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公开(公告)号:CN118324875A
公开(公告)日:2024-07-12
申请号:CN202410757045.7
申请日:2024-06-13
Abstract: 本发明属于肽类抑制剂技术领域,具体涉及一种海洋来源的抗菌肽FD095及其应用。一种海洋来源的抗菌肽FD095,其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明提供一种来自海洋宏基因组中挖掘并鉴定的抗菌肽FD095,该抗菌肽能够在128μM时抑制枯草芽孢杆菌的生长、在256μM时能抑制金黄色葡萄球菌的生长、在512μM时抑制大肠杆菌的生长、以及在256μM时抑制肺炎克雷伯氏菌的生长,在食品、医药领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN118324866A
公开(公告)日:2024-07-12
申请号:CN202410757234.4
申请日:2024-06-13
IPC: C07K7/08 , A61K38/10 , A61P31/04 , A23L3/3526
Abstract: 本发明属于肽类抑制剂技术领域,具体涉及一种海洋来源的抗菌肽FD031及其应用。一种海洋来源的抗菌肽FD031,其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明提供一种来自海洋宏基因组中挖掘并鉴定的抗菌肽FD031,该抗菌肽能够在512μM时抑制枯草芽孢杆菌或者金黄色葡萄球菌的生长、在1024μM时抑制大肠杆菌的生长,在食品、医药领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN118262790A
公开(公告)日:2024-06-28
申请号:CN202211682642.5
申请日:2022-12-27
Applicant: 青岛华大基因研究院
Abstract: 本申请提供了共标签测序数据的序列比对方法和装置,包括:将共标签测序数据按照读长携带的标签拆分到指定个数的第一集合中;将每个第一集合包含的所有读长分别比对到参考基因组中,根据得到的每个第一集合包含的所有读长的初始比对信息,确定每个第一集合包含的每个标签下的唯一比对读长信息和多比对读长信息以及比对位置;根据每个第一集合包含的每个标签下的所有唯一比对读长信息的唯一比对位置,确定每个第一集合包含的每个标签对应的长片段区间;根据每个第一集合包含的每个标签对应的长片段区间,从每个第一集合包含的每个标签下的每个多比对读长信息的多比对位置中确定真实比对位置。本申请提高了解决多比对的效率。
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公开(公告)号:CN117286122A
公开(公告)日:2023-12-26
申请号:CN202310827236.1
申请日:2023-07-06
IPC: C12N9/18 , C12N15/55 , C02F3/34 , C02F101/34
Abstract: 本发明属于生物化学和酶工程技术领域,具体涉及一种深海来源的PET水解酶及其应用。一种深海来源的PET水解酶dsPETase07,其氨基酸序列如SEQ IDNo.1所示。本发明还提供了编码所述PET水解酶dsPETase07的基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明提供一种来自深海的宏基因组中挖掘并鉴定的PET水解酶dsPETase07,该酶能够在高盐或高温的环境下展现出对PET的高水解活性,在环保、催化领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN116904422A
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202310827188.6
申请日:2023-07-06
Abstract: 本发明属于生物化学和酶工程技术领域,具体涉及一种深海来源的PET水解酶及其应用。一种深海来源的PET水解酶dsPETase01,其氨基酸序列如SEQ IDNo.1所示。本发明还提供了编码所述PET水解酶dsPETase01的基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明提供一种来自深海的宏基因组中挖掘并鉴定的PET水解酶dsPETase01,该酶能够在高盐或高温的环境下展现出对PET的高水解活性,在环保、催化领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN116790554A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310823722.6
申请日:2023-07-06
Abstract: 本发明属于生物化学和酶工程技术领域,具体涉及一种深海来源的PET水解酶及其应用。一种深海来源的PET水解酶dsPETase06,其氨基酸序列如SEQ IDNo.1所示。本发明还提供了编码所述PET水解酶dsPETase06的基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明提供一种来自深海的宏基因组中挖掘并鉴定的PET水解酶dsPETase06,该酶能够在高盐或高温的环境下展现出对PET的高水解活性,在环保、催化领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN112133371A
公开(公告)日:2020-12-25
申请号:CN201910555693.3
申请日:2019-06-25
Applicant: 深圳华大生命科学研究院 , 青岛华大基因研究院
Abstract: 一种基于单管长片段测序数据进行骨架组装的方法和装置,该方法包括:获取stLFR测序数据,其包括条形码信息和读长对信息;对stLFR测序数据进行预组装处理,获得种子重叠群;利用条形码信息,确定种子重叠群之间的相对顺序;利用条形码信息,确定近邻种子重叠群之间不同取向的权重;利用读长对信息,将未进行组装的重叠群进行挂载;利用条形码信息和读长对信息特征估计重叠群之间的相对间距大小;输出最终组装得到的骨架序列。本发明引入了stLFR数据所包含的长程信息,即利用来自同一条长片段的读长带有相同条形码信息以及来自同一个短片段的读长对信息来综合判断重叠群的排序和取向及它们之间的间距大小,以连接重叠群得到比较理想的骨架长度。
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公开(公告)号:CN118324873B
公开(公告)日:2024-08-20
申请号:CN202410756884.7
申请日:2024-06-13
Abstract: 本发明属于肽类抑制剂技术领域,具体涉及一种海洋来源的抗菌肽FD087及其应用。一种海洋来源的抗菌肽FD087,其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明提供一种来自海洋宏基因组中挖掘并鉴定的抗菌肽FD087,该抗菌肽能够在4μM时抑制枯草芽孢杆菌或者金黄色葡萄球菌的生长,能够在16μM时抑制大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌或者创伤弧菌的生长,在食品、医药领域都有重要意义。
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公开(公告)号:CN118324866B
公开(公告)日:2024-08-13
申请号:CN202410757234.4
申请日:2024-06-13
IPC: C07K7/08 , A61K38/10 , A61P31/04 , A23L3/3526
Abstract: 本发明属于肽类抑制剂技术领域,具体涉及一种海洋来源的抗菌肽FD031及其应用。一种海洋来源的抗菌肽FD031,其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明提供一种来自海洋宏基因组中挖掘并鉴定的抗菌肽FD031,该抗菌肽能够在512μM时抑制枯草芽孢杆菌或者金黄色葡萄球菌的生长、在1024μM时抑制大肠杆菌的生长,在食品、医药领域都有重要意义。
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