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公开(公告)号：CN106407988B
公开(公告)日：2019-11-26
申请号：CN201610802612.1
申请日：2016-09-05
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于电镜序列切片图像的突触检测方法。其涉及模式识别和神经学领域，具体地，该方法包括对电镜序列切片图像进行拼接对准；接着针对拼接对准后的单层电镜序列切片图像，利用Adaboost算法进行突触检测；然后基于突触特征进行突触识别，最后利用上下文线索进行突触过滤，并基于突触过滤的结果，进行突触的三维重构。通过本发明实现了高效、精准的突触检测。
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公开(公告)号：CN110328712A
公开(公告)日：2019-10-15
申请号：CN201910578456.9
申请日：2019-06-28
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: B26D7/26 , B26D7/32 , G01N23/2202
Abstract: 本发明实施例涉及生物组织切片制备技术领域，具体涉及一种刀刃位置切换方法、装置及包括该装置的超薄切片机，解决了切割刀刀刃位置切换时引起的序列不连续、中间切片信息丢失等问题。本发明实施例第一方面公开的刀刃位置切换方法包括步骤：切割完第N1片切片后，当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向第一次步进；所述第一次步进后，切割完M1、…Mn片切片后，当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向步进，直到所有的步进量之和不小于切片宽度本发明的有益效果为：保证切片质量，使得切片的序列连续，避免中间切片信息丢失。
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公开(公告)号：CN109584368A
公开(公告)日：2019-04-05
申请号：CN201811213305.5
申请日：2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种生物样品三维结构的构建方法及装置，所述方法包括，获取至少两个生物样品薄片的三维图像；修正所述薄片的三维图像表面生成三维图像块；将所述三维图像块拆分为二维序列图像，并根据所述至少两个生物样品薄片的位置排列所述二维序列图像；计算所述二维序列图像的图像变形位置坐标，确定所述生物样品的三维结构。本发明能够有效处理序列薄片的不规则形变和表面不平整，并将序列薄片的三维图像在三维空间中联接起来，实现对大体量生物样品的高分辨率整体三维结构构建。
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公开(公告)号：CN107976458A
公开(公告)日：2018-05-01
申请号：CN201710936186.5
申请日：2017-10-10
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: G01N23/203
Abstract: 本发明涉及一种低能量背散射电子探测器，该探测器包括半导体探测基底和设置在所述基底表面的覆膜，所述覆膜的材料为：铍、碳或石墨烯，或者这三种材料的任意组合。所述覆膜的厚度≤10nm。所述低能量背散射电子探测器包括第一内圈部分和第二外圈部分，所述第一内圈部分为环形，所述第二外圈部分包括绕所述第一内圈部分均匀地周向设置的多个子部分，操作时对各个部分探测的信号进行加和处理可得到样品的成分信息，作差处理可得到样品在连接各部分探测器方向上的形貌信息；多个部分可以独立工作或协同工作，可以分别得到样品的成分像或形貌像。本发明不但具有较强的电子穿透能力，且具有较好的探测效率。
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公开(公告)号：CN107958442A
公开(公告)日：2018-04-24
申请号：CN201711287182.5
申请日：2017-12-07
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及图像拼接领域，具体涉及一种多幅显微图像拼接中的灰度校正方法及装置，目的在于解决图像拼接中的灰度不连续情况。本发明提出的灰度校正方法及装置，先从配准后的图像中选取种子图像，再根据种子图像的位置信息和灰度信息，采用增益补偿方法对图像进行粗调，采用直方图规范化的方法对图像进行细调，尽可能地达到图像与图像之间的灰度一致。然后，采用泊松图像编辑法进行图像融合，消除拼接痕迹。该灰度校正方法流程以种子图像为灰度校正的起点，减少了传统方法的误差累计和传递。由整体到局部，一步步完善校正的效果，灰度校正结果较为鲁棒，保证了切片显微图像灰度校正结果的质量。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107545567A
公开(公告)日：2018-01-05
申请号：CN201710638426.3
申请日：2017-07-31
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及图像处理和神经科学领域，具体涉及一种生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置。旨在解决无法在生物组织相邻切片显微图像间寻找到真实可靠的对应点信息的问题。为此目的，本发明中提出了一种生物组织序列切片显微图像的配准方法，包括：获取生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点；调整所获取的各对应点的位置；依据调整后的各对应点的位置，对生物组织序列切片显微图像进行图像形变。通过本发明可以找到相邻切片显微图像之间真实可靠的对应点信息，从而保证了生物组织序列切片显微图像配准的精度。
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公开(公告)号：CN116973599A
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN202310870148.X
申请日：2023-07-14
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供一种面向序列切片电镜图像的超薄切片厚度估计方法及装置，涉及计算机视觉技术领域，该方法包括：获取序列切片的电镜图像；针对任意两个相邻切片的电镜图像，对任意两个相邻切片的电镜图像进行全局对齐；将全局对齐后的任意两个相邻切片的电镜图像输入第一神经网络模型，得到任意两个相邻切片的电镜图像之间的形变场；提取形变场的形变数据特征；将形变数据特征输入第二神经网络模型，得到任意两个相邻切片所对应的厚度估计结果；其中，第一神经网络模型是基于样本相邻切片的电镜图像，以及用于对图像施加形变场的空间变换网络训练得到的；第二神经网络模型是基于带有厚度标签的样本形变数据特征训练得到的。
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公开(公告)号：CN116364523A
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202310570557.8
申请日：2023-05-19
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及脑科学设备技术领域，尤其涉及一种离子栅结构装置，旨在解决离子轰击对生物组织样片的压实问题。本发明包括等离子体限制桶、栅网、样片台、栅网偏置电源和样片偏置电源；等离子体限制桶内设置有等离子体区，等离子体从等离子体区经栅网出射到样片台；栅网偏置电源一端接地，另一端与栅网连接；样片偏置电源一端与栅网偏置电源连接，另一端与样片台连接。本发明通过设置栅网偏置电源和样片偏置电源对离子出射速度进行调节，以降低离子能量，进而消除生物组织样片处理过程的表面压实效应。
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公开(公告)号：CN112381817B
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN202011374986.0
申请日：2020-11-30
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于电镜显微成像和图像处理领域，具体涉及一种扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统、方法、装置，旨在解决现有基于透射电镜的病毒检测操作复杂、成像效率以及检测准确率低的问题。本系统包括样品获取模块，配置为获取待检测的病毒标本，并将其滴在带有支持膜的铜网上；扫描电镜成像模块，配置为得到扫描电镜透射图像；像素位置获取模块，配置为获取各病毒颗粒以及其对应的铜网方格的顶点在图像中的像素位置；变换矩阵计算模块，配置为计算从图像像素位置映射到透射电镜物理坐标的透射变换矩阵；形态结构检测模块，配置为得到每个病毒颗粒的形态结构。本发明简化了检测操作，并提高了成像效率以及检测的准确率。
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公开(公告)号：CN109283679B
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN201811213274.3
申请日：2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种大视场光学显微图像成像装置及方法，两个光学显微成像通路分别用于获取成像物体和参照标板的光学显微图像，利用第二成像通路获取的参照标板的光学显微图像计算对应位置的第一成像通路获取成像物体的光学显微图像的像素坐标，合成所述成像物体的大视场显微图像；能够形成鲁棒的大视场光学显微图像的快速成像能力，其成像结果的正确性和实时性不受成像物体表面形貌特征和所选择的成像模态影响，满足生命科学等领域对不同模态下物体的大视场快速光学显微成像需求。
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