公开(公告)号：CN111863126B

公开(公告)日：2024-03-26

申请号：CN202010470684.7

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院

Inventor： 戴文韬 ,  李园园 ,  刘继翔 ,  刘伟

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  G16H50/20 ,  G16H70/40 ,  G16H70/60

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种应用在结直肠肿瘤状态评估中的基于高通量测序数据和临床表型构建的状态评估模型的运行系统，公开了基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘结直肠癌标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建结直肠癌状态评估模型的计算方法，筛选到了结直肠癌相关的生物标志物，形成了相应的状态评估模型。通过本发明方法的模型和系统，构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，用于结直肠癌预后评估、治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。

公开(公告)号：CN111640508B

公开(公告)日：2023-08-01

申请号：CN202010469448.3

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院

Inventor： 李园园 ,  戴文韬 ,  刘继翔 ,  刘伟

IPC: G16H50/50 ,  G16B25/00 ,  G06N3/126

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种基于高通量测序数据和临床表型构建的状态评估模型在泛肿瘤靶向药敏感性状态评估中的应用，公开了基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘泛肿瘤靶向用药标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建泛肿瘤靶向用药评估模型的计算方法，筛选到了肿瘤患者靶向药敏感性相关的生物标志物，形成了泛肿瘤靶向药敏感性状态评估模型。通过本发明方法构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，可用于泛肿瘤治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。

公开(公告)号：CN111816315B

公开(公告)日：2023-10-13

申请号：CN202010470689.X

申请日：2020-05-28

Applicant: 上海市生物医药技术研究院 ,  洛兮医疗科技(杭州)有限公司

Inventor： 戴文韬 ,  李园园 ,  吴柏旭 ,  程翎 ,  刘继翔

IPC: G16H50/70 ,  G16H10/20 ,  G16B20/20 ,  G16B20/10 ,  G06N3/126 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明涉及基因检测及生物信息学领域，公开了一种基于高通量测序数据和临床表型构建复杂疾病状态评估方法在胰腺导管癌状态评估模型中的应用，包括基于转录组数据、外显子组/基因组数据和临床表型挖掘胰腺导管癌复杂疾病标志物的方法，设计了一套整合高通量测序数据和临床表型构建胰腺导管癌状态评估模型的计算方法，筛选到了胰腺导管癌相关的生物标志物，形成了相应的疾病状态评估模型。通过本发明方法构建得到准确性与机制解释性兼顾的标志物，可用于胰腺导管癌预后评估、治疗效果预测及治疗方案辅助决策等。