N33/533 , G01N33/68 , G01N33/58 , G01N21/64
Abstract: 本发明公开一种基于可逆DNA自组装的组织切片靶标蛋白多重分析方法,包括步骤一、DNA自组装体系的设计,步骤二、抗体Ab‑T的合成,步骤三、组织切片靶标蛋白的预处理与成像,步骤四、成像分析的图像处理;本发明将DNA自组装体系设计、点击化学反应、免疫识别、可逆DNA自组装与组织荧光成像技术结合,将组织切片上的多种靶标蛋白输出为多种荧光信号,实现对组织切片上靶标蛋白的多重分析,在不减少成像精度的前提下降低时间成本和对组织样本的需求;对于组织样本,尤其是珍贵组织样本的多靶标蛋白的空间定位关系分析、细胞分型分析、细胞的组织空间分布分析等基础科研、临床研究与应用具有重要意义。
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公开(公告)号:CN116814739A
公开(公告)日:2023-09-29
申请号:CN202310789120.3
申请日:2023-06-30
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6804 , G01N21/64 , C12Q1/6841 , C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了基于邻位交换介导的多色编码成像系统及其在RNA修饰空间分辨多重成像中的应用,包括:将标记有RNA m6A抗体的PH1探针、Target特异性识别的PH2探针与待测样本进行孵育;标记有RNA m6A抗体的PH1探针特异性识别Target链的RNAm6A修饰,PH2探针特异性识别Target链的指定位点,实现“AND”逻辑门介导的双特异性识别;PI探针启动PH1探针与PH2探针发生邻位交换反应,暴露出用于触发HCR的起始部分进行信号输出,HCR反应元件是两个具有茎环结构的发夹DNA链H1和H2,用于RNA修饰空间分辨多重成像的表观遗传学高通量成像分析具有重要价值。
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公开(公告)号:CN119081864A
公开(公告)日:2024-12-06
申请号:CN202411284843.9
申请日:2024-09-13
Applicant: 上海市第十人民医院
Abstract: 本发明属于医学基础研究技术领域,尤其涉及一种肿瘤细胞三维培养池及细胞观测方法,肿瘤细胞三维培养池包括:培养皿,培养皿的底部为导电透明玻璃板,导电透明玻璃板内嵌固有PEEK微流控芯片;培养皿内铺设有底胶;点胶仓,通过蚀刻PET材料支架设置在底胶上,点胶仓的侧壁为聚氨酯TPU薄膜,点胶仓与培养皿侧壁之间、相邻两个点胶仓之间均设有池隙;池隙内填充有肿瘤细胞培养液,以及一种细胞观测方法,本发明通过PET材料支架和点胶仓的设置可以避免半流体流动拉扯肿瘤细胞,方便肿瘤细胞聚拢成球。
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公开(公告)号:CN118837546A
公开(公告)日:2024-10-25
申请号:CN202410879672.8
申请日:2024-07-02
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: G01N33/569 , G01N21/84 , C12Q1/682
Abstract: 本发明公开了一种基于膨胀后正交自组装的外泌体原位成像分析方法,涉及生物医学光学成像技术领域。该外泌体原位成像分析方法包括以下步骤:提取得到外泌体,并将其粘附在载玻片上,得到外泌体爬片;将DBCO修饰的Trigger DNA链与叠氮修饰的CD63抗体反应,得到Trigger DNA链标记抗体;对该外泌体爬片依次实施渗透、聚合、孵育以及膨胀处理后,通过共聚焦拍摄,在光学显微镜下获取外泌体成像结果。该方法实现了4.7倍的扩展因子和~55nm的横向分辨率,解决了物理扩展过程中信号稀释的固有缺陷,提高信噪比,同时,可以显著提高信号输出,实现低丰度外泌体的异质性分析,在光学层面可以观察相应精细结构。
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公开(公告)号:CN116794290A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310804196.9
申请日:2023-07-03
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: G01N33/533 , G01N33/68 , G01N33/58 , G01N21/64
Abstract: 本发明公开一种基于可逆DNA自组装的组织切片靶标蛋白多重分析方法,包括步骤一、DNA自组装体系的设计,步骤二、抗体Ab‑T的合成,步骤三、组织切片靶标蛋白的预处理与成像,步骤四、成像分析的图像处理;本发明将DNA自组装体系设计、点击化学反应、免疫识别、可逆DNA自组装与组织荧光成像技术结合,将组织切片上的多种靶标蛋白输出为多种荧光信号,实现对组织切片上靶标蛋白的多重分析,在不减少成像精度的前提下降低时间成本和对组织样本的需求;对于组织样本,尤其是珍贵组织样本的多靶标蛋白的空间定位关系分析、细胞分型分析、细胞的组织空间分布分析等基础科研、临床研究与应用具有重要意义。
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公开(公告)号:CN119932194A
公开(公告)日:2025-05-06
申请号:CN202510109684.7
申请日:2025-01-23
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/682 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于靶标RNA多重分析的共价荧光编码组装体、DNA荧光条形码及应用,属于核酸检测领域。所述共价荧光编码组装体包括报告序列、所述报告序列互补结合的富集序列以及用于结合靶标的结合链,所述富集序列与所述结合链互补配对,所述靶标为RNA,所述报告序列上连接荧光基团。基于所述共价荧光编码组装体结合磁珠构建了DNA荧光条形码,该DNA荧光条形码可同时检测多重靶标,大大扩充了可同时检测的靶标的通量,基于该DNA荧光条形码的特异性和可预测性,本发明在靶标多重检测、组学分析等领域中具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN119120659A
公开(公告)日:2024-12-13
申请号:CN202310861098.9
申请日:2023-07-13
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6818
Abstract: 本发明公开了一种基于切刻内切酶的一锅式多靶标正交检测系统及其应用,属于生物检测领域。该检测系统包括针对多个靶标设计的切刻内切酶的识别序列、能够与所述识别序列完全互补配对的荧光报告序列,以及能够识别所述识别序列与荧光报告序列形成的双链并发挥切刻作用的切刻内切酶和反应缓冲溶液;其中,所述识别序列为单链DNA片段,所述单链DNA片段包括所述切刻内切酶发挥切刻作用所需的固定区域和可变区域。本发明证明了切刻内切酶的切刻活性受其识别序列互补性的影响,并利用这一特性发展一锅式的多靶标正交检测技术。
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公开(公告)号:CN115969999A
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN202211297958.2
申请日:2022-10-21
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: A61K47/69 , A61K31/12 , A61K33/26 , A61K35/74 , A61K35/741 , A61K35/745 , A61P1/00
Abstract: 本发明涉及一种生物制剂的制备方法,步骤包括:制备铁‑姜黄素纳米颗粒;将DNA模板与模板引物制成DNA模板与模板引物的二聚体,并将若干二聚体连接成环;于益生菌中依次加入1‑(3‑二甲氨基丙基)‑3‑乙基碳二亚胺盐酸盐、N‑羟基丁二酰亚胺、DNA模板、连接成环的二聚体、铁‑姜黄素纳米颗粒以及二聚体的扩增体系,使得连接于益生菌上的DNA网将铁‑姜黄素纳米颗粒包裹,即得生物制剂。本发明利用酰胺键将益生菌与DNA模板相连接,并通过DNA的RCA扩增将药物包裹于DNA网中,即利用DNA工程化,以益生菌作为药物载体,构建药物递送系统。在发挥益生菌作用的同时,将药物足量有效地递送到肠炎部位,显著改善治疗效果,且具有良好的生物安全性,具有广泛的临床应用前景。
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公开(公告)号:CN119491038A
公开(公告)日:2025-02-21
申请号:CN202411710281.X
申请日:2024-11-27
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6886 , C12Q1/70 , C12Q1/689
Abstract: 本发明公开了一种基于三维荧光光谱的一锅式高维多靶标检测方法,属于非空间依赖的单样本高通量检测领域。所述方法包括:待测样本通过亚硫酸氢盐转化方式进行处理;根据目标基因设计的引物对和荧光基团修饰的探针,将其与待测样本进行孵育,引物对和荧光修饰的探针特异性识别目标基因并进行扩增,荧光探针断裂产生荧光信号;扩增产物经三维荧光光谱成像输出全部激发发射光谱信息,形成并输出样本特征性指纹图谱。该方法能用于DNA甲基化多重检测、肠癌精准鉴定等单反应多靶标分析。本发明丰富了溶液体系检测信息密度,克服现有多靶标分析的检测通量低等问题,在单样本高通量检测分析中具有重要价值。
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公开(公告)号:CN118773319A
公开(公告)日:2024-10-15
申请号:CN202411082087.1
申请日:2024-08-08
Applicant: 上海市第十人民医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种用于诊断前列腺癌的外泌体RNA及其应用。该外泌体RNA包括PCA3基因RNA、TMEFF2基因RNA、AMACR基因RNA、FOLH1基因RNA或PSGR基因RNA中的一种或多种组合。基于该外泌体RNA的诊断产品可以实现无痛、无创且较为准确的诊断前列腺癌的目的。另外,基于该外泌体RNA的PCa诊断模型之一:logit(PCa)=1.476×SPDEF‑1.048×PCA3‑0.435×TMEFF2+7.611对前列腺癌具有较好的诊断效果,曲线下面积(AUC)为0.912(95%CI:0.853‑0.971,敏感度:86.67%,特异度:89.09%),Youden指数为0.7576,阳性预测值为82.2%,阴性预测值为89.1%。
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