公开(公告)号：CN107058291B

公开(公告)日：2020-08-25

申请号：CN201710304056.X

申请日：2017-05-03

Applicant: 东南大学

Inventor： 涂景 ,  陆祖宏 ,  李俊吉 ,  鲁娜 ,  乔祎

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明提出了一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法，其特征在于将多重链置换扩增反应体系注入细长型的反应腔中，完成对目标基因组的全基因组扩增。细长形的反应腔体将多重链置换扩增反应体系相对分隔于一个细长的反应腔中，各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少，因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应，目标核酸各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时，基于细长反应腔的多重链置换扩增，不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔，并且在系统调试和扩增反应的过程中，不需要对微量液体进行精密和复杂的控制，简化了反应系统，降低了操作复杂度。

公开(公告)号：CN118813766A

公开(公告)日：2024-10-22

申请号：CN202410791247.3

申请日：2024-06-19

Applicant: 东南大学

Inventor： 涂景 ,  鲁娜 ,  乔祎 ,  陆祖宏

IPC: C12Q1/6844 ,  G16B20/30 ,  G16B30/20 ,  G16B25/20 ,  G16B20/10 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明提出了一种基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法，采用全分隔或半分隔反应体系的方法，提高嵌合序列组成片段间的同源性。利用具有链置换能力的核酸聚合酶介导的多重链置换扩增过程中产生扩增产物，将扩增产物的测序结果与参考基因组比对，获得组成片段高度同源的嵌合序列，利用嵌合序列的组成片段间的基因连锁关系，本发明嵌合序列的组成片段具有高度同源性，且组成片段之间的座落距离可提供更多的长距离连锁关系。基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法，只使用具有链置换能力的DNA聚合酶介导的多重链置换扩增后的测序数据来进行全基因组单倍型组装，在经济效益和组装效果上，可以达到很好的平衡。

公开(公告)号：CN107058291A

公开(公告)日：2017-08-18

申请号：CN201710304056.X

申请日：2017-05-03

Applicant: 东南大学

Inventor： 涂景 ,  陆祖宏 ,  李俊吉 ,  鲁娜 ,  乔祎

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明提出了一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法，其特征在于将多重链置换扩增反应体系注入细长型的反应腔中，完成对目标基因组的全基因组扩增。细长形的反应腔体将多重链置换扩增反应体系相对分隔于一个细长的反应腔中，各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少，因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应，目标核酸各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时，基于细长反应腔的多重链置换扩增，不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔，并且在系统调试和扩增反应的过程中，不需要对微量液体进行精密和复杂的控制，简化了反应系统，降低了操作复杂度。