公开(公告)号：CN111640508B

公开(公告)日：2023-08-01

申请号：CN202010469448.3

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院

Inventor： 李园园 ,  戴文韬 ,  刘继翔 ,  刘伟

IPC: G16H50/50 ,  G16B25/00 ,  G06N3/126

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种基于高通量测序数据和临床表型构建的状态评估模型在泛肿瘤靶向药敏感性状态评估中的应用，公开了基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘泛肿瘤靶向用药标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建泛肿瘤靶向用药评估模型的计算方法，筛选到了肿瘤患者靶向药敏感性相关的生物标志物，形成了泛肿瘤靶向药敏感性状态评估模型。通过本发明方法构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，可用于泛肿瘤治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。

公开(公告)号：CN115261447A

公开(公告)日：2022-11-01

申请号：CN202110486118.X

申请日：2021-04-30

Applicant: 上海市生物医药技术研究院 ,  上海旺旺食品集团有限公司

Inventor： 陆晓婷 ,  李园园 ,  戴文韬 ,  刘伟 ,  陆长德 ,  李雪玲 ,  李亦学 ,  曹永梅 ,  陈俊江 ,  陈清艳 ,  杨政华 ,  吉玲 ,  林彦君

IPC: C12Q1/6844 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种能同时检测多种细菌的方法、检测系统及其应用。所述方法包括筛选不同细菌基因组序列中富含AT碱基的目标序列；针对单一细菌基因组序列设计兼具通用性和特异性的引物；基于GC的百分含量、引物序列长度、引物对的理论扩增产物序列长度计算反应变性温度及退火温度；根据序列扩增长度、反应变性温度及退火温度筛选合适的单一细菌引物对并组成检测多种细菌的引物组；设置核酸扩增反应条件，在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应，得到扩增产物。本发明通过基于海量基因组数据的特异性排查，以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算，实现双链DNA的局部解链，大大降低核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。

公开(公告)号：CN117778330A

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202311409798.0

申请日：2023-10-26

Applicant: 中国人民解放军海军军医大学 ,  上海市生物医药技术研究院

Inventor： 李园园 ,  戴文韬 ,  李楠 ,  吴艳峰 ,  虞淦军 ,  何晓波 ,  徐蓉蓉 ,  徐佳

IPC: C12N5/10 ,  C07K14/165 ,  G01N33/569

Abstract: 本发明提供新冠病毒特异性T细胞及其应用。具体提供了一种靶向新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)的特异性T细胞，其由新冠病毒限制性表位多肽或其致敏的树突状细胞诱导获得。还提供了包含所述特异性T细胞的制品和产品，其能够用于新型冠状病毒SARS‑CoV‑2的治疗及预防产生特异性免疫效应。

公开(公告)号：CN118086212A

公开(公告)日：2024-05-28

申请号：CN202311409545.3

申请日：2023-10-26

Applicant: 中国人民解放军海军军医大学 ,  上海市生物医药技术研究院

Inventor： 吴艳峰 ,  戴文韬 ,  何晓波 ,  虞淦军 ,  李楠 ,  徐蓉蓉 ,  徐佳

IPC: C12N5/10 ,  C07K14/165 ,  G01N33/569 ,  A61K35/15 ,  A61K39/215 ,  A61P31/14

Abstract: 本发明提供新冠病毒表位多肽致敏的树突状细胞及其应用。具体提供了一种靶向新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)M蛋白的树突状细胞，其由新冠病毒M蛋白限制性表位多肽致敏，能够诱导产生所述表位多肽特异性细胞毒性T细胞。还提供了所述树突状细胞的制备方法及其应用。

公开(公告)号：CN111816315B

公开(公告)日：2023-10-13

申请号：CN202010470689.X

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院 ,  洛兮医疗科技(杭州)有限公司

Inventor： 戴文韬 ,  李园园 ,  吴柏旭 ,  程翎 ,  刘继翔

IPC: G16H50/70 ,  G16H10/20 ,  G16B20/20 ,  G16B20/10 ,  G06N3/126 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种基于高通量测序数据和临床表型构建复杂疾病状态评估方法在胰腺导管癌状态评估模型中的应用，包括基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘胰腺导管癌复杂疾病标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建胰腺导管癌状态评估模型的计算方法，筛选到了胰腺导管癌相关的生物标志物，形成了相应的疾病状态评估模型。通过本发明方法构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，可用于胰腺导管癌预后评估、治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。

公开(公告)号：CN111863126B

公开(公告)日：2024-03-26

申请号：CN202010470684.7

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院

Inventor： 戴文韬 ,  李园园 ,  刘继翔 ,  刘伟

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  G16H50/20 ,  G16H70/40 ,  G16H70/60

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种应用在结直肠肿瘤状态评估中的基于高通量测序数据和临床表型构建的状态评估模型的运行系统，公开了基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘结直肠癌标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建结直肠癌状态评估模型的计算方法，筛选到了结直肠癌相关的生物标志物，形成了相应的状态评估模型。通过本发明方法的模型和系统，构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，用于结直肠癌预后评估、治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。