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公开(公告)号：CN108753571A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810544015.2
申请日：2018-05-30
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
CPC classification number: C12M23/16 , C12N5/0603 , C12N5/0694
Abstract: 本发明提供了一种细胞分型捕获芯片和方法。所述的细胞分型捕获芯片，其特征在于，包括芯片基体，芯片基体设有进样孔、出样孔以及形成于进样孔和出样孔之间的流道，所述流道内设有微柱阵列，所述的微柱阵列在不同区域修饰标记有不同亲和力特异性识别分子的纳米结构，所述特异性识别分子包括抗体、核酸适体、多肽以及配体中的至少一种；所述修饰特异性识别分子的纳米结构同靶标细胞具有不同的亲和能力，因此能够实现不同类型靶细胞在不同区域的识别和富集。
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公开(公告)号：CN110592093A
公开(公告)日：2019-12-20
申请号：CN201910850939.X
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12N15/115 , C12N5/09 , G16B40/00 , G16B40/30 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明提供了一种能够识别EpCAM蛋白的核酸适体，其特征在于，其为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11中任一序列所示的DNA片段。本发明通过多维度分析框架筛选得到的能够识别EpCAM蛋白的核酸适体具有比蛋白抗体更高的亲和力与特异性，将成为EpCAM检测的有力工具，在肿瘤早期诊断、循环肿瘤细胞捕获等领域具有良好的应用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117327765A
公开(公告)日：2024-01-02
申请号：CN202210716712.8
申请日：2022-06-23
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6816 , C12N15/115 , C12N15/11 , C12Q1/02
Abstract: 本发明提供了一种框架核酸及其在核酸适配体筛选中的应用，具体包括基于碱基的互补配对杂交而形成的核酸结构作为支架去辅助核酸适配体的筛选；本发明利用框架结构的稳定性和刚性的特点，合理排布多个随机适配体序列的空间位置，可以最大化发挥多价的结合优势，与传统建立多价适配体体系的方法相比，本发明的筛选方法更为简单实用，没有涉及针对已有的适配体进行复杂的多价体系设计，而是从源头上进行核酸适配体的筛选，减少了获取核酸适配体的难度，筛选过程与传统单价适配体筛选并无差别，针对未有明确结构信息和对应单价适配体的靶标将会是获取多价适配体最佳的选择，这大大提高了核酸适配体应用的靶标范围。
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公开(公告)号：CN110600080A
公开(公告)日：2019-12-20
申请号：CN201910850896.5
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 本发明提供了一种基于多维度分析框架的功能核酸全面识别方法，包括：基于核酸文库测序数据，利用多维度分析框架对功能核酸进行筛选；所述多维度分析框架包括：结构域/模式序列含量Kscore、核酸家族富集程度Fscore与结构稳定性Sscore三个方面。本发明首次提出了一个多维度分析框架，基于多水平的结构分析和序列分析，利用无监督学习、模式序列搜索、结构模拟等技术手段，对核酸适体序列进行多维度评估,从而识别具有靶标结合能力的核酸适体。本算法具有高效处理高通量数据、全面识别高性能核酸适体的能力。
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公开(公告)号：CN110592093B
公开(公告)日：2023-08-25
申请号：CN201910850939.X
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12N15/115 , C12N5/09 , G16B40/00 , G16B40/30 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明提供了一种能够识别EpCAM蛋白的核酸适体，其特征在于，其为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11中任一序列所示的DNA片段。本发明通过多维度分析框架筛选得到的能够识别EpCAM蛋白的核酸适体具有比蛋白抗体更高的亲和力与特异性，将成为EpCAM检测的有力工具，在肿瘤早期诊断、循环肿瘤细胞捕获等领域具有良好的应用前景。
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公开(公告)号：CN110600080B
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN201910850896.5
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 本发明提供了一种基于多维度分析框架的功能核酸全面识别方法，包括：基于核酸文库测序数据，利用多维度分析框架对功能核酸进行筛选；所述多维度分析框架包括：结构域/模式序列含量Kscore、核酸家族富集程度Fscore与结构稳定性Sscore三个方面。本发明首次提出了一个多维度分析框架，基于多水平的结构分析和序列分析，利用无监督学习、模式序列搜索、结构模拟等技术手段，对核酸适体序列进行多维度评估,从而识别具有靶标结合能力的核酸适体。本算法具有高效处理高通量数据、全面识别高性能核酸适体的能力。
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公开(公告)号：CN111235103A
公开(公告)日：2020-06-05
申请号：CN202010083726.1
申请日：2020-02-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 本发明公开了一种用于细胞捕获的流动识别纳米囊泡，其特征在于，包括由天然细胞膜或仿生膜包绕形成的球体结构，所述膜的膜界面上通过物理、化学或生物作用修饰有特异性识别分子。本发明还提供了使用该纳米囊泡捕获循环肿瘤细胞的方法。另一方面，本发明提供了一种微流控芯片，其修饰有本发明的纳米囊泡，此外本发明还提供了使用上述微流控芯片捕获循环肿瘤细胞的方法。使用本发明的流动性增强的多价策略，可实现循环肿瘤细胞的高效、选择性、温和捕获。
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