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公开(公告)号：CN114621307A
公开(公告)日：2022-06-14
申请号：CN202210383346.9
申请日：2022-04-12
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明涉及一种寡核苷酸空间坐标编码方法及其微流控装置，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种寡核苷酸空间坐标编码方法，预设需编码的寡核苷酸全序列为由n+i段寡核苷酸序列片段连接而成，并根据此预设，合成n组不同寡核苷酸序列片段X以及i组不同寡核苷酸序列片段Y；设置由X流道和Y流道正交设置而成的寡核苷酸合成阵列，使得X流道和Y流道的交汇处形成供寡核苷酸序列片段连接的编码区域；逐轮对寡核苷酸合成阵列的每一个X流道和Y流道分别施加寡核苷酸序列片段X和寡核苷酸序列片段Y，使得寡核苷酸序列片段X和寡核苷酸序列片段Y在编码区域逐步连接，得到需编码的寡核苷酸全序列。所述方法大大降低了寡核苷酸的合成成本。
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公开(公告)号：CN113109900B
公开(公告)日：2022-06-07
申请号：CN202110274336.7
申请日：2021-03-15
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明提供一种集成零模波导芯片及其制备方法，集成零模波导芯片包括：衬底层，衬底层包括检测区和与检测区邻接的第一传输区；位于衬底层的检测区和第一传输区上的波导结构；位于检测区的波导结构上的阵列孔膜层，阵列孔膜层中具有若干纳米孔。集成零模波导芯片具有较高的集成度和较低的对准精度要求。
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公开(公告)号：CN111123429B
公开(公告)日：2022-03-08
申请号：CN201911350416.5
申请日：2019-12-24
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G02B6/10 , G02B6/13 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供一种涂覆有锚定物质的零模波导孔的制备方法，该方法通过调节高折射率非反射层的沉积厚度可以缩小零模波导孔的孔内体积，显著减少孔内的游离核苷酸，提高信噪比；通过在孔内部沉积高折射率非反射层材料可以使被激发荧光的位置远离零模波导孔的金属壁，使荧光不会减弱甚至淬灭，荧光效果增强的同时也使得检测更加灵敏；选取设定的高折射率非反射层材料以及沉积厚度(即控制孔内样本与非反射壁的折射率)可以在增强荧光与保证酶活性之间获得最佳平衡；通过使用掩模版和正胶的光刻可以使每个零模波导孔中心底部精确的连接DNA聚合酶，提升孔的利用率。本发明还涉及一种涂覆有锚定物质的零模波导孔结构。
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公开(公告)号：CN113109900A
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN202110274336.7
申请日：2021-03-15
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明提供一种集成零模波导芯片及其制备方法，集成零模波导芯片包括：衬底层，衬底层包括检测区和与检测区邻接的第一传输区；位于衬底层的检测区和第一传输区上的波导结构；位于检测区的波导结构上的阵列孔膜层，阵列孔膜层中具有若干纳米孔。集成零模波导芯片具有较高的集成度和较低的对准精度要求。
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公开(公告)号：CN112950571A
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN202110214864.3
申请日：2021-02-25
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明提供一种阴阳性分类模型建立方法、装置，设备及存储介质，应用于散热效率低于预设值的dPCR系统，方法包括：针对单次dPCR扩增反应，分别选取第一数量的阴性样本和阳性样本；分别选取第二数量的阴性样本和阳性样本作为训练样本乱序输入预设SVM训练模型，求取满足预设要求的第一超平面模型；分别将第三数量的阴性样本和阳性样本作为测试样本，依次输入所述第一超平面模型，当输出的测试样本的类别的正确率达到设定阈值时，确定所述第一超平面模型为dPCR系统的阴阳性分类模型；其中，所述第二数量与第三数量之和为第一数量，且第二数量和第三数量属于第一数量。本方案，分类准确率高，可有效保证dPCR定量的准确性，且dPCR扩增过程可被追踪。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107164538B
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN201710560138.0
申请日：2017-07-11
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种检测CALR基因突变的内参扩增引物组合物，其包括SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：6所示序列的引物；本发明还涉及一种含有上述内参扩增引物组合物的内参扩增体系及其试剂盒和检测方法，以及由上述内参扩增引物组合物扩增的CALR基因突变的靶序列，该靶序列为SEQ ID NO：7所示序列。本发明所述的内参扩增体系及其检测方法与CALR基因的突变体系配套使用，其既可以对突变型的CALR基因进行快速检测，也可以对野生型的CALR基因进行扩增，作为CALR突变检测试剂盒的内参质控体系，在质量控制的提升方面具有重要意义。
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公开(公告)号：CN107991385B
公开(公告)日：2020-05-22
申请号：CN201711212535.5
申请日：2017-11-28
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 苏州国科芯感医疗科技有限公司
IPC: G01N29/036
Abstract: 本发明公开了一种确定凝血时间的方法及装置，其中所述方法包括：在待测血样被加入凝血试剂时，实时获取Lamb波传感器输出信号的频率，其中所述待测血样放置在所述Lamb波传感器的叉指电极一侧表面；判断实时获取的相邻的两个Lamb波频率之间的差值是否小于预定值；当实时获取的相邻的两个Lamb波频率之间的差值小于预定值时，获取所经过的时间，将所经过的时间作为凝血时间。本发明创造性地采用Lamb波传感器检测凝血时间，其检测结果不易受光照等环境因素的影响，检测结果较为准确；由于Lamb波传感器较为小巧，并且无需增加辅助的检测环境维持装置(例如现有技术中用于遮挡环境光线的屏障)，因此整个凝血时间检测装置也可以较为小巧，便于携带和收纳。
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公开(公告)号：CN111088331A
公开(公告)日：2020-05-01
申请号：CN201911294267.5
申请日：2019-12-16
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于压电声波传感器的单分子测序方法，包括以下步骤：S1.在压电声波传感器表面修饰DNA聚合酶；S2.DNA模板单链小片段驱动进样；S3.基于质量放大原理在核苷酸磷酸链的活性端修饰磁珠；S4.修饰好的核苷酸进样；S5.在声波传感器微孔另一侧施加磁场；S6.传感器表面进行洗脱：S7.测试声波传感器的频率信号f1；S8.采用DNA聚合酶切除核苷酸磷酸链的活性端修饰的磁珠：S9.测试声波传感器的频率信号f2；计算f1与f2的差值，确定DNA模板单链的碱基种类；S10.清洗流道；重复上述步骤S3-S10,对微孔中的DNA模板单链进行连续测序；其提高了检测灵敏度，降低了测序成本。
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公开(公告)号：CN111088144A
公开(公告)日：2020-05-01
申请号：CN201911379948.1
申请日：2019-12-27
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/00 , C12M1/34 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供单分子DNA荧光信号检测系统，包括阵列芯片与光学检测结构；阵列芯片上阵列若干阵列微孔与集成若干发光件，所述光学检测结构采集所述荧光信号并将其转换成数字信号以实现单分子DNA检测。本发明还涉及一种阵列微孔的检测方法。本发明通过将发光件集成到微孔阵列当中，避免采用零模波导照明的方式，增加激发光的利用率，提高荧光激发效率，增强荧光信号，同时相比于现有的底部为透明材料的零模波导的盲孔结构，减少光信号通过光学元件的损耗，提高荧光信号检测识别的准确率；同时避免零模波导孔的尺寸限制，可应用更高通量的测序微孔阵列芯片，实现单分子荧光测序。
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公开(公告)号：CN110951580A
公开(公告)日：2020-04-03
申请号：CN201910932615.0
申请日：2019-09-29
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/00 , C12M1/38 , C12M1/34 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种高通量单细胞转录组与基因突变整合分析一体化装置，包括高通量单细胞编码芯片和整合分析装置；所述整合分析装置包括壳体以及设置在所述壳体内的温控热循环模块、荧光成像模块和数据存储分析模块，所述荧光成像模块包括光源组件、显微物镜、荧光分光组件和成像探测器。本发明通过设计具有微孔空间坐标、细胞核酸标签和分子核酸标签的三重编码功能的高通量单细胞编码芯片，可将单细胞的基因突变、转录组和蛋白表达信息一一对应起来；再通过温控热循环模块可实现PCR扩增，通过荧光成像模块采集样品的荧光图像，通过数据存储分析模块对荧光图像进行存储于分析，能实现单细胞转录组与基因突变整合分析。
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