-
公开(公告)号:CN118136111A
公开(公告)日:2024-06-04
申请号:CN202311784042.4
申请日:2023-12-22
申请人: 深圳吉因加医学检验实验室 , 苏州吉因加医学检验有限公司 , 上海吉因加医学检验实验室有限公司
摘要: 本公开涉及基因组序列比对方法及其装置。本公开的方法包括将正向序列数据的CG位点中的胞嘧啶转换成胸腺嘧啶,将反向序列数据的CG位点中的鸟嘌呤转换成腺嘌呤的步骤,以对基因组和待测样本的基因组进行比对的步骤。
-
公开(公告)号:CN117265143A
公开(公告)日:2023-12-22
申请号:CN202311131633.1
申请日:2023-09-04
申请人: 深圳吉因加医学检验实验室 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/70 , C12N15/11 , C12R1/93 , C12R1/22 , C12R1/46 , C12R1/35 , C12R1/01 , C12R1/725 , C12R1/645
摘要: 本发明公开了一种病原微生物检测的探针组、方法及其应用,所述探针组特异性检测样本中的病原微生物。尤其在中枢神经系统感染疾病领域,克服了常规中枢神经系统感染病原检测的缺陷:病原靶向富集克服传统检测手段周期长,阳性率低的缺陷;克服mNGS宿主占比高、微生物载量低,敏感性低的缺陷;靶向富集克服中枢神经系统感染本身病原载量低和部分胞内菌难检的感染情况。极大提高病原检测灵敏度和特异性,具有重要的临床应用价值。
-
公开(公告)号:CN117144002A
公开(公告)日:2023-12-01
申请号:CN202310890251.0
申请日:2023-07-19
申请人: 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B25/20
摘要: 本发明的目的在于提供一种用于MRD检测的个性化探针组的设计方法及其应用。应用本发明的设计方法获得的个性化探针组在MRD检测中根据受试者的肿瘤组织样本中检出的突变进行定制,能够全面反应每位受试者个体的突变图谱,具有更高的检测灵敏度;除此之外,本发明的个性化探针组的设计方法所定制的个性化探针组的定制成功率为100%,探针捕获效率和均一性优异。
-
公开(公告)号:CN116497088A
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202310465445.6
申请日:2023-04-26
申请人: 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室 , 长沙吉因加生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12P19/34 , C40B50/06 , C40B40/06 , C12Q1/6869
摘要: 一种夹板核酸分子及其试剂盒,夹板核酸分子的长度≥27nt。所述夹板核酸分子包括5’端片段以及3’端片段,所述5’端片段用于与变性后的单链文库5’末端序列形成第一互补区,所述3’端片段用于与变性后的单链文库3’末端序列形成第二互补区,且第一互补区的长度与第二互补区长度相同。本发明可以显著提高环化效率,并提高数据产出量。
-
公开(公告)号:CN114464252B
公开(公告)日:2023-06-27
申请号:CN202210093787.5
申请日:2022-01-26
申请人: 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号: G16B20/20
摘要: 一种检测结构变异的方法及装置,检测结构变异的方法包括:计算步骤,包括计算待测样本测序文库的最大插入片段长度;信号提取步骤,包括从待测样本的测序数据中提取SU信号、DP信号、SR信号;信号处理步骤,包括对SR信号、SU信号、DP信号进行处理,获得结构变异信息。本发明通过对三种信号的提取及处理,可支持肿瘤基因组结构变异的检测。
-
公开(公告)号:CN110739027B
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN201911013897.0
申请日:2019-10-23
申请人: 深圳吉因加医学检验实验室 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 长沙吉因加医学检验实验室有限公司
摘要: 本发明涉及一种基于染色质区域覆盖深度的癌症组织定位方法及系统,所述定位方法包括:根据不同癌种cfDNA数据、健康人的cfDNA数据以及组织特异开放染色质区域OCHROdb数据库,构建不同癌种组织定位模型;计算待检测cfDNA的各个组织特异开放染色质区域的均一化校正覆盖深度,并通过所述各癌种组织定位模型进行机器学习预测分析,获得不同癌种组织定位模型的分值,根据分值定位患癌组织。本发明的定位方法及系统,不会对人体造成辐射性伤害,同时建库测序成本低,操作和分析流程简便,避免制备样本时人为引入误差,确保定位结果准确。
-
公开(公告)号:CN115410649B
公开(公告)日:2023-03-28
申请号:CN202211211793.2
申请日:2022-09-30
申请人: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
摘要: 一种同时检测甲基化和突变信息的方法及装置,该方法包括:甲基化检测步骤,包括将模板链分为XM模板链、F1R2模板链、F2R1模板链,如果XM模板链存在错配,则预测为突变,如果F2R1模板链存在C到T的错配,则预测为突变,如果F1R2模板链存在G到A的错配,则预测为突变;XM模板链和F1R2模板链的G到A突变,以及F2R1模板链的C到T突变用于校正甲基化中由于突变导致的误差;突变统计步骤,包括使用F1R2的甲基化频率或者F2R1的甲基化频率校正突变的频率,获得校正后的突变频率。本发明通过在突变检测之间进行甲基化检测,使得甲基化和突变检测的结果更加精确,并能实现一次检测获得多组学数据的目标。
-
公开(公告)号:CN115346608A
公开(公告)日:2022-11-15
申请号:CN202210743555.X
申请日:2022-06-27
申请人: 北京吉因加科技有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
摘要: 一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置,该方法包括:获取基因组数据步骤,包括从数据库获取选定的病原生物的基因组数据;同源区域屏蔽步骤,包括对基因组数据进行质粒同源区域屏蔽、宿主源同源区域屏蔽,获得屏蔽同源区域后的基因组数据;融合基因组构建步骤,包括对屏蔽同源区域序列后的基因组数据中的各个基因组构建融合基因组;组库步骤,包括重复所述获取基因组数据步骤、同源区域屏蔽步骤、融合基因组构建步骤,遍历所选定的所有病原生物的基因组数据,汇总所有融合基因组,得到病原生物基因组数据库。该方法构建的数据库具有准确度高,分析时间短的优点。
-
公开(公告)号:CN115083529A
公开(公告)日:2022-09-20
申请号:CN202210811098.3
申请日:2022-07-11
申请人: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
摘要: 一种检测样本污染率的方法及装置,该方法包括:位点MAF提取步骤,包括提取待测样本的测序数据中的位点在数据库中的MAF;过滤步骤,包括过滤去除不符合条件的SNP位点;错误率计算步骤,包括计算不同碱基替换的错误率;似然值计算步骤,包括计算待测样本在不同污染率下的似然值;候选污染率计算步骤,包括根据每个SNP位点计算的似然值对数与位点深度计算加权平均值,选择加权平均值最大的似然值对应的污染率为候选污染率;优化步骤,包括根据优化函数优化候选污染率,获得最终的样本污染率。该方法的分析结果可信度高。
-
公开(公告)号:CN113862333B
公开(公告)日:2022-08-05
申请号:CN202111145775.4
申请日:2021-09-28
申请人: 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号: C12Q1/6806
摘要: 本发明提供一种组合物及其氧化5‑甲基胞嘧啶的方法,所述组合物含有如下组分:缓冲剂、金属盐、α‑酮戊二酸盐、抗坏血酸、三磷酸腺苷、二硫苏糖醇,所述组合物的pH为4.3~7.5。本发明通过重新设计组合物的pH,使得5‑甲基胞嘧啶转化为T(胸腺嘧啶)的转化率提高,可用于氧化5‑甲基胞嘧啶,检测DNA样本中5‑甲基胞嘧啶残基的存在和位置。
-
-
-
-
-
-
-
-
-