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公开(公告)号:CN107164538B
公开(公告)日:2021-03-02
申请号:CN201710560138.0
申请日:2017-07-11
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种检测CALR基因突变的内参扩增引物组合物,其包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:6所示序列的引物;本发明还涉及一种含有上述内参扩增引物组合物的内参扩增体系及其试剂盒和检测方法,以及由上述内参扩增引物组合物扩增的CALR基因突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:7所示序列。本发明所述的内参扩增体系及其检测方法与CALR基因的突变体系配套使用,其既可以对突变型的CALR基因进行快速检测,也可以对野生型的CALR基因进行扩增,作为CALR突变检测试剂盒的内参质控体系,在质量控制的提升方面具有重要意义。
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公开(公告)号:CN107338289A
公开(公告)日:2017-11-10
申请号:CN201710471433.9
申请日:2017-06-20
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 上海速创诊断产品有限公司
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q2531/119 , C12Q2525/307 , C12Q2527/125 , C12Q2527/101 , C12Q2521/101
Abstract: 本发明公开了一种锁核酸修饰的LAMP引物组合物,在该LAMP引物组合物中,锁核酸的修饰位置为FIP引物和BIP引物3’端最外侧的3个碱基中的至少一个;本发明还涉及一种含有上述LAMP引物组合物的LAMP反应体系,该体系还包括甲酰胺和热启动酶;本发明还涉及一种采用上述LAMP引物组合物的扩增方法,其扩增温度为58℃-72℃。本发明针对LAMP的非特异性扩增问题,采用上述技术方案,在小幅提高扩增效率的同时,大幅降低非特异性扩增,显著提高了LAMP反应体系的稳定性和特异性,此对于LAMP技术的进一步完善和临床应用的推广具有重要意义。
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公开(公告)号:CN107164538A
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201710560138.0
申请日:2017-07-11
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2600/166 , C12Q2531/119 , C12Q2545/101
Abstract: 本发明涉及一种检测CALR基因突变的内参扩增引物组合物,其包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:6所示序列的引物;本发明还涉及一种含有上述内参扩增引物组合物的内参扩增体系及其试剂盒和检测方法,以及由上述内参扩增引物组合物扩增的CALR基因突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:7所示序列。本发明所述的内参扩增体系及其检测方法与CALR基因的突变体系配套使用,其既可以对突变型的CALR基因进行快速检测,也可以对野生型的CALR基因进行扩增,作为CALR突变检测试剂盒的内参质控体系,在质量控制的提升方面具有重要意义。
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公开(公告)号:CN119785747A
公开(公告)日:2025-04-08
申请号:CN202411904839.8
申请日:2024-12-23
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: G10K11/172 , G10K11/16
Abstract: 本发明涉及声子晶体设计技术领域,公开了一种声子晶体结构及其设计方法。设计方法包括:设置声子晶体单元第一截面尺寸和目标厚度尺寸,声子晶体单元包括固态散射体和基体;设置散射体的第二截面尺寸的预设范围,在预设范围内选取多个不同的第二截面尺寸;获取不同的第二截面尺寸对应的色散关系曲线图,得到多个完全带隙,比较多个完全带隙的宽度得到目标完全带隙;根据目标完全带隙得到散射体的目标截面尺寸;将多个声子晶体单元进行阵列排布形成声子晶体结构。本发明从声子晶体结构的声子晶体单元出发,提供基于材料和边界尺寸确定,散射体的截面尺寸为变量的声子晶体单元的设计流程,得到最佳带隙特征的声子晶体单元及声子晶体结构。
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公开(公告)号:CN119372290A
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202411985384.7
申请日:2024-12-31
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种基于共价有机框架材料的甲基化DNA序列检测系统、其检测方法及应用,该检测系统包括共价有机框架纳米探针、DNA样本处理单元和检测单元,检测过程无需依赖复合材料,制备流程简便。本发明采用含三苯胺结构的有机小分子为单体原料,通过席夫碱反应制备得到共价有机框架纳米探针,通过DNA样本处理单元对DNA进行亚硫酸氢盐处理、不对称PCR及荧光标记形成待检DNA,再利用检测单元测量待检DNA序列与共价有机框架纳米探针结合体的荧光,从而实现对DNA序列的甲基化检测。本系统可以高效、便捷地实现对甲基化DNA序列的检测,操作流程简单、易于实现。
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公开(公告)号:CN112410204B
公开(公告)日:2024-05-07
申请号:CN202011380258.0
申请日:2020-11-30
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
Abstract: 本发明提供了一种全自动核酸检测系统。包括样本前处理单元,用于将待检测样本转移到核酸提取孔板上;至少一个核酸提取单元,用于提取所述核酸提取孔板上待检测样本中的核酸;至少一个体系配制单元,用于将核酸扩增试剂与来自所述核酸提取单元的核酸混合;至少一个核酸检测单元,用于对来自所述体系配制单元的核酸进行核酸扩增与检测;耗材准备单元,用于向所述样本前处理单元、所述核酸提取单元和所述体系配置单元提供耗材;样本后处理单元,用于接收所述核酸提取单元和所述核酸检测单元产生的医疗垃圾;多个传递单元,用于隔离或顺通所述传递单元与其他单元及物料传递。由于覆盖了核酸检测的各个环节,避免了对人员造成的危害和提升效率。
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公开(公告)号:CN117089605A
公开(公告)日:2023-11-21
申请号:CN202311061603.8
申请日:2023-08-22
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法,属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法,先通过splintR DNA连接酶连接分别与野生型RNA和突变型RNA完全匹配的两条锁式探针,形成DNA环状模板,再通过含有两套FQ探针的RCA反应进行实时荧光信号检测。此方法将FQ探针和RCA技术结合,实现了对RCA反应中突变位点的实时检测,并结合了splintR DNA连接酶能够以RNA为夹板高效连接DNA的特性,以及两套锁式探针相互竞争减少非特异性连接的方法,可以直接以RNA为靶标进行SNP基因分型检测,无需逆转录成cDNA。
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公开(公告)号:CN112175785B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN201910588093.7
申请日:2019-07-03
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12M1/00 , C12M1/42 , C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种双通道等温扩增装置及方法,该装置包括:自下而上依次设置的第一基板、第一离子选择性电极、第二基板、第二离子选择性电极和第三基板;第一电信号引出连接件、第二电信号引出连接件、电信号采集电路板以及处理器。通过采用离子选择性电极采集样本的电信号对等温扩增技术的扩增结果进行检测,可以准确、快速地对扩增结果进行判定;通过设置双通道进行等温扩增,可以同时对两个样本进行检测,且可以通过将一个样本设置成空白对比样,便于与另一个样本进行对比,减少检测结果的误判;并且离子选择性电极小巧,制作工艺简单,成本低,从而双通道等温扩增装置也较为小巧,便于携带和收纳,扩增结果的检测成本也很低。
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公开(公告)号:CN114908145A
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN202210404980.6
申请日:2022-04-18
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 苏州国科芯感医疗科技有限公司
IPC: C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及一种二维多重的检测基因突变的方法,属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种二维多重的检测基因突变的方法,同时使用Blocker引物、ARMS引物和探针对待测样本进行qPCR,其中,Blocker引物以野生型为靶标,ARMS引物以突变型为靶标,包括上游引物和下游引物,上游引物和下游引物的5’端连接有尾巴序列,Blocker引物与上游引物在3’端有6~14个碱基的重复。所述方法的引物设计使得Blocker引物与野生型模板优先结合从而阻断ARMS引物与野生型模板的结合,抑制野生型等位基因的扩增,而ARMS引物与突变型模板结合从而通过qPCR富集突变型等位基因,提高对突变位点的检测灵敏度。
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公开(公告)号:CN111088250B
公开(公告)日:2022-03-08
申请号:CN201911358593.8
申请日:2019-12-25
Applicant: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种mRNA捕获序列,包括通用引物、稀有酶切位点、细胞标签、随机分子标签和PolyT序列,通过引入稀有酶切位点序列,为后续测序接头连接提供了粘性末端,使cDNA双链两端接上两个不同的测序接头。本发明还提供了一种用于mRNA捕获的捕获载体的合成方法及一种高通量单细胞测序文库制备方法。本发明提供的捕获载体通过在基底材料上原位合成引入稀有酶切位点序列的mRNA捕获序列,采用本发明提供的捕获载体来进行单细胞测序文库的制备,提高单细胞捕获效率以及寡核苷酸标签的标记效率,简化构建文库的流程,并且制得的cDNA双链两端接上两个不同的测序接头,保证一个哑铃型测序文库只组装一条引物及DNA聚合酶,三者的一一对应是保证单分子实时测序的前提。
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