公开(公告)号：CN100424174C

公开(公告)日：2008-10-08

申请号：CN200510029293.7

申请日：2005-09-01

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 安红杰 ,  吕鸣 ,  李海阔 ,  张晓东 ,  钮晓鸣 ,  胡钧

IPC: C12N15/09 ,  C12N15/11

Abstract: 一种生物技术领域的原子力显微镜诱导单分子DNA定位突变方法，在单分子水平上，通过原子力显微镜针尖的机械力定位扫描诱导DNA突变，包括以下步骤：(1)制备氨基硅烷修饰的云母衬底；(2)DNA样品的末端标记；(3)标记后DNA样品的拉直制备；(4)原子力显微镜对DNA进行诱导突变；(5)原子力显微镜对诱导后DNA片段的拾取分离；(6)分离后的DNA片段的单分子扩增；(7)琼脂糖凝胶电泳检测扩增情况；(8)扩增样品的DNA序列测定，筛选出突变样品。本发明具有精确定位，高分辨率，效率较高，操作简单，易于实行的优点。理论上可以诱导多点定位突变。

公开(公告)号：CN1303211C

公开(公告)日：2007-03-07

申请号：CN200510023458.X

申请日：2005-01-20

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张晓东 ,  吕鸣 ,  胡钧 ,  贺林 ,  张治洲

IPC: C12N15/00

Abstract: 本发明公开一组用于DNA芯片计算的寡核苷酸序列。该组序列中每条序列的长度为12碱基，满足以下约束条件，生成22条母序列：每条序列G+C含量均为50%；任一序列A与任一其他序列B之间比对得分不超过4，其中：A、B不同；任一序列A与任一序列B的完全互补序列之间的比对得分不超过4，其中：A、B不同，或者A、B相同；应用于光导原位合成法制作芯片，或者应用于点样法制作芯片。这些序列杂交稳定性好，无错配，杂交信号强，可用于计算多种NP问题，具有通用性。

公开(公告)号：CN1766104A

公开(公告)日：2006-05-03

申请号：CN200510029293.7

申请日：2005-09-01

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 安红杰 ,  吕鸣 ,  李海阔 ,  张晓东 ,  钮晓鸣 ,  胡钧

IPC: C12N15/09 ,  C12N15/11

Abstract: 一种生物技术领域的原子力显微镜诱导单分子DNA定位突变方法，在单分子水平上，通过原子力显微镜针尖的机械力定位扫描诱导DNA突变，包括以下步骤：(1)制备氨基硅烷修饰的云母衬底；(2)DNA样品的末端标记；(3)标记后DNA样品的拉直制备；(4)原子力显微镜对DNA进行诱导突变；(5)原子力显微镜对诱导后DNA片段的拾取分离；(6)分离后的DNA片段的单分子扩增；(7)琼脂糖凝胶电泳检测扩增情况；(8)扩增样品的DNA序列测定，筛选出突变样品。本发明具有精确定位，高分辨率，效率较高，操作简单，易于实行的优点。理论上可以诱导多点定位突变。

公开(公告)号：CN1657615A

公开(公告)日：2005-08-24

申请号：CN200510023458.X

申请日：2005-01-20

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张晓东 ,  吕鸣 ,  胡钧 ,  贺林 ,  张治洲

IPC: C12N15/00

Abstract: 本发明公开一组用于DNA芯片计算的寡核苷酸序列。该组序列中每条序列的长度为12碱基，满足以下约束条件，生成22条母序列：每条序列G+C含量均为50％；任一序列A与任一其他序列B之间比对得分不超过4，其中：A、B不同；任一序列A与任一序列B的完全互补序列之间的比对得分不超过4，其中：A、B不同，或者A、B相同；应用于光导原位合成法制作芯片，或者应用于点样法制作芯片。这些序列杂交稳定性好，无错配，杂交信号强，可用于计算多种NP问题，具有通用性。

公开(公告)号：CN101435759B

公开(公告)日：2012-06-27

申请号：CN200810204393.2

申请日：2008-12-11

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 龙飞 ,  吕鸣 ,  张福春 ,  孙洁林 ,  胡钧

IPC: G01N13/16

Abstract: 本发明涉及的是一种DNA分子技术领域的基于原子力显微镜技术的自动化DNA分子操纵方法，采用动态/静态混合模式操纵DNA分子。成像时采用动态模式，操纵时通过控制扫描管下降一定距离，使针尖振幅减小为零，从而获得足够的操纵力，操纵之前计算当前操纵范围的表面倾斜，并在操纵过程中，让针尖的移动始终平行于样品表面。然后基于热漂移变化缓慢的性质，采用图像配准的方法，通过计算连续两幅扫描图像之间的差异，获取当前操纵环境下热漂移大小，并对针尖位移进行补偿，提高操纵精度。最后通过设计针尖移动路径，实现自动化的DNA分子切割分离和拾取操纵。本发明显著提高了DNA分子纳米操纵的效率，提高了定位操纵的精度。

公开(公告)号：CN101435759A

公开(公告)日：2009-05-20

申请号：CN200810204393.2

申请日：2008-12-11

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 龙飞 ,  吕鸣 ,  张福春 ,  孙洁林 ,  胡钧

IPC: G01N13/16

Abstract: 本发明涉及的是一种DNA分子技术领域的基于原子力显微镜技术的自动化DNA分子操纵方法，采用动态/静态混合模式操纵DNA分子。成像时采用动态模式，操纵时通过控制扫描管下降一定距离，使针尖振幅减小为零，从而获得足够的操纵力，操纵之前计算当前操纵范围的表面倾斜，并在操纵过程中，让针尖的移动始终平行于样品表面。然后基于热漂移变化缓慢的性质，采用图像配准的方法，通过计算连续两幅扫描图像之间的差异，获取当前操纵环境下热漂移大小，并对针尖位移进行补偿，提高操纵精度。最后通过设计针尖移动路径，实现自动化的DNA分子切割分离和拾取操纵。本发明显著提高了DNA分子纳米操纵的效率，提高了定位操纵的精度。