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公开(公告)号:CN106434887A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201610767557.7
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在金黄色葡萄球菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN103571964A
公开(公告)日:2014-02-12
申请号:CN201310594531.3
申请日:2013-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6851 , C12Q2531/113 , C12Q2545/113 , C12Q2537/16
Abstract: 本发明公开了一种基于RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR策略的基因表达校准值的检测方法,包括:选定外参基因;配制外参基因的RNA与DNA的预混合液;样品中加入预混合液,收集样品RNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测待测基因和内参基因RNA拷贝数、内参基因DNA拷贝数以及外参基因RNA和DNA拷贝数,计算得到内参基因的表观表达水平后,再根据公式得到待测基因的表达校准值。本发明还公开了上述方法在PCR array以及表达谱芯片检测分析技术中的应用。本发明将基因的表观表达水平概念和检测方法与传统表达检测体系相结合,以更少的检测反应、更低廉的成本实现更精确的基因表达水平检测,修正由内参基因真实表达水平在不同样本间不恒定所造成的检测结果的不准确。
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公开(公告)号:CN101441686B
公开(公告)日:2011-01-12
申请号:CN200810203402.6
申请日:2008-11-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种将自然语言书写的医疗文档自动进行格式化和统一化的装置包括:基于国内医院所使用的电子病历系统的以自然语言编写的医疗文档;以疾病类型为分类的中文医疗标准词词库;基于自然语言分析的数据抽提系统,用于将自然语言编写的文档转化为标准的格式化文档;按病种分类的用于临床科研的数据库;用于将格式化文档自动转化为统一格式的标准化文档的文档转换系统;用于保护患者以及相关治疗医生的隐私信息的权限系统。本发明实现了医疗信息管理的自动化,方便医生快速得查找到某种疾病的有关信息,节省了大量时间,使得医生有更多精力投入到对疾病的研究。
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公开(公告)号:CN101441686A
公开(公告)日:2009-05-27
申请号:CN200810203402.6
申请日:2008-11-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种将自然语言书写的医疗文档自动进行格式化和统一化的装置包括:基于国内医院所使用的电子病历系统的以自然语言编写的医疗文档;以疾病类型为分类的中文医疗标准词词库;基于自然语言分析的数据抽提系统,用于将自然语言编写的文档转化为标准的格式化文档;按病种分类的用于临床科研的数据库;用于将格式化文档自动转化为统一格式的标准化文档的文档转换系统;用于保护患者以及相关治疗医生的隐私信息的权限系统。本发明实现了医疗信息管理的自动化,方便医生快速得查找到某种疾病的有关信息,节省了大量时间,使得医生有更多精力投入到对疾病的研究。
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公开(公告)号:CN101441682A
公开(公告)日:2009-05-27
申请号:CN200710170732.5
申请日:2007-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明提供了一种中药药效物质机理的生物信息分析平台及其分析方法,包括中药活性成分及含量数据库模块,INVDOCK软件包模块和网络数据库模块,网络数据库模块包括人类蛋白相互作用数据库、代谢数据库、和信号转导数据库、治疗性药靶数据库、药物副作用靶点数据库和药物吸收分布代谢排出数据库,还提供了一种采用该生物信息分析平台分析中药药效物质机理的方法,该生物信息分析平台能全面分析中药药效物质的药理机制,具有准确、高效的特点,为中药药理研究提供指导,可以大大加快中药药理研究,加速开发新型中药。
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公开(公告)号:CN115261493A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202110486075.5
申请日:2021-04-30
Applicant: 上海旺旺食品集团有限公司 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种检测阪崎克罗诺杆菌的方法及其应用。所述方法包括:识别阪崎克罗诺杆菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列;针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物;设计特定的Tm值计算公式计算反应变性及退火温度,并据此设置核酸扩增反应条件;在模板局部解链的条件下进行核酸扩增反应。本发明靶向传统核酸扩增方法通常需要规避的富含AT碱基的序列,极大地拓宽候选靶标区域;通过基于海量基因组数据的特异性排查,以及针对富含AT区域的Tm值的精确计算,实现双链DNA的局部解链,降低核酸扩增技术中非特异性扩增的可能性。该方法有效拓展传统核酸扩增技术的应用范围,同时在引物设计通量、反应特异性等显著提升反应性能。
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公开(公告)号:CN111088377A
公开(公告)日:2020-05-01
申请号:CN202010018178.4
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/14 , C12N15/11 , C12R1/445
Abstract: 本发明公开了一种针对金黄色葡萄球菌的快速恒温检测方法、引物组及应用。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在金黄色葡萄球菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106434887B
公开(公告)日:2020-02-21
申请号:CN201610767557.7
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/14 , C12N15/11 , C12R1/445
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在金黄色葡萄球菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106367499B
公开(公告)日:2020-02-21
申请号:CN201610780407.X
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12Q1/04 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测创伤弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在创伤弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN106367493B
公开(公告)日:2020-02-18
申请号:CN201610767608.6
申请日:2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测沙门氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是否为阳性,确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性,检测时间短,结果判定简单,操作便捷,成本低,具广泛应用前景。
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