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公开(公告)号:CN105020471A
公开(公告)日:2015-11-04
申请号:CN201510385896.4
申请日:2015-06-30
Applicant: 东南大学
CPC classification number: F16K99/0023 , B01L3/00 , F16K2099/0073 , F16K2099/0086
Abstract: 本发明公开了一种用于微控芯片的单向球阀,包括进样系统、微腔、第一分叉流道、第二分叉流道以及通用芯片区,所述进样系统连接微腔,微腔的另一端连接第一分叉流道和第二分叉流道,后两者向前延伸重新聚合后与通用芯片区连接。本发明还提供了所述单向球阀的制备方法。相对于现有技术,本发明实现了原位合成与移除球阀阀芯的便捷操作,增加了微流控芯片配件的便携性和可操作性;且能满足“即时检测”的要求,拓展了微流控芯片的使用范围。
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公开(公告)号:CN103586093B
公开(公告)日:2015-07-01
申请号:CN201310571537.9
申请日:2013-11-13
Applicant: 东南大学
IPC: B01L3/00
Abstract: 本发明公开了一种微流控芯片,包括基片、包裹层、隔离层和流道,基片1上设置有牺牲层,牺牲层上设置有贯通牺牲层并深入基片内部的沟道,牺牲层上覆盖包裹层,沟道内设置有隔离层,隔离层将牺牲层划分成不同的区域,基片和/或包裹层上设置有连通外界和牺牲层的通道,牺牲层被腐蚀或溶解后得到流道。本发明还公开了上述微流控芯片的制作方法。本发明的微流控芯片,容易制作,成品率高,成本低廉、对基片表面的平整度要求低。通过在基片上设置有牺牲层,方便通过控制牺牲层的厚度控制流道的深度,通过在牺牲层上生成沟道,并在沟道中设置隔离层,隔离层将牺牲层隔离成不同区域,方便产生形状可控的复杂流道。
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公开(公告)号:CN104388546A
公开(公告)日:2015-03-04
申请号:CN201410599337.9
申请日:2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2565/1015 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种两轮信号耦合编码的DNA连接测序方法,该方法通过优化标记物的编码方式,从而实现在不增加标记物的前提下,利用简单的信号编码关系建立两轮信号之间的耦合关联,一轮测序反应中测定超过一位碱基信息,从而形成快速、准确、低成本和高通量的DNA序列测定方法。本发明方法通过对两轮测序信号的耦合,测定了3位碱基的信息,大大提高了测序速度,当连接效率一定时,测序读长增加了50%,同时测序成本也有一定幅度的降低,并且两轮测序信号之间形成了相互校验的作用,也有利于提升测序结果的准确性。
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公开(公告)号:CN104152568A
公开(公告)日:2014-11-19
申请号:CN201410410187.2
申请日:2014-08-19
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q2525/151 , C12Q2563/107 , C12Q2543/101
Abstract: 本发明提供了一种高效快捷的高通量STR序列核心重复数检测的方法,包括首先在已扩增到检测基片的STR序列簇上杂交一对检测引物,其中终引物上修饰荧光基团;随后利用核苷酸组合进行分步延伸,同时在每轮延伸后检测荧光信号,直至终引物上带荧光的碱基被聚合酶切除,信号消失为止;最终分析荧光信号的情况,得到相应的STR序列核心重复数。本发明采用通用的生物化学试剂,广泛适用于生物芯片及高通量测序等检测平台,且信噪比很高,明显提高了STR检测的准确性和对杂合STR的分辨率,同时其高通量特性使得该方法可以通过检测更多STR基因座得到更加确信的结果以及检测更多样本实现快速的群体STR检测。
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公开(公告)号:CN103586093A
公开(公告)日:2014-02-19
申请号:CN201310571537.9
申请日:2013-11-13
Applicant: 东南大学
IPC: B01L3/00
Abstract: 本发明公开了一种微流控芯片,包括基片、包裹层、隔离层和流道,基片1上设置有牺牲层,牺牲层上设置有贯通牺牲层并深入基片内部的沟道,牺牲层上覆盖包裹层,沟道内设置有隔离层,隔离层将牺牲层划分成不同的区域,基片和/或包裹层上设置有连通外界和牺牲层的通道,牺牲层被腐蚀或溶解后得到流道。本发明还公开了上述微流控芯片的制作方法。本发明的微流控芯片,容易制作,成品率高,成本低廉、对基片表面的平整度要求低。通过在基片上设置有牺牲层,方便通过控制牺牲层的厚度控制流道的深度,通过在牺牲层上生成沟道,并在沟道中设置隔离层,隔离层将牺牲层隔离成不同区域,方便产生形状可控的复杂流道。
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公开(公告)号:CN101565746B
公开(公告)日:2012-08-08
申请号:CN200910026891.7
申请日:2009-06-03
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明带奇偶校验的信号组合编码的DNA连接测序方法涉及一种信号组合编码的DNA测序方法,属于生物技术领域。本发明的特征在于向信号组合编码的连接测序的编码中增加了奇偶校验,有效地对检测获得的编码结果进行奇偶校验,并成功分辨全空信号与未发生连接反应两种情况,提高测序的准确率。本发明在信号组合编码标记物外增加一种奇偶校验标记物,利用奇偶校验标记物“有信号”和“无信号”两种状态与所获得的编码标记物状态的“有信号”的标记物的种类进行奇偶校验,校验成功后通过不同编码标记物在被检测时多个标记物“有信号”、“无信号”的排列组合进行信号组合编码的连接DNA测序反应,在不降低测序通量的基础上提高测序反应的准确率。
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公开(公告)号:CN1932033A
公开(公告)日:2007-03-21
申请号:CN200610096372.4
申请日:2006-09-22
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 基于核酸微阵列芯片的核酸测序方法是一种进行特定物种的基因组测序、基因转录和表达谱的检测、以及各种基因组DNA修饰谱的检测,将不同待测序的DNA片段分别固定到一块固体基片上,形成核酸微阵列,并使每个DNA片段都含有相同的公共序列作为测序引物的互补序列。将公共测序引物与芯片杂交后,利用Sanger末端终止法,通过微流控装置将某一种核苷酸混合溶液按一定比例的荧光标记ddNTP和dNTP,注入到上述的DNA片段微阵列芯片上进行在片碱基终止反应,每延伸终止一次后立即扫描一次荧光信号,得到芯片上不同样品点碱基延伸信息。最后利用图像处理软件将每张测序图进行叠加,得出每个样品点上固定的核酸片段完整的序列信息。
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公开(公告)号:CN118813766A
公开(公告)日:2024-10-22
申请号:CN202410791247.3
申请日:2024-06-19
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明提出了一种基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法,采用全分隔或半分隔反应体系的方法,提高嵌合序列组成片段间的同源性。利用具有链置换能力的核酸聚合酶介导的多重链置换扩增过程中产生扩增产物,将扩增产物的测序结果与参考基因组比对,获得组成片段高度同源的嵌合序列,利用嵌合序列的组成片段间的基因连锁关系,本发明嵌合序列的组成片段具有高度同源性,且组成片段之间的座落距离可提供更多的长距离连锁关系。基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法,只使用具有链置换能力的DNA聚合酶介导的多重链置换扩增后的测序数据来进行全基因组单倍型组装,在经济效益和组装效果上,可以达到很好的平衡。
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公开(公告)号:CN113533275A
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN202110740248.1
申请日:2021-06-30
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种固态纳米孔‑荧光共振能量转移复合检测方法,该方法用成对的荧光基团同时标记的分析物分子,采用共聚焦显微镜聚焦于纳米孔所在的平面,分析物在电场的驱动下通过纳米孔,同时也通过共聚焦显微镜的焦平面,当发生荧光共振能量转移,激发光信号被共聚焦显微镜捕捉并转换为电信号经计算机处理,结合分析物分子通过纳米孔的电信号,从而复合解析分子构象信息。本发明还公开了一种固态纳米孔‑荧光共振能量转移复合检测系统。本发明系统和检测方法能够更有效地进一步区分生物分子内部或生物分子之间细微构象差异,适用于多种分析物单独检测和不同的分析物混合检测。
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公开(公告)号:CN113151427A
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN202110544290.6
申请日:2021-05-19
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6818
Abstract: 本发明公开了一种核苷非标记FRET的核酸测序方法,该方法包括将FRET供体和受体荧光基团标记在DNA聚合酶或接头上,待测核酸分子固定之后与DNA聚合酶孵育结合,继续循环依次投入四种测序反应体系参与待测核酸互补链的合成,通过碱基合成时供体‑受体分子对之间空间距离变化带来FRET信号改变确定合成进行,并与投入的dNTP种类结合,得出该次反应对应碱基类型,通过多次反应得到的碱基类型的排列确定核酸序列的组成。本发明方法对样品的核酸浓度和总量要求低,适合于实验室快速检测,dNTP非标记的策略会带来更高的测序准确率,可以测量单分子水平、单克隆分子簇和单分子多拷贝等多种情形下的FRET信号。
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