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公开(公告)号：CN118915849A
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202410998802.X
申请日：2024-07-24
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种温度平衡控制方法及装置、系统，涉及生物检验温控领域。本发明提供的温度平衡控制方法，通过两条控制通道的当前温度和下一时刻的估计温度，计算两条控制通道的当前温度误差及下一时刻的估计误差，根据温度误差，确定任一通道的误差修正量；将误差修正量分配至对应的控制通道进行修正，以控制调整两条控制通道的加热功率，使两条控制通道的加热温度平衡，提高对样本块加热过程的同步性，从而保证多个调温元件在实现快速变温过程中，温度一致性平衡，维持有效的核酸扩增效率。
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公开(公告)号：CN117089605B
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202311061603.8
申请日：2023-08-22
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，先通过splintR DNA连接酶连接分别与野生型RNA和突变型RNA完全匹配的两条锁式探针，形成DNA环状模板，再通过含有两套FQ探针的RCA反应进行实时荧光信号检测。此方法将FQ探针和RCA技术结合，实现了对RCA反应中突变位点的实时检测，并结合了splintR DNA连接酶能够以RNA为夹板高效连接DNA的特性，以及两套锁式探针相互竞争减少非特异性连接的方法，可以直接以RNA为靶标进行SNP基因分型检测，无需逆转录成cDNA。
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公开(公告)号：CN112950571B
公开(公告)日：2024-02-13
申请号：CN202110214864.3
申请日：2021-02-25
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G06T7/00 , G06V10/26 , G06V10/764 , H05K7/20
Abstract: 本发明提供一种阴阳性分类模型建立方法、装置，设备及存储介质，应用于散热效率低于预设值的dPCR系统，方法包括：针对单次dPCR扩增反应，分别选取第一数量的阴性样本和阳性样本；分别选取第二数量的阴性样本和阳性样本作为训练样本乱序输入预设SVM训练模型，求取满足预设要求的第一超平面模型；分别将第三数量的阴性样本和阳性样本作为测试样本，依次输入所述第一超平面模型，当输出的测试样本的类别的正确率达到设定阈值时，确定所述第一超平面模型为dPCR系统的阴阳性分类模型；其中，所述第二数量与第三数量之和为第一数量，且第二数量和第三数量属于第一数量。本方案，分类准确率高，可有效保证dPCR定量的准确性，且dPCR扩增过程可被追踪。
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公开(公告)号：CN111088144B
公开(公告)日：2024-01-30
申请号：CN201911379948.1
申请日：2019-12-27
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/00 , C12M1/34 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供单分子DNA荧光信号检测系统，包括阵列芯片与光学检测结构；阵列芯片上阵列若干阵列微孔与集成若干发光件，所述光学检测结构采集所述荧光信号并将其转换成数字信号以实现单分子DNA检测。本发明还涉及一种阵列微孔的检测方法。本发明通过将发光件集成到微孔阵列当中，避免采用零模波导照明的方式，增加激发光的利用率，提高荧光激发效率，增强荧光信号，同时相比于现有的底部为透明材料的零模波导的盲孔结构，减少光信号通过光学元件的损耗，提高荧光信号检测识别的准确率；同时避免零模波导孔的尺寸限制，可应用更高通量的测序微孔阵列芯片，实现单分子荧光测序。
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公开(公告)号：CN116625999B
公开(公告)日：2023-11-28
申请号：CN202310558188.0
申请日：2023-05-17
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G01N21/64 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开一种评估零模波导孔有效载样的方法，包括：制备酶‑引物‑模板三元复合物；将三元复合物和芯片绑定；对芯片进行荧光淬灭，找到具有单个荧光的孔；对芯片进行荧光累积，找到荧光能够持续累积的孔；确定荧光淬灭阶段具有单个荧光，且荧光累积阶段荧光能够持续累积的孔为有效载样孔。本发明还公开了上述方法的应用。本发明构建了一种评估零模波导孔有效载样的方法，使用一种简单的酶‑引物‑模板三元复合物作为研究模型，利用荧光淬灭和荧光累积的过程进行双重判定，有利于更精准地筛选出单分子实时测序的有效载样孔。同时，还能够用于整个测序体系的优化，通过调整来优化有效载样
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111235004B
公开(公告)日：2023-11-07
申请号：CN202010054692.3
申请日：2020-01-17
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种基因测序芯片的制备方法，包括以下步骤：S1，将半导体激光光源和光波导层集成在同一基底，以易于半导体激光光源出射光与光波导层耦合、传输及用于零模波导外延纳米孔结构阵列荧光分子的激发；S2，在基底表面的光波导层的上方制备纳米尺度环形模板，以方便后续将纳米孔外延凸出于光波导层；S3，采用自组装技术自下而上在纳米尺度环形模板上制备外延凸出于纳米尺度环形模板的外延纳米孔结构阵列，以获得陡直度可控的自组装纳米孔阵列，用于基因测序中单分子荧光激发及检测；S4，对外延纳米孔阵列进行后处理，实现外延纳米孔尺度的调整及表面性质的改进；其纳米孔制作工艺相对简单，信噪比更高且光耦合效率高。
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公开(公告)号：CN111088331B
公开(公告)日：2023-04-14
申请号：CN201911294267.5
申请日：2019-12-16
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于压电声波传感器的单分子测序方法，包括以下步骤：S1.在压电声波传感器表面修饰DNA聚合酶；S2.DNA模板单链小片段驱动进样；S3.基于质量放大原理在核苷酸磷酸链的活性端修饰磁珠；S4.修饰好的核苷酸进样；S5.在声波传感器微孔另一侧施加磁场；S6.传感器表面进行洗脱：S7.测试声波传感器的频率信号f1；S8.采用DNA聚合酶切除核苷酸磷酸链的活性端修饰的磁珠：S9.测试声波传感器的频率信号f2；计算f1与f2的差值，确定DNA模板单链的碱基种类；S10.清洗流道；重复上述步骤S3‑S10,对微孔中的DNA模板单链进行连续测序；其提高了检测灵敏度，降低了测序成本。
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公开(公告)号：CN115946271A
公开(公告)日：2023-04-11
申请号：CN202211580738.0
申请日：2022-12-09
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明提供一种集成微流控芯片制备装置，包括基座、微流道模具、固定件和进出口模具，基座上设有模具放置槽，微流道模具一侧设有微流道成型部且凸出所述微流道模具表面，所述微流道模具设于所述模具放置槽内，且所述微流道成型部凸出所述基座表面，固定件设于所述基座开设所述模具放置槽的一侧上，所述固定件内部设有与所述模具放置槽同轴设置的预聚物放置槽，所述预聚物放置槽尺寸大于或等于所述模具放置槽，进出口模具设于所述固定件远离所述基座一侧，所述进出口模具朝向所述固定件一侧设置有进出口成型部，能够实现微流道的宽度将低于20微米，甚至低于10微米，且能实现一体化成型不同尺度、不同分布状态的微流道和储液池等功能单元。
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公开(公告)号：CN110490836B
公开(公告)日：2023-03-24
申请号：CN201910600118.0
申请日：2019-07-04
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明属于生物芯片技术领域，具体涉及一种dPCR微阵列图像信息处理方法。本发明提供的dPCR微阵列图像信息处理方法，包括先输入三个通道的dPCR微阵列图像：通道1图像、通道2图像、通道3图像，并对其中的通道2图像、通道3图像进行图像配准，再分别依次对通道1图像、经图像配准的通道2图像、经图像配准的通道3图像进行中值滤波、对比度增强、均值滤波处理，然后进行图像融合、去除光照不均匀影响、二值化修正处理，提取样点中心点坐标，选取每个样点的ROI区域，得到每个样点的信号结果。该方法以一种寻址定位方法，代替传统的网格化步骤，能够对非垂直正交排列的微阵列图像做准确、自动的样点信息提取和分析。
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公开(公告)号：CN115290617A
公开(公告)日：2022-11-04
申请号：CN202210930973.X
申请日：2022-08-04
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 苏州国科芯感医疗科技有限公司
IPC: G01N21/64 , C12M1/34 , C12Q1/6869
Abstract: 一种区分测序荧光光谱的集成光学器件及其制备方法，其中，区分测序荧光光谱的集成光学器件包括：衬底层，所述衬底层包括检测区；位于所述衬底层的检测区上的光栅结构，所述光栅结构包括若干个光栅区，每个光栅区中具有栅开口；位于所述光栅结构背离所述衬底层一侧的波导结构；位于检测区的波导结构背离所述光栅结构一侧的阵列孔膜层，所述阵列孔膜层中具有若干纳米孔；所述光栅区的栅开口位于所述纳米孔的底部，所述光栅区与所述纳米孔一一对应。所述集成光学器件的集成度高且成本低。
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