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公开(公告)号:CN117971121A
公开(公告)日:2024-05-03
申请号:CN202410124886.4
申请日:2024-01-30
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于连续流动式PCR的DNA数据存储快速读取的方法,包括以下步骤:溶解固定了DNA存储序列的微球,加入与包含DNA片段所对应的引物和DNA扩增酶;加入连续流动式PCR装置进行PCR扩增,测序,得到原始数据;所述连续流动式PCR装置有2个加热模块,所述加热模块构成了解链恒温区、退火和延伸恒温区。基于连续流动式PCR的DNA存储数据快速准确读取新方法,具有操作简单、读取成本低、读取速度快、准确性高等优势,适用于DNA数据存储系统,在DNA数据存储及读取领域具有较高的应用潜力和价值。
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公开(公告)号:CN109307102B
公开(公告)日:2020-07-31
申请号:CN201811207202.8
申请日:2018-10-17
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种用于微流控芯片的微阀装置及其制备方法和应用,该装置包括盖片、弹性材料层和可变形装置层,弹性材料层位于盖片和可变形装置层中间,并且弹性材料层与盖片的中间设有独立的通液流道和空腔,空腔位于通液流道的两侧,弹性材料层能够在可变形装置层的挤压或者牵拉下进行弹性形变,从而控制通液流道的闭合和开启。本发明中的微阀结构易于制作,极大地降低了微流控芯片中阀结构的制作难度;同时该结构可以通过调整输入信号实时准确地改变阀的开合状态,从而精确控制微流控芯片中的流体运动。
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公开(公告)号:CN110706751A
公开(公告)日:2020-01-17
申请号:CN201910909594.0
申请日:2019-09-25
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种DNA存储加密编码方法,包括如下步骤:输入原始数据进行二进制转换,进行霍夫曼编码压缩,根据DNA存储四进制模型转换为DNA序列;选择作为密钥的文件进行二进制转换,再转换为DNA序列;采用密钥对存储序列加密;将存储序列划分为等长的若干列,每列列首添加地址码;采用RS编码对每一列纠错,解码过程为编码的反向过程,按照地址码拼接,然后删除地址码和纠错码;根据加密方法和密钥序列,对存储序列进行解密;进行霍夫曼解码,重新获得输入文件。本发明方法在DNA四进制模型的基础上进行加密,提高了存储保密性,获得了极高的编码潜力,能够更好地控制GC百分比,碱基G和C平均含量平衡,有利于合成,且错误率低。
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公开(公告)号:CN107727705B
公开(公告)日:2019-12-10
申请号:CN201710904967.6
申请日:2017-09-28
Applicant: 东南大学
IPC: G01N27/26
Abstract: 本发明公开了一种酶反应检测纳米孔电学传感器,包括从下到上依次层叠的基底、绝缘层以及中心设有纳米尺度孔的薄膜,其特征在于,在所述纳米尺度孔内通过化学修饰有DNA探针以及与DNA探针互补杂交的DNA四面体结构,在所述DNA四面体结构上通过生物素结合有辣根过氧化物酶标记的链霉亲和素,从而使单个辣根过氧化物酶固定在纳米孔内。通过加入反应底物,检测氧化反应产物易位事件,实现对酶反应的实时监测。本发明解决了当前酶反应检测的大量的试剂与时间消耗问题,同时本发明提供的纳米孔内酶固定方法能为后期在纳米孔内研究单个酶分子动力学提供研究思路。
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公开(公告)号:CN109439734A
公开(公告)日:2019-03-08
申请号:CN201811207218.9
申请日:2018-10-17
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种基于琼脂糖凝胶介质的全基因组扩增方法,包括将多重链置换扩增反应体系置于琼脂糖凝胶中,在凝胶的网格状结构中,完成对目标基因组的全基因组扩增。凝胶状态的琼脂糖形成网格状结构,将多重链置换扩增反应体系相对分隔于微小的反应空间中,各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少,因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应,目标核酸各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时,基于琼脂糖凝胶介质的多重链置换扩增,不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔,并且在系统调试和扩增反应的过程中,不需要对微量液体进行精密和复杂的控制,简化了反应系统,降低了操作复杂度。
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公开(公告)号:CN109439733A
公开(公告)日:2019-03-08
申请号:CN201811207205.1
申请日:2018-10-17
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,包括将RNA反转录扩增反应体系注入细长型的反应腔中,完成对目标RNA转录组的捕获和放大。细长形的反应腔体将RNA反转录反应体系相对分隔于一个细长的反应腔中,各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少,因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应,目标RNA各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时,基于细长反应腔的RNA转录组分析,不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔,并且在系统调试和扩增反应的过程中,不需要对微量液体进行精密和复杂的控制,简化了反应系统,降低了操作复杂度。
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公开(公告)号:CN109369973A
公开(公告)日:2019-02-22
申请号:CN201811220401.2
申请日:2018-10-19
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种促进珊瑚细胞粘附的自修复薄膜的制备方法,首先将双醛淀粉溶液滴入培养板中,将溶液全部吸出,使用超纯水清洗多次,再将壳聚糖和绿藻生长因子混合溶液滴入培养板中,将溶液全部吸出,使用超纯水清洗多次,得到单层所述促进珊瑚细胞粘附的自修复薄膜;反复多次重复步骤一和步骤二组装双醛淀粉,壳聚糖和绿藻生长因子,利用层层自组装法逐层将双醛淀粉溶液、壳聚糖和绿藻生长因子混合溶液沉积到培养板中,得到多层所述促进珊瑚细胞粘附的自修复薄膜。因此通过层层自组装方法制备的薄膜具有自修复性能和促进细胞粘附作用。本发明方法简单有效,操作简便,且所需时间较短。
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公开(公告)号:CN109307102A
公开(公告)日:2019-02-05
申请号:CN201811207202.8
申请日:2018-10-17
Applicant: 东南大学
CPC classification number: F16K99/0015 , B01L3/502738 , F16K99/0048 , F16K2099/0073
Abstract: 本发明公开了一种用于微流控芯片的微阀装置及其制备方法和应用,该装置包括盖片、弹性材料层和可变形装置层,弹性材料层位于盖片和可变形装置层中间,并且弹性材料层与盖片的中间设有独立的通液流道和空腔,空腔位于通液流道的两侧,弹性材料层能够在可变形装置层的挤压或者牵拉下进行弹性形变,从而控制通液流道的闭合和开启。本发明中的微阀结构易于制作,极大地降低了微流控芯片中阀结构的制作难度;同时该结构可以通过调整输入信号实时准确地改变阀的开合状态,从而精确控制微流控芯片中的流体运动。
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公开(公告)号:CN104388546B
公开(公告)日:2017-04-12
申请号:CN201410599337.9
申请日:2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种两轮信号耦合编码的DNA连接测序方法,该方法通过优化标记物的编码方式,从而实现在不增加标记物的前提下,利用简单的信号编码关系建立两轮信号之间的耦合关联,一轮测序反应中测定超过一位碱基信息,从而形成快速、准确、低成本和高通量的DNA序列测定方法。本发明方法通过对两轮测序信号的耦合,测定了3位碱基的信息,大大提高了测序速度,当连接效率一定时,测序读长增加了50%,同时测序成本也有一定幅度的降低,并且两轮测序信号之间形成了相互校验的作用,也有利于提升测序结果的准确性。
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公开(公告)号:CN103740808A
公开(公告)日:2014-04-23
申请号:CN201310563819.4
申请日:2013-11-14
Applicant: 东南大学
CPC classification number: C12Q1/6846 , C12Q2543/101 , C12Q2565/518 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种用于食品病原微生物鉴定的单个核酸分子检测技术,检测步骤如下:(1)提取病原微生物基因组和基因组片段化;(2)设计和制备探针;(3)探针与基因组DNA片段进行杂交反应;(4)探针与杂交体固定于丙烯酰胺胶中,电泳去除未杂交上去的片段和未胶连上去的分子;(5)核酸分子固相原位扩增;(6)信号检测,判断病原菌是否存在。本发明采用单个核苷酸分子捕获、扩增与检测技术,实现了原病微生物快速高效检测的目的,具有十分重要的应用前景和使用价值。本发明不仅可用于微生物鉴定,还可用于实验室、生产和临床中某些含量较低,且具有重要分析或诊断意义的分子的检测。
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