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公开(公告)号：CN1661102A
公开(公告)日：2005-08-31
申请号：CN200410093095.2
申请日：2004-12-16
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法。本发明中双链DNA序列作为输入分子，由限制性内切酶对DNA进行切割，露出粘性末端，与状态转移分子通过碱基配对相结合并发生连接。由于状态转移分子仍然含有限制性内切酶的识别位点，连接后的DNA分子继续新一轮的切割和连接循环并使作为输入分子的DNA序列逐渐变短，作为输入分子的DNA序列逐渐变短，输入分子的长度变化反映了DNA序列的信息，该长度变化是可阅读的，通过设计状态转移分子的结构可以实现输入分子的长度递减的速度为每次1个碱基。本发明有效地避免单链DNA分子高级结构引起的测序困难，克服现有技术中单链模板二级结构影响测序的不足，并在此基础上降低成本，具有很大的应用前景。
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公开(公告)号：CN1657615A
公开(公告)日：2005-08-24
申请号：CN200510023458.X
申请日：2005-01-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/00
Abstract: 本发明公开一组用于DNA芯片计算的寡核苷酸序列。该组序列中每条序列的长度为12碱基，满足以下约束条件，生成22条母序列：每条序列G+C含量均为50％；任一序列A与任一其他序列B之间比对得分不超过4，其中：A、B不同；任一序列A与任一序列B的完全互补序列之间的比对得分不超过4，其中：A、B不同，或者A、B相同；应用于光导原位合成法制作芯片，或者应用于点样法制作芯片。这些序列杂交稳定性好，无错配，杂交信号强，可用于计算多种NP问题，具有通用性。
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公开(公告)号：CN1654957A
公开(公告)日：2005-08-17
申请号：CN200510024102.8
申请日：2005-02-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种用于精神分裂症诊断的血浆特异性蛋白获取方法及应用，利用双向凝胶电泳的方法分离待测个体血浆蛋白质，从双向凝胶电泳图谱上得到α珠蛋白、α1抗胰蛋白酶、α1巨球蛋白、血清淀粉样蛋白P组份、抗纤维蛋白酶III和维生素D结合蛋白的表达量，并将此六个特异性蛋白的表达量作为判断被测个体是否患精神分裂症的参考依据。本发明利用分子标记客观地诊断精神分裂症，而不依赖于医生对诊断对象的主观判断。由于血浆具有取材方便，无创伤性，并可连续检测的优点，因此本发明使诊断具有极大的临床应用的可能。本发明同时可用于评价治疗精神分裂症药物的疗效，指导药物开发。
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公开(公告)号：CN1557827A
公开(公告)日：2004-12-29
申请号：CN03141984.4
申请日：2003-07-31
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种与精神分裂症相关的基因及其多态性位点及其应用，属于生物基因领域。本发明具有SEQ ID No.1所示的核酸序列和具有SEQ ID No.2所示的核酸序列。位于6q25.3－26区域T－复合物蛋白－1基因上的常见型单核苷酸多态性位点rs15982的C等位位点，即在其DNA互补链上为G等位位点，是产生精神分裂症的一个危险等位位点。位于6q25.3－26区域的T－复合物蛋白－1基因单核苷酸多态性位点rs15982的C等位位点，即在其DNA互补链上为G等位位点，前后2000bp区域内的多态性位点及其所组合的各类单倍体型进行诊断、治疗、药物靶点和一切商业性的开发利用。本发明揭示了T－复合物蛋白－1基因与精神分裂症相关性，找到了T－复合物蛋白－1(其编码基因位于6q25.3－26)的浓度在精神分裂症患者大脑中出现升高的分子基础。
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公开(公告)号：CN116356007A
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202111631404.7
申请日：2021-12-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , G01N33/68 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种先天性心脏病相关TAF6基因新发变异位点及其应用；所述基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述新发变异位点位于第8034位，rs1430659861为C→T和第8595位，rs1457450946为G→A。本发明涉及一种检测前述核苷酸变异的方法，包括如下步骤：步骤一，收集三口家系样品，并对前述序列潜在新发变异位点进行分型；步骤二，采用Sanger测序方法，分析位于第8034和8595位的遗传变异情况。本发明为研究TAF6基因新发变异与先天性心脏病的关系奠定了基础，为预测罹患先天性心脏病风险提供分子靶标，同时也为基于该基因的先天性心脏病早期筛查提供理论依据。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109554460B
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN201811545154.3
申请日：2018-12-17
Applicant: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学 , 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6881 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开的一种基于HLA基因多态性位点的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：A(H7N9)患者和健康对照标本的收集步骤；HLA候选位点的初筛步骤；HLA高风险位点的验证确认步骤。本发明还公开了一种基于HLA基因多态性位点预测H7N9易感人群的用途，其特征在于，所述多态性位点包括HLA‑A*02:06和/或HLA‑DRB1*12:02。本发明采用多重PCR靶基因捕获联合高通量二代测序的技术，对A(H7N9)禽流感患者和健康对照HLA区域的基因多态性进行检测分析。运用其他研究的大样本健康对照中进行验证，增强了小样本群体基因组研究结果的可靠性，提高了筛选出的基因位点和疾病关联的有效性。
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公开(公告)号：CN110656165A
公开(公告)日：2020-01-07
申请号：CN201910858799.0
申请日：2019-09-11
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于确定氯吡格雷用药疗效相关的基因SNP检测试剂盒，所述试剂盒包括MassARRAY芯片、检测基因P2Y12基因的rs16863356,rs7634096和rs12497330 3个SNP位点各三条引物分别称为正向引物，反向引物以及延伸引物，其序列依次分别如SEQ ID No.1～9，其中引物是用于鉴别氯吡格雷药效和不良反应相关基因的多态性位点。本发明的试剂盒可对上述三个位点进行高通量检测，具有灵敏度高、特异性高、检测结果稳定、可靠性高等优点；同时，适用于临床疾病突变检测，药物基因组学分析、法医学鉴定等基因分析领域。
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公开(公告)号：CN110484619A
公开(公告)日：2019-11-22
申请号：CN201910859345.5
申请日：2019-09-11
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用rs11249454检测氯吡格雷药效试剂盒，所述试剂盒包括MassARRAY芯片、检测基因UGT2A1 rs11249454 SNP位点各三条引物分别称为正向引物，反向引物以及延伸引物，其序列分别如SEQ ID No.1～3，其中引物是用于鉴别氯吡格雷药效和不良反应相关基因的多态性位点。本发明的试剂盒可对上述六个位点进行高通量检测，具有灵敏度高、特异性高、检测结果稳定、可靠性高等优点；同时，适用于临床疾病突变检测，药物基因组学分析、法医学鉴定等基因分析领域。
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公开(公告)号：CN108753809A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810573421.1
申请日：2018-06-06
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C12N15/74 , C12N9/1029 , C12N9/16 , C12P7/40 , C12P7/6418 , C12Y301/02
Abstract: 本发明公开了一种高效表达脂肪酸的重组蓝藻及其制备方法，涉及脂肪酸生产领域。通过构建提高蓝藻脂肪酸表达量的质粒并转化获得重组蓝藻，该重组蓝藻过表达前脂蛋白二脂酰转移酶Lgt和硫酯酶AcTesA。前脂蛋白二脂酰转移酶Lgt是一种支架蛋白，在蓝藻膜导向序列的作用下定位于细胞膜。硫酯酶AcTesA通过柔性肽FL3与支架蛋白Lgt相连，硫酯酶蛋白AcTesA具有低底物特异性，可以水解C8－C16的酰基ACP，能获得种类丰富的脂肪酸产物。本发明通过支架蛋白Lgt将硫酯酶蛋白AcTesA的固定在细胞膜上，加快了蓝藻细胞中脂肪酸合成速度，降低了细胞中的ROS含量，最终提高了转基因突变株分泌至细胞外的脂肪酸产量。
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公开(公告)号：CN106446585A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610920620.6
申请日：2016-10-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明首次提供了一种通过不良反应报告系统挖掘药物的新用途的方法，具体地，本发明提供了一种利用不良反应报告系统挖掘已知药物的新适应症的方法，上述方法通过预测在不良反应报告系统已被报道过的药物和疾病之间的关系，并且给出似然衡量，从而能够判断该药物被用于治疗该疾病的可能性。本发明中的预测算法可适用于大部分已知药物和已知人类疾病，不受药物种类和用途的限制。该方法对加速药物开发，降低药物开发成本有非常良好的应用前景。
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